| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-21页 |
| 1.1 宁夏滩羊概况 | 第13页 |
| 1.2 反刍动物瘤胃调控的重要性和主要方式 | 第13-15页 |
| 1.2.1 反刍动物瘤胃调控的重要性 | 第13页 |
| 1.2.2 反刍动物瘤胃人工调控的主要方式 | 第13-15页 |
| 1.3 瘤胃微生物的种类、相互作用及其多样性的影响因素 | 第15-17页 |
| 1.3.1 瘤胃微生物的种类 | 第15-16页 |
| 1.3.2 瘤胃微生物间的相互作用 | 第16页 |
| 1.3.3 瘤胃微生物多样性的主要影响因素 | 第16-17页 |
| 1.4 瘤胃微生物的研究历史和主要研究方法 | 第17-19页 |
| 1.4.1 瘤胃微生物的研究历史 | 第17-18页 |
| 1.4.2 瘤胃微生物的主要研究方法 | 第18-19页 |
| 1.5 主要研究目的与意义 | 第19-21页 |
| 第二章 日龄和日粮营养水平对种分类水平上瘤胃微生物数量的影响 | 第21-30页 |
| 2.1 试验材料与方法 | 第21-25页 |
| 2.1.1 试验设计及试验动物 | 第21页 |
| 2.1.2 试验动物日粮及饲养管理 | 第21-22页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第22页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第22-23页 |
| 2.1.5 细菌基因组DNA的提取和PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.1.6 qRT-PCR分析 | 第24-25页 |
| 2.1.7 统计学分析 | 第25页 |
| 2.2 结果与分析 | 第25-27页 |
| 2.2.1 细菌基因组DNA的提取及扩增结果 | 第25-26页 |
| 2.2.2 qRT-PCR标准曲线的建立 | 第26-27页 |
| 2.2.3 日龄和日粮营养水平对瘤胃微生物数量的影响 | 第27页 |
| 2.3 讨论 | 第27-29页 |
| 2.4 小结 | 第29-30页 |
| 第三章 日粮营养水平对滩羊瘤胃pH和VFA的影响 | 第30-35页 |
| 3.1 试验材料与方法 | 第30-31页 |
| 3.1.1 试验设计及试验动物 | 第30页 |
| 3.1.2 试验动物日粮及饲养管理 | 第30页 |
| 3.1.3 样品采集及VFA的测定 | 第30页 |
| 3.1.4 主要仪器 | 第30页 |
| 3.1.5 统计学分析 | 第30-31页 |
| 3.2 结果与分析 | 第31-33页 |
| 3.2.1 不同日粮营养水平对 150~180 日龄滩羊瘤胃液pH和VFA的影响 | 第31-32页 |
| 3.2.2 相关分析 | 第32-33页 |
| 3.3 讨论 | 第33-34页 |
| 3.3.1 日龄和日粮营养水平对pH和VFA含量的影响 | 第33-34页 |
| 3.3.2 相关分析 | 第34页 |
| 3.4 小结 | 第34-35页 |
| 3.4.1 不同日龄、不同营养水平日粮对瘤胃液pH和VFA所占比例的影响 | 第34页 |
| 3.4.2 相关分析 | 第34-35页 |
| 第四章 不同日粮营养水平对滩羊瘤胃细菌多样性的影响 | 第35-52页 |
| 4.1 试验材料与方法 | 第35-36页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第35页 |
| 4.1.2 生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 4.1.3 统计学分析 | 第36页 |
| 4.2 结果与分析 | 第36-49页 |
| 4.2.1 不同日粮处理组的序列统计 | 第36-39页 |
| 4.2.2 滩羊瘤胃细菌群落组成分析 | 第39-42页 |
| 4.2.3 不同瘤胃细菌之间的聚类 | 第42页 |
| 4.2.4 日粮营养水平对瘤胃微生物群落的影响 | 第42-44页 |
| 4.2.5 预测代谢通路和细菌群落的功能 | 第44-49页 |
| 4.3 讨论 | 第49-50页 |
| 4.4 小结 | 第50-52页 |
| 4.4.1 不同日粮营养水平对滩羊瘤胃细菌区系的影响 | 第50页 |
| 4.4.2 功能预测 | 第50-52页 |
| 第五章 结论与创新点 | 第52-53页 |
| 5.1 结论 | 第52页 |
| 5.2 创新点 | 第52页 |
| 5.3 进一步研究内容 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 | 第59-61页 |
| 附录 1 MiSeq 测序流程 | 第59-60页 |
| 1.1 Illumina测序实验流程 | 第59-60页 |
| 1.1.1 基因组DNA抽提 | 第59页 |
| 1.1.2 PCR扩增 | 第59页 |
| 1.1.3 荧光定量 | 第59页 |
| 1.1.4 MiSeq文库构建 | 第59页 |
| 1.1.5 MiSeq测序 | 第59-60页 |
| 附录 2 原始数据的优化 | 第60-61页 |
| 2.1 数据优化与统计 | 第60页 |
| 2.2 数据去杂方法和参数 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 作者简介 | 第62页 |
