红尾沙蜥高原适应机制的转录组学研究
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 研究背景 | 第12-22页 |
| 1.1 动物对高海拔适应的研究进展 | 第12-18页 |
| 1.1.1 高海拔适应生理机制 | 第12-14页 |
| 1.1.2 高海拔适应的分子机制 | 第14-15页 |
| 1.1.3 高海拔适应的基因组学研究进展 | 第15-16页 |
| 1.1.4 高海拔适应的转录组学研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2 沙蜥属研究进展 | 第18-20页 |
| 1.2.1 沙蜥属 | 第18-19页 |
| 1.2.2 红尾沙蜥 | 第19-20页 |
| 1.2.3 贵德沙蜥 | 第20页 |
| 1.3 研究意义和科学问题 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-28页 |
| 2.1 转录组测序和组装 | 第22-23页 |
| 2.1.1 样品采集与RNA提取 | 第22页 |
| 2.1.2 数据质量控制 | 第22-23页 |
| 2.1.3 转录组组装 | 第23页 |
| 2.2 转录组注释 | 第23页 |
| 2.3 鉴定同源基因 | 第23-25页 |
| 2.4 构建系统发育树与评估分化时间 | 第25-26页 |
| 2.5 进化分析 | 第26-27页 |
| 2.5.1 快速进化基因的分析 | 第26页 |
| 2.5.2 正选择基因的鉴定 | 第26-27页 |
| 2.6 蛋白结构模拟 | 第27-28页 |
| 第三章 研究结果 | 第28-44页 |
| 3.1 转录组测序与组装 | 第28-29页 |
| 3.2 转录组注释 | 第29-32页 |
| 3.3 系统发育树与分化时间 | 第32-34页 |
| 3.4 进化分析 | 第34-44页 |
| 3.4.1 快速进化的GO | 第34-36页 |
| 3.4.2 正选择基因 | 第36-41页 |
| 3.4.3 正选择基因的蛋白结构模拟 | 第41-44页 |
| 第四章 讨论 | 第44-49页 |
| 4.0 红尾沙蜥和贵德转录组组装结果评估 | 第44-46页 |
| 4.1 红尾沙蜥高原适应机制 | 第46-47页 |
| 4.2 沙蜥与林蛙高原适应的趋同机制 | 第47-48页 |
| 4.3 总结和展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 在学期间的研究成果 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
