肝脏不同类型细胞基因表达及可变剪接的研究
| 目录 | 第1-5页 |
| 缩略词表 | 第5-7页 |
| 中文摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-24页 |
| 1 课题背景与研究意义 | 第13-22页 |
| ·肝脏细胞水平研究的重要性 | 第13-15页 |
| ·转录组表达谱构建的必要性 | 第15-17页 |
| ·可变剪接分布的广泛性 | 第17-20页 |
| ·新蛋白质的鉴定 | 第20-22页 |
| 2 研究内容和方法策略 | 第22-24页 |
| 第二章 小鼠肝脏细胞转录组表达谱构建 | 第24-41页 |
| 1 材料与方法 | 第24-28页 |
| ·材料与试剂 | 第24页 |
| ·主要仪器 | 第24-25页 |
| ·实验动物 | 第25页 |
| ·小鼠肝脏不同类型细胞的分选 | 第25页 |
| ·小鼠肝脏细胞 RNA 样品的制备 | 第25-26页 |
| ·PCR 实验与 Sanger 测序验证 | 第26-27页 |
| ·RNA-Seq 数据产出 | 第27页 |
| ·RNA-Seq 数据处理 | 第27页 |
| ·GO 功能富集分析和 KEGG 通路富集分析 | 第27页 |
| ·KEGG 数据库整合与通路匹配 | 第27-28页 |
| 2 结果与讨论 | 第28-40页 |
| ·RNA-Seq 数据概况 | 第28-30页 |
| ·小鼠肝脏不同类型细胞鉴定基因的统计 | 第30-34页 |
| ·小鼠肝脏不同类型细胞功能富集分析 | 第34-36页 |
| ·小鼠肝脏不同类型细胞特异表达基因分析 | 第36-37页 |
| ·小鼠肝脏不同类型细胞协同通路分析 | 第37-40页 |
| 3 小结 | 第40-41页 |
| 第三章 小鼠肝脏不同类型细胞基因可变剪接的分析 | 第41-56页 |
| 1 材料与方法 | 第41-44页 |
| ·新可变剪接亚型的鉴定 | 第41页 |
| ·可变剪接差异的鉴定方法 | 第41-42页 |
| ·差异表达剪接因子的筛选 | 第42页 |
| ·PCR 实验验证与 Sanger 测序 | 第42-44页 |
| 2 结果与讨论 | 第44-55页 |
| ·新转录本的鉴定与验证 | 第44-47页 |
| ·小鼠肝脏不同细胞类型可变剪接差异的鉴定与验证 | 第47-52页 |
| ·小鼠肝脏不同类型细胞的剪接因子差异分析 | 第52-55页 |
| 3 小结 | 第55-56页 |
| 第四章 整合转录组和蛋白质组数据鉴定新蛋白质 | 第56-76页 |
| 1 材料与方法 | 第56-61页 |
| ·试剂 | 第56-57页 |
| ·仪器 | 第57页 |
| ·实验动物 | 第57页 |
| ·RNA-Seq 数据产出 | 第57页 |
| ·RNA-Seq 数据处理 | 第57-58页 |
| ·质谱数据产出 | 第58页 |
| ·质谱数据的搜库与质控 | 第58-59页 |
| ·PCR 与 Sanger 测序 | 第59-60页 |
| ·qRT-PCR 实验 | 第60-61页 |
| 2 结果与讨论 | 第61-74页 |
| ·小鼠肝脏组织蛋白质组和转录组的鉴定 | 第61-65页 |
| ·小鼠肝脏组织新转录本的鉴定和筛选 | 第65-67页 |
| ·小鼠肝脏组织特异性蛋白质数据库的构建 | 第67-68页 |
| ·小鼠肝脏组织新蛋白质的鉴定与验证 | 第68-74页 |
| 3 小结 | 第74-76页 |
| 第五章 总结与讨论 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-88页 |
| 个人简历 | 第88页 |
| 资助项目 | 第88页 |
| 发表文章 | 第88-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
