| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第15-30页 |
| 1.1 数量性状作图方法 | 第15-20页 |
| 1.1.1 连锁作图 | 第15-16页 |
| 1.1.2 关联作图 | 第16-18页 |
| 1.1.3 连锁作图与关联作图的整合-巢式关联作图 | 第18-20页 |
| 1.2 新一代分子标记-SNP标记及其检测方法 | 第20-22页 |
| 1.2.1 SNP标记的特点 | 第20页 |
| 1.2.2 基于基因芯片技术的SNP检测 | 第20-21页 |
| 1.2.3 基于二代测序技术的SNP检测 | 第21-22页 |
| 1.3 遗传连锁图谱的构建及群体特征分析 | 第22-24页 |
| 1.3.1 连锁图谱的构建 | 第22-23页 |
| 1.3.2 分子标记的偏分离分析 | 第23页 |
| 1.3.3 遗传重组的变异 | 第23-24页 |
| 1.3.4 上位性分析 | 第24页 |
| 1.4 玉米耐旱相关性状的QTL定位研究进展 | 第24-27页 |
| 1.4.1 玉米耐旱相关性状与鉴定 | 第24-25页 |
| 1.4.2 玉米耐旱性的遗传改良 | 第25-26页 |
| 1.4.3 玉米耐旱相关性状的QTL定位 | 第26-27页 |
| 1.5 本研究的意义和技术路线 | 第27-30页 |
| 1.5.1 研究的意义 | 第27页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第27-29页 |
| 1.5.3 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章：玉米高密度重组图谱构建与应用 | 第30-48页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-35页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第30-31页 |
| 2.1.2 田间试验与性状调查 | 第31页 |
| 2.1.3 DNA提取及基于低覆盖度测序的基因型鉴定 | 第31-33页 |
| 2.1.4 NAM群体奇异家系的鉴定 | 第33-34页 |
| 2.1.5 重组区块图谱的构建 | 第34页 |
| 2.1.6 表型数据的分析 | 第34页 |
| 2.1.7 QTL作图 | 第34-35页 |
| 2.2 结果与分析 | 第35-45页 |
| 2.2.1 基于GBS测序检测到的SNP信息 | 第35页 |
| 2.2.2 NAM群体奇异家系的鉴定 | 第35-36页 |
| 2.2.3 单个RIL群体及NAM群体的重组图谱构建 | 第36-38页 |
| 2.2.4 基于重组bin构建的连锁图谱的质量及精确性 | 第38-42页 |
| 2.2.5 不同NAM群体复合连锁图谱的比较 | 第42页 |
| 2.2.6 使用不同标记密度进行QTL作图的检测功效和分辨率 | 第42-43页 |
| 2.2.7 不同NAM群体整合进行QTL作图的检测功效和分辨率 | 第43-45页 |
| 2.3 讨论 | 第45-48页 |
| 2.3.1 基于简化基因组GBS测序进行群体基因型鉴定 | 第45页 |
| 2.3.2 基于测序构建重组图谱的优势 | 第45-46页 |
| 2.3.3 图谱密度和群体大小对QTL检测结果的影响 | 第46页 |
| 2.3.4 不同NAM群体整合在剖析复杂性状的遗传结构中的应用前景 | 第46-48页 |
| 第三章：玉米巢式关联作图群体的遗传特性分析 | 第48-57页 |
| 3.1 材料与方法 | 第48-49页 |
| 3.1.1 供试材料 | 第48页 |
| 3.1.2 DNA的提取和GBS测序 | 第48页 |
| 3.1.3 重组图谱的构建 | 第48页 |
| 3.1.4 遗传重组率的检测 | 第48页 |
| 3.1.5 偏分离的检测 | 第48页 |
| 3.1.6 上位性的检测 | 第48-49页 |
| 3.1.7 QTL等位基因效应的估计 | 第49页 |
| 3.2 结果与分析 | 第49-55页 |
| 3.2.1 重组事件数的分布及QTL作图 | 第49-50页 |
| 3.2.2 偏分离分析 | 第50-52页 |
| 3.2.3 偏分离与重组率和基因密度的关系 | 第52-53页 |
| 3.2.4 QTL等位基因效应的分布 | 第53-54页 |
| 3.2.5 适合度上位性分析 | 第54-55页 |
| 3.3 讨论 | 第55-57页 |
| 3.3.1 高密度分子标记鉴定偏分离 | 第55-56页 |
| 3.3.2 遗传重组及其在玉米育种中的应用 | 第56页 |
| 3.3.3 上位性的作用 | 第56-57页 |
| 第四章：两种水分处理下玉米耐旱相关性状的遗传解析 | 第57-78页 |
| 4.1 材料与方法 | 第57-59页 |
| 4.1.1 供试材料 | 第57页 |
| 4.1.2 田间试验与性状调查 | 第57页 |
| 4.1.3 DNA的提取和GBS测序 | 第57-58页 |
| 4.1.4 重组图谱的构建 | 第58页 |
| 4.1.5 表型数据的分析 | 第58页 |
| 4.1.6 QTL作图 | 第58页 |
| 4.1.7 QTL一因多效 | 第58页 |
| 4.1.8 全基因组关联作图 | 第58-59页 |
| 4.1.9 候选基因的鉴定 | 第59页 |
| 4.1.10 NAM群体的共同亲本在水旱环境下的转录组测序 | 第59页 |
| 4.1.11全基因组预测的交叉验证 | 第59页 |
| 4.2 结果与分析 | 第59-73页 |
| 4.2.1 表型统计分析 | 第59-62页 |
| 4.2.2 联合连锁分析 | 第62-64页 |
| 4.2.3 QTL一因多效 | 第64-66页 |
| 4.2.4 全基因组关联分析 | 第66-67页 |
| 4.2.5 候选基因的鉴定及验证 | 第67-72页 |
| 4.2.6 耐旱相关性状的全基因组预测 | 第72-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-78页 |
| 4.3.1 连锁-连锁不平衡的整合作图在耐旱性研究中的应用 | 第73页 |
| 4.3.2 与前人QTL定位研究的比较 | 第73-76页 |
| 4.3.3 耐旱性候选基因 | 第76-77页 |
| 4.3.4 耐旱性的全基因组预测及其在育种中的应用 | 第77-78页 |
| 第五章：全文结论 | 第78-80页 |
| 5.1 玉米高密度重组图谱构建与应用 | 第78页 |
| 5.2 玉米巢式关联作图群体的遗传特性分析 | 第78-79页 |
| 5.3 两种水分处理下玉米耐旱相关性状的遗传解析 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-94页 |
| 附录 | 第94-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 作者简历 | 第116页 |
