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桑树秋末冬初绿枝扦插生根的理化与转录组分析及鉴定

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-16页
第一章 绪论第16-23页
   ·研究背景第16-22页
     ·扦插生根的生理学研究第17-18页
     ·扦插生根的分子机制第18-20页
     ·高通量测序研究进展第20-21页
     ·植物 GH3 家族基因的研究进展第21-22页
   ·研究的目的与意义第22页
   ·研究内容第22-23页
     ·桑树秋末冬初绿枝扦插生根过程的生理生化指标的测定第22页
     ·桑树秋末冬初绿枝扦插生根过程高通量测序及转录组数据分析..7第22页
     ·MaGH3.6 基因的初步分析第22-23页
第二章 桑树秋末冬初绿枝扦插生根生理生化指标的测定第23-31页
   ·材料制作及主要试剂第23页
   ·实验方法第23-25页
     ·可溶性总糖的测定第23-24页
     ·可溶性蛋白的测定第24页
     ·吲哚乙酸氧化酶活性的测定第24页
     ·过氧化物酶的活性第24-25页
     ·多酚氧化物酶的活性第25页
   ·结果与分析第25-29页
     ·扦插生根过程中营养物质与生根的关系第25-27页
     ·扦插生根过程中酶类和脯氨酸与生根的关系第27-29页
   ·讨论第29-31页
     ·营养物质与生根的关系第29页
     ·酶类与生根的关系第29-31页
第三章 桑树秋末冬初绿枝扦插转录组测序分析第31-63页
   ·实验材料第31-32页
     ·植物材料第31页
     ·生化试剂第31-32页
   ·实验方法第32-41页
     ·总 RNA 抽提及质量检测第32-33页
     ·桑树秋末冬初绿枝扦插生根过程转录组样品测序第33-38页
     ·桑树秋末冬初绿枝扦插生根过程转录组数据分析第38-40页
     ·实时定量 RT-PCR第40-41页
   ·结果及分析第41-57页
     ·De nove 拼接序列和评估 Illumina EST 序列的质量第41-42页
     ·蛋白功能注释第42-43页
     ·GO 功能分类和 KEGG 代谢途径分析第43页
     ·差异基因的筛选及初步分析第43-49页
     ·差异基因的 GO 和 KEGG 功能富集第49-50页
     ·不同发育阶段的基因表达变化第50-55页
     ·实时定量验证第55-57页
   ·讨论第57-63页
     ·桑树扦插不定根形成过程的转录组的变化第57页
     ·不定根形成需要生长素和细胞分裂素信号转导通路的参与第57-60页
     ·JA ,乙烯和油菜素内酯信号转导通路参与不定根第60-61页
     ·细胞周期和细胞分裂的不定根形成中的作用第61页
     ·碳水化合物的代谢和能量代谢在不定根形成中的作用第61-63页
第四章 桑树 MaGH3.6 基因的克隆与诱导表达及时间特异性第63-76页
   ·材料与方法第63-68页
     ·主要试剂第63-64页
     ·桑树 GH3 基因的克隆第64-66页
     ·桑树 GH3 基因的生物信息学分析第66-67页
     ·桑树 GH3 基因的诱导表达分析第67-68页
     ·桑树 GH3 基因的 Solexa 数据分析第68页
   ·结果与分析第68-75页
     ·桑树 GH3 基因的克隆与测序鉴定第68-70页
     ·桑树 MaGH3.6 基因编码蛋白质的序列特征第70-71页
     ·桑树 MaGH3.6 基因编码氨基酸的同源性与进化分析第71-73页
     ·IAA 和 NAA 诱导桑树 MaGH3.6 基因的表达变化第73-74页
     ·桑树 MaGH3.6 基因在扦插生根过程中的表达变化第74-75页
   ·讨论第75-76页
结论第76-78页
已登录 GeneBank 序列号第78-79页
参考文献第79-87页
攻读硕士期间发表的论文第87-88页
致谢第88页

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