利用SLAF-seq技术构建高密度丹参连锁图谱
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第11-24页 |
| 1.1 目的意义与研究内容 | 第11-12页 |
| 1.2 丹参种质资源及其遗传多样性 | 第12-13页 |
| 1.3 丹参育种研究进展 | 第13-15页 |
| 1.4 遗传连锁图谱构建的原理与方法 | 第15-21页 |
| 1.4.1 作图群体 | 第15-16页 |
| 1.4.2 遗传标记类型 | 第16-20页 |
| 1.4.3 药用植物遗传连锁图谱构建研究概况 | 第20-21页 |
| 1.5 植物数量性状QTL定位 | 第21-24页 |
| 1.5.1 植物数量性状QTL定位原理与常用方法 | 第21-23页 |
| 1.5.2 药用植物数量性状QTL定位研究概况 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-28页 |
| 2.1 丹参高密度遗传连锁图谱 | 第24-28页 |
| 2.1.1 作图群体的建立 | 第24页 |
| 2.1.2 实验主要的试剂配置 | 第24页 |
| 2.1.3 丹参DNA提取 | 第24-25页 |
| 2.1.4 DNA检测 | 第25-26页 |
| 2.1.5 SLAF文库构建和高通量测序 | 第26页 |
| 2.1.6 序列数据聚类和基因分型 | 第26-27页 |
| 2.1.7 遗传连锁图谱构建 | 第27-28页 |
| 2.2 丹参数量性状统计与QTL分析 | 第28页 |
| 2.2.1 表型检测 | 第28页 |
| 2.2.2 试验仪器与试剂 | 第28页 |
| 2.2.3 QTL分析方法 | 第28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-46页 |
| 3.1 丹参DNA的提取 | 第28-29页 |
| 3.2 SLAF-seq结果统计与评估 | 第29-32页 |
| 3.2.1 测序质量值分布检查 | 第29-30页 |
| 3.2.2 碱基类型分布检查 | 第30-31页 |
| 3.2.3 SLAF-seq测序数据及质量统计 | 第31-32页 |
| 3.2.4 SLAF-seq建库评估 | 第32页 |
| 3.3 SLAF标签开发 | 第32-34页 |
| 3.4 遗传图谱的基本特征 | 第34-38页 |
| 3.5 遗传图谱的评价评估 | 第38-40页 |
| 3.5.1 单体来源评估 | 第38页 |
| 3.5.2 连锁关系评估 | 第38-40页 |
| 3.6 丹参农艺性状统计 | 第40-45页 |
| 3.7 QTLs | 第45-46页 |
| 4 结论与讨论 | 第46-49页 |
| 4.1 SLAF-seq大规模开发标记的特点 | 第46页 |
| 4.2 丹参高密度遗传连锁图谱的价值 | 第46-47页 |
| 4.3 药用植物的作图策略和群体 | 第47-48页 |
| 4.4 QTLs分析 | 第48-49页 |
| 5 结论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第60页 |
