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基于高通量转录组测序与植物代谢组学技术研究远志皂苷生物合成途径

中文摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
第一章 引言第15-18页
    1.1 立题背景和意义第15-16页
    1.2 本课题的研究思路、技术流程图、研究内容及创新点第16-18页
        1.2.1 本课题研究思路、技术流程图和研究内容第16-17页
        1.2.2 本课题的主要创新点第17-18页
第二章 文献综述第18-35页
    2.1 远志研究概况第18-22页
        2.1.1 远志本草学研究第18-19页
        2.1.2 远志化学成分研究第19-21页
        2.1.3 远志药理活性研究第21-22页
    2.2 三萜皂苷的生物合成途径及相关酶基因的研究进展第22-25页
        2.2.1 IPP和DMAPP合成途径第23-24页
        2.2.2 2,3-氧化鲨烯生物合成途径第24页
        2.2.3 三萜皂苷环化和修饰第24-25页
    2.3 基于高通量测序转录组学技术研究第25-28页
        2.3.1 高通量测序技术产生及发展第25-26页
        2.3.2 基于高通量测序的转录组研究第26-28页
    2.4 qRT-PCR技术及在基因表达分析中的应用第28-32页
        2.4.1 实时荧光定量PCR原理第29-30页
        2.4.2 实时荧光定量PCR的应用第30-32页
    2.5 植物代谢组学研究应用第32-34页
        2.5.1 植物体内代谢产物变化的监测第32-33页
        2.5.2 “突变型”植物代谢产物研究第33页
        2.5.3 代谢组学在功能基因研究中的应用第33页
        2.5.4 代谢组学与其他“组学”技术的结合第33-34页
    2.6 结语第34-35页
第三章 基于高通量测序技术的远志转录组研究第35-47页
    3.1 引言第35页
    3.2 实验材料第35-37页
        3.2.1 植物样品第35-36页
        3.2.2 实验仪器第36页
        3.2.3 实验试剂第36-37页
    3.3 实验方法第37-40页
        3.3.1 总RNA的提取第37页
        3.3.2 总RNA的QC检验第37-38页
        3.3.3 mRNA纯化和片段化第38页
        3.3.4 1st Strand cDNA合成和2nd Strand cDNA合成第38页
        3.3.5 末端修复,3'端加A和连接接头第38-39页
        3.3.6 接头产物富集和PCR产物切胶纯化第39-40页
        3.3.7 混合文库上机测序第40页
        3.3.8 测序数据分析流程第40页
    3.4 实验结果与分析第40-45页
        3.4.1 总RNA质检结果第40-41页
        3.4.2 测序数据统计和组装统计第41-42页
        3.4.3 基因功能注释第42-43页
        3.4.4 COG功能分类注释第43-44页
        3.4.5 KEGG功能注释第44-45页
        3.4.6 GO注释分析第45页
        3.4.7 远志三萜皂苷合成途径分析第45页
    3.5 小结与讨论第45-47页
        3.5.1 远志转录组测序与功能注释第45-46页
        3.5.2 远志皂苷合成相关基因的发掘与分析第46-47页
第四章 不同部位、产地和年限远志的UPLC指纹图谱研究第47-53页
    4.1 引言第47页
    4.2 实验方法第47-48页
        4.2.1 植物样品第47-48页
        4.2.2 实验仪器及试剂第48页
    4.3 实验方法第48-49页
        4.3.1 UPLC样品制备第48页
        4.3.2 UPLC色谱条件第48页
        4.3.3 精密度、稳定性和重现性试验第48-49页
        4.3.4 数据分析第49页
    4.4 实验结果第49-51页
        4.4.1 UPLC色谱图分析第49-50页
        4.4.2 相似度评价第50-51页
        4.4.3 远志不同部位差异成分分析第51页
    4.5 小结与讨论第51-53页
第五章 基于UPLC/Q-TOF MS代谢组学技术的远志不同部位分析第53-63页
    5.1 引言第53-54页
    5.2 实验材料第54页
        5.2.1 植物样本第54页
        5.2.2 实验仪器及试剂第54页
    5.3 实验方法第54-55页
        5.3.1 样品制备第54页
        5.3.2 UPLC/Q-TOF MS条件第54-55页
        5.3.3 实验数据处理第55页
    5.4 实验结果第55-62页
        5.4.1 远志不同部位的UPLC色谱分析图及远志化合物结构鉴定第55-58页
        5.4.2 基于UPLC/Q-TOF MS的代谢组学分析第58-62页
    5.5 讨论与总结第62-63页
第六章 基于qRT-PCR技术的远志皂苷生物合成途径研究第63-79页
    6.1 引言第63-64页
    6.2 实验材料第64页
        6.2.1 植物样本第64页
        6.2.2 实验仪器及试剂第64页
    6.3 实验方法第64-66页
        6.3.1 远志总RNA的提取及检验第64页
        6.3.2 引物的设计第64-65页
        6.3.3 mRMA反转录cDNA第65页
        6.3.4 SYBR实时荧光定量PCR第65页
        6.3.5 数据分析第65-66页
    6.4 实验结果第66-74页
        6.4.1 RNA检验第66-67页
        6.4.2 酶基因引物数据统计第67-70页
        6.4.3 内参基因表达分析第70-71页
        6.4.4 三萜皂苷通路酶基因表达分析第71-72页
        6.4.5 远志皂苷的峰面积强度与基因表达相关系数分析第72-74页
    6.5 讨论与总结第74-79页
        6.5.1 筛选远志不同部位内参基因第74页
        6.5.2 远志皂苷生物合成途径分析第74-79页
第七章 总结与展望第79-82页
    7.1 研究工作总结第79-80页
    7.2 展望第80-81页
    7.3 学习心得第81-82页
参考文献第82-92页
已发表论文第92-93页
致谢第93-94页
个人简况及联系方式第94-95页
承诺书第95-96页

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