| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 引言 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第12-15页 |
| 1.2.1 微阵列实验最小信息集MIAME | 第12页 |
| 1.2.2 GEO数据源 | 第12-13页 |
| 1.2.3 ArrayExpress数据源 | 第13-14页 |
| 1.2.4 GEO Import | 第14-15页 |
| 1.3 研究内容和任务 | 第15-17页 |
| 1.3.1 本论文解决的关键问题 | 第15页 |
| 1.3.2 研究目标与任务 | 第15-16页 |
| 1.3.3 论文内容安排 | 第16-17页 |
| 2 基因表达数据格式分析及融合标准确立 | 第17-28页 |
| 2.1 微阵列实验和基因表达数据 | 第17页 |
| 2.2 基因芯片数据 | 第17-19页 |
| 2.3 MIAME标准介绍 | 第19-21页 |
| 2.4 SOFT与MAGE-TAB格式比较与剖析 | 第21-24页 |
| 2.4.1 SOFT格式剖析 | 第21-22页 |
| 2.4.2 MAGE-TAB格式剖析 | 第22-24页 |
| 2.4.3 实现基因表达数据融合的关键问题 | 第24页 |
| 2.5 基因表达数据融合标准确立 | 第24-27页 |
| 2.5.1 基因表达数据中实验信息融合标准 | 第24-25页 |
| 2.5.2 基因表达数据中raw data融合标准 | 第25-27页 |
| 2.6 本章小结 | 第27-28页 |
| 3 基因表达数据映射方案 | 第28-38页 |
| 3.1 实验信息映射 | 第28-32页 |
| 3.1.1 MAGE-TAB中实验信息的表示 | 第28-29页 |
| 3.1.2 SOFT中实验信息的表示 | 第29页 |
| 3.1.3 实验信息映射方案 | 第29-32页 |
| 3.2 RAW DATA映射 | 第32-36页 |
| 3.2.1 Affymetrix芯片数据格式 | 第33页 |
| 3.2.2 GenePix芯片数据格式 | 第33页 |
| 3.2.3 Agilent芯片数据格式 | 第33-34页 |
| 3.2.4 raw data映射方案 | 第34-36页 |
| 3.3 本章小结 | 第36-38页 |
| 4 数据转换与结果分析 | 第38-46页 |
| 4.1 数据转换方案 | 第38-39页 |
| 4.1.1 实验信息转换方案 | 第38页 |
| 4.1.2 raw data转换方案 | 第38页 |
| 4.1.3 数据库结构设计 | 第38-39页 |
| 4.2 数据转换程序设计 | 第39-42页 |
| 4.2.1 设计流程 | 第39-41页 |
| 4.2.2 软件开发流程 | 第41-42页 |
| 4.3 数据转换的结果分析 | 第42-46页 |
| 5 总结与展望 | 第46-48页 |
| 5.1 总结 | 第46-47页 |
| 5.2 展望 | 第47-48页 |
| 附录 | 第48-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 作者简介 | 第54页 |