| 缩略语表 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 前言 | 第10-14页 |
| 第一章 重要致病性细菌基因组多态性数据的收集与整合 | 第14-62页 |
| 1 细菌基因组多态性 | 第14-21页 |
| ·多位点序列 | 第14-16页 |
| ·多位点 VNTR | 第16-18页 |
| ·规律成簇的间隔短回文重复 | 第18-19页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第19-21页 |
| ·差异区段 | 第21页 |
| ·插入序列 | 第21页 |
| 2 基因组多态性数据的收集与整合 | 第21-62页 |
| ·鼠疫耶尔森氏菌 | 第22-31页 |
| ·布鲁氏菌 | 第31-39页 |
| ·结核分枝杆菌 | 第39-45页 |
| ·幽门螺杆菌 | 第45-47页 |
| ·大肠杆菌 O157:H7 | 第47-50页 |
| ·志贺氏菌 | 第50-55页 |
| ·沙门氏菌 | 第55-58页 |
| ·副溶血弧菌 | 第58-62页 |
| 第二章 重要致病性细菌基因组多态性数据库的构建 | 第62-82页 |
| 1 关系型数据库的构建 | 第62-72页 |
| ·鼠疫菌基因组多态性关系数据库的构建 | 第62-69页 |
| ·重要致病性细菌基因组多态性关系数据库的构建 | 第69-72页 |
| 2 基于 web 的应用程序设计 | 第72-82页 |
| ·开发工具 | 第74页 |
| ·检索模块 | 第74-75页 |
| ·分型模块 | 第75-78页 |
| ·溯源模块 | 第78-81页 |
| ·序列比对模块 | 第81-82页 |
| 第三章 重要致病性细菌基因组多态性数据库的应用 | 第82-92页 |
| 1 基本应用 | 第82-88页 |
| ·检索 | 第82-85页 |
| ·分型 | 第85-86页 |
| ·溯源 | 第86-87页 |
| ·序列比对 | 第87-88页 |
| 2 应用实例 | 第88-90页 |
| 3 结果与讨论 | 第90-92页 |
| 综述 | 第92-97页 |
| 参考文献 | 第97-109页 |
| 附录 基于 web 的应用程序核心源代码 | 第109-139页 |
| 代表性论文 | 第139-159页 |
| 个人简历 | 第159-160页 |
| 致谢 | 第160-161页 |