| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 目录 | 第11-14页 |
| 1. 前言 | 第14-28页 |
| ·种子科学研究及其重要意义 | 第14-15页 |
| ·种子萌发的定义及其重要意义 | 第15页 |
| ·种子萌发的一般生物学过程 | 第15-24页 |
| ·种子萌发过程中的呼吸作用 | 第15-16页 |
| ·种子萌发过程中营养物质的动员 | 第16-18页 |
| ·种子萌发过程中的修复机制 | 第18-19页 |
| ·种子萌发过程中的转录和翻译 | 第19页 |
| ·植物激素对种子萌发的调节 | 第19-24页 |
| ·水稻种子的萌发特点 | 第24-25页 |
| ·蛋白质组学技术的应用 | 第25-27页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-44页 |
| ·水稻材料及萌发方法 | 第28页 |
| ·蛋白质提取方法 | 第28-29页 |
| ·丙酮法提取蛋白质 | 第28-29页 |
| ·TCA法提取蛋白质 | 第29页 |
| ·去除盐溶性球蛋白 | 第29页 |
| ·蛋白质浓度测定 | 第29-30页 |
| ·蛋白质单项SDS-PAGE电泳 | 第30页 |
| ·蛋白质双向电泳 | 第30-31页 |
| ·磷酸化蛋白染料Pro-Q染色 | 第31页 |
| ·蛋白质酶解和脱盐 | 第31-33页 |
| ·蛋白质胶内酶解及脱盐 | 第31-32页 |
| ·非胶系统蛋白酶解及肽段脱盐 | 第32-33页 |
| ·磷酸化肽段富集 | 第33-34页 |
| ·质谱分析 | 第34-37页 |
| ·水稻种子全蛋白质组LC-MS/MS质谱鉴定 | 第34页 |
| ·大豆种子全蛋白质组LC-MS/MS质谱鉴定 | 第34-35页 |
| ·双向电泳差异点的MALDI-TOF质谱分析 | 第35页 |
| ·双向电泳差异点的MALDI-TOF/TOF质谱分析 | 第35-36页 |
| ·i-TRAQ标记的质谱分析 | 第36页 |
| ·Label-free蛋白定量质谱分析与蛋白鉴定方法 | 第36-37页 |
| ·希氏高碘酸(PAS)染色 | 第37-38页 |
| ·氨基酸提取和定量分析 | 第38页 |
| ·脂肪酸提取和定量分析 | 第38页 |
| ·超氧阴离子和过氧化氢的原位显色 | 第38-39页 |
| ·胚组织中淀粉含量测定 | 第39页 |
| ·可溶糖测量 | 第39-40页 |
| ·酶活测定 | 第40-41页 |
| ·抗坏血酸含量测定 | 第41页 |
| ·ATP含量测定 | 第41页 |
| ·磷酸化蛋白的western-blot | 第41-42页 |
| ·RNA提取和Real-time PCR分析 | 第42页 |
| ·凯氏定氮法测定种子蛋白质总含量 | 第42-43页 |
| ·其它 | 第43-44页 |
| 3. 实验结果 | 第44-102页 |
| ·萌发种子的全蛋白质组研究 | 第44-46页 |
| ·水稻与大豆萌发种子的全蛋白质组比较研究 | 第46-50页 |
| ·水稻种子萌发的蛋白质组动态变化分析 | 第50-55页 |
| ·水稻种子萌发过程中胚和胚乳组织蛋白质组的动态研究 | 第55-83页 |
| ·水稻种子萌发过程中胚乳组织蛋白质组的动态变动研究 | 第57-60页 |
| ·水稻种子萌发过程中胚组织蛋白质组的动态变动研究 | 第60-72页 |
| ·水稻种子萌发早期胚组织的蛋白质组动态分析 | 第72-83页 |
| ·水稻种子萌发过程中胚组织的磷酸化蛋白质组的动态研究 | 第83-102页 |
| ·水稻种子萌发过程中基于凝胶系统的胚组织磷酸化蛋白质组动态研究 | 第83-94页 |
| ·水稻种子萌发早期基于磷酸化肽段富集胚组织磷酸化蛋白质组动态研究 | 第94-102页 |
| 4. 讨论 | 第102-110页 |
| ·水稻种子萌发能量动员及代谢调控机制 | 第102-105页 |
| ·水稻种子萌发过程的激素调控 | 第105-107页 |
| ·蛋白质组学在种子萌发中的应用 | 第107-110页 |
| 5. 总结 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-127页 |
| 附录1. 附图 | 第127-130页 |
| 附录2. Real-time PCR检测基因引物序列 | 第130-132页 |
| 附录3. 水稻种子萌发的全蛋白质组蛋白列表 | 第132-152页 |
| 附录4. 胚乳组织中在萌发过程中2DE-MALDI-TOF鉴定到的差异表达蛋白 | 第152-158页 |
| 附录5. 胚组织中在萌发过程中2DE-MALDI-TOF鉴定到的差异表达蛋白 | 第158-164页 |
| 附录6. 胚组织中在萌发过程中i-TRAQ方法鉴定到的差异表达蛋白 | 第164-176页 |
| 附录7. 水稻种子萌发早期胚组织中应用label free质谱定量技术鉴定到的蛋白丰度显著变化蛋白 | 第176-206页 |
| 附录8. 水稻种子萌发过程中通过双向电泳胶图确定的磷酸化水平显著变化蛋白点的Pro-Q染色强度,蛋白丰度和磷酸化水平变化表 | 第206-211页 |
| 附录9. 水稻种子萌发过程中通过双向电泳胶图确定的磷酸化水平稳定蛋白点的Pro-Q染色强度和蛋白丰度变化表 | 第211-213页 |
| 附录10. 水稻种子萌发过程中利用Pro-Q染色结合MALDI-TOF/TOF质谱鉴定胚组织中蛋白质磷酸化显著差异蛋白列表 | 第213-218页 |
| 附录11. 水稻种子萌发过程中利用Pro-Q染色结合MALDI-TOF/TOF质谱鉴定胚组织中稳定磷酸化蛋白列表 | 第218-222页 |
| 附录12. 水稻种子萌发早期胚组织中磷酸化蛋白丰度显著变化蛋白列表 | 第222-229页 |
| 附录13. 水稻种子萌发早期胚组织中磷酸化蛋白丰度和蛋白丰度都显著变化蛋白列表 | 第229-231页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第231-232页 |
| 作者简历 | 第231页 |
| 已发表（或正式接受）的学术论文 | 第231-232页 |
