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家蚕MITE转座子的鉴定、进化和功能以及家蚕转座子的进化动力学研究

摘要第1-12页
ABSTRACT第12-17页
第一章 文献综述第17-33页
   ·转座子概述第17-27页
     ·转座子的概念、分布和分类第17-23页
     ·转座子的功能第23-27页
   ·家蚕基因组中转座子的概述第27页
   ·MITE转座子的研究第27-29页
     ·MITE转座子的概念、分布和特征第27-28页
     ·MITE转座子的起源和扩增机制第28-29页
   ·转座子的群体动力学的概念和影响因素第29-33页
第二章 引言第33-35页
   ·研究背景、目的和意义第33-34页
   ·研究内容第34页
   ·技术路线第34-35页
第三章 家蚕MITE转座子的鉴定和进化分析第35-53页
   ·材料与方法第35-39页
     ·实验用家蚕品系第35页
     ·实验所用到的引物第35页
     ·生物信息学分析所需的软件和程序第35-36页
     ·主要分析方法及流程第36-39页
   ·结果与分析第39-50页
     ·家蚕MITE转座子的种类和含量及特征第39-43页
     ·PCR验证鉴定的MITE转座子第43-44页
     ·家蚕MITE转座的分化和插入时间估计第44-47页
     ·家蚕MITE转座子在家蚕染色体间和基因附近的分布情况第47-50页
   ·讨论第50-53页
第四章 转座子在家蚕驯化过程中的群体动力学第53-77页
   ·材料与方法第53-64页
     ·实验用家蚕品系第53-54页
     ·实验所需的引物第54-55页
     ·生物信息学分析所需的软件和程序第55-56页
     ·主要试剂第56页
     ·主要实验仪器第56页
     ·主要溶液配制第56-57页
     ·主要实验方法及流程第57-64页
   ·结果与分析第64-73页
     ·转座子显示结果和群体多态性数据第64-67页
     ·基于转座子多态性数据的群体结构分析第67-68页
     ·家蚕的驯化历史第68-69页
     ·极大似然法估计转座子在不同群体内的选择系数第69-70页
     ·转座子多态性的中性检验第70-73页
   ·讨论第73-77页
第五章 家蚕BMMITE-2转座子对邻近基因表达的影响第77-101页
   ·材料与方法第77-92页
     ·实验用家蚕品系和细胞系第77页
     ·实验所需的引物第77-79页
     ·生物信息学分析所需的软件和程序第79-80页
     ·主要试剂第80页
     ·主要实验仪器第80-81页
     ·主要培养基及溶液配制第81-82页
     ·主要实验方法及流程第82-92页
   ·结果与分析第92-99页
     ·分析BmMITE-2转座子在基因附近的分布情况第92-93页
     ·调查BmMITE-2在不同家蚕品系中相应位点的插入缺失情况第93-95页
     ·比较插入和缺失品系BmMITE-2邻近基因的表达差异第95-96页
     ·转基因验证BmMITE-2对邻近基因表达的调控第96-97页
     ·细胞转染验证BmMITE-2对邻近基因表达的调控第97-99页
   ·讨论第99-101页
第六章 结论第101-103页
论文的创新点第103-105页
参考文献第105-115页
附录第115-117页
 英文缩写表第115-117页
在读期间发表论文及参加课题第117-119页
致谢第119-120页

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