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PSGL-1/FERM复合物拉伸分子动力学模拟

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第一章 绪论第10-33页
    1.1 研究背景第10-21页
        1.1.1 白细胞的生理学意义第10-11页
        1.1.2 白细胞的稳定粘附第11-12页
        1.1.3 白细胞活化的重要标志——整合素的激活第12-14页
        1.1.4 PSGL-1 的结构第14-15页
        1.1.5 PSGL-1 与选择素的相互作用第15-16页
        1.1.6 ERM蛋白的结构与生物学功能第16-18页
        1.1.7 ERM蛋白的休眠与激活第18-19页
        1.1.8 分子动力学模拟第19-21页
    1.2 国内外的研究现状第21-28页
        1.2.1 PSGL-1 在白细胞粘附过程的信号转导作用第21-22页
        1.2.2 PSGL-1 胞质区对白细胞在选择素上滚动速度的影响第22-23页
        1.2.3 PSGL-1 胞质区对白细胞在选择素上的捕捉和募集的影响第23-24页
        1.2.4 PSGL-1 在整合素“由内而外”激活信号转导中的作用第24-25页
        1.2.5 酪氨酸激酶SYK在炎症反应中的功能第25-28页
    1.3 科学问题的提出及研究的主要内容第28-30页
    1.4 论文研究的主要内容第30-32页
    1.5 本研究的创新之处第32-33页
第二章 晶体结构中的PSGL-1/FERM复合物第33-36页
    2.1 材料与方法第33页
        2.1.1 PSGL-1/FERM复合物分子三维晶体结构文件获取第33页
        2.1.2 PSGL-1/FERM复合物分子三维晶体结构分析方法第33页
    2.2 结果与分析第33-35页
        2.2.1 PSGL-1/FERM复合物三维晶体坐标文件解析第33-34页
        2.2.2 静态构象分析显示 ITAM-like 序列与磷酸化位点均被蛋白包埋第34-35页
    2.3 本章小结第35-36页
第三章 平衡条件下的PSGL-1/FERM复合物第36-41页
    3.1 材料与方法第36-37页
        3.1.1 蛋白质结构文件(PROTEIN STRUCTION FILE,PSF)的生成第36页
        3.1.2 真实实验条件模拟的预处理第36页
        3.1.3 PSGL-1/FERM复合物分子系统的能量最小化与能量平衡第36-37页
        3.1.4 数据分析处理过程第37页
    3.2 结果与分析第37-40页
        3.2.1 能量最小化过程系统总能量分析第37-38页
        3.2.2 PSGL-1/FERM复合物在能量平衡过程中保持了稳定的结构第38-40页
    3.3 本章小结第40-41页
第四章 拉伸分子动力学模拟下的PSGL-1/FERM复合物第41-48页
    4.1 材料与方法第41页
        4.1.1 PSGL-1/FERM复合物的恒速度拉伸分子动力学模拟第41页
        4.1.2 数据处理与分析第41页
    4.2 结果与分析第41-47页
        4.2.1 PSGL-1/FERM复合物在恒速度拉伸分子动力学模拟过程中先解折叠后解离第41-43页
        4.2.2 构象分析显示ITAM-LIKE序列和磷酸化位点Y205在恒速度拉伸过程中发生暴露第43-44页
        4.2.3 SASA值变化验证ITAM-LIKE序列和磷酸化位点Y205在恒速度拉伸过程中发生暴露第44-47页
    4.3 本章小结第47-48页
总结与展望第48-50页
参考文献第50-56页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第56-57页
致谢第57-58页
附件第58页

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