| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 1 绪论 | 第11-22页 |
| ·黄芪次生代谢研究概况 | 第11-18页 |
| ·诱导子在植物次生代谢途径研究中的应用 | 第11-14页 |
| ·无土栽培在根际微生物研究中的应用 | 第14-15页 |
| ·组学技术和新一代测序技术的应用 | 第15-18页 |
| ·研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| ·研究的内容 | 第19-20页 |
| ·技术路线 | 第20-22页 |
| 2 调控黄芪次生代谢途径的诱导子的筛选 | 第22-51页 |
| ·材料方法 | 第22-26页 |
| ·试验材料 | 第22页 |
| ·试验方法 | 第22-26页 |
| ·结果与分析 | 第26-50页 |
| ·多糖含量结果分析 | 第26-31页 |
| ·皂苷含量结果分析 | 第31-36页 |
| ·黄酮含量结果分析 | 第36-41页 |
| ·黄芪植株折干率结果分析 | 第41-46页 |
| ·多糖、皂苷、黄酮含量之间的关系 | 第46-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 3 转录组测序质量评估 | 第51-58页 |
| ·材料与方法 | 第51-54页 |
| ·植物材料 | 第51页 |
| ·植物总RNA的提取 | 第51页 |
| ·mRNA样品准备 | 第51-52页 |
| ·cDNA文库制备 | 第52-53页 |
| ·emPCR扩增 | 第53页 |
| ·Roche 454 GS FLX+测序仪上机测序 | 第53-54页 |
| ·原始数据整理、过滤及质量评估 | 第54页 |
| ·测序饱和度分析 | 第54页 |
| ·结果与分析 | 第54-57页 |
| ·总RNA质量分析结果 | 第54-55页 |
| ·测序量统计结果 | 第55-56页 |
| ·测序饱和度分析结果 | 第56-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 4 转录组数据的基本分析 | 第58-70页 |
| ·分析方法 | 第58-59页 |
| ·Unigene聚类以及Unigene注释 | 第58页 |
| ·GO Slim分析 | 第58页 |
| ·COG分析 | 第58-59页 |
| ·Unigene KO分析 | 第59页 |
| ·结果与分析 | 第59-64页 |
| ·Unigene聚类以及Unigene注释结果 | 第59-60页 |
| ·GO Slim分析结果 | 第60-61页 |
| ·COG分析结果 | 第61-62页 |
| ·Unigene KO分析结果 | 第62-64页 |
| ·本章小结 | 第64-70页 |
| 5 转录组SSR位点的信息分析 | 第70-73页 |
| ·分析方法 | 第70页 |
| ·结果与分析 | 第70-72页 |
| ·SSR位点的数量与分布 | 第70-71页 |
| ·SSR的特性 | 第71-72页 |
| ·SSR的可用性评价 | 第72页 |
| ·本章小结 | 第72-73页 |
| 6 转录组基因模型预测 | 第73-81页 |
| ·分析方法 | 第73页 |
| ·结果与分析 | 第73-79页 |
| ·基因模型分析 | 第73-77页 |
| ·可变剪切分析 | 第77-79页 |
| ·本章小结 | 第79-81页 |
| 结论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-91页 |
| 附录 | 第91-100页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第100-101页 |
| 致谢 | 第101-102页 |