| 目录 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-16页 |
| 第一章 数据处理与分析 | 第16-34页 |
| ·背景介绍 | 第16页 |
| ·基因表达数据与SNP数据 | 第16-19页 |
| ·基因表达数据 | 第16-18页 |
| ·SNP数据 | 第18-19页 |
| ·RNA序列数据 | 第19-29页 |
| ·背景介绍 | 第19-20页 |
| ·RNA序列数据处理流程 | 第20-22页 |
| ·乳腺癌肿瘤干细胞Cancer stem cell(CSC)生物标记与治疗 | 第22-29页 |
| ·DNA甲基化数据 | 第29-34页 |
| ·背景介绍 | 第29-30页 |
| ·药物治疗对乳癌干细胞的DNA甲基化影响 | 第30-34页 |
| 第二章 药物重新定位 | 第34-46页 |
| ·背景介绍 | 第34-35页 |
| ·Connectivity map方法与数据库 | 第35-38页 |
| ·背景介绍 | 第35页 |
| ·药物分子与实验数据 | 第35-36页 |
| ·数据处理 | 第36页 |
| ·cMap的药物重定位方法 | 第36-38页 |
| ·PREDICT算法 | 第38-41页 |
| ·数据集 | 第38-39页 |
| ·收集药物-疾病关联对 | 第39页 |
| ·相似性衡量 | 第39-40页 |
| ·整合衡量得到分类特征 | 第40-41页 |
| ·应用流形学习进行药物重定位 | 第41-46页 |
| ·扩散映射(Diffusion map) | 第42-43页 |
| ·扩散映射在药物重定位中的应用 | 第43-46页 |
| 第三章 网络整合与最优信号网络发掘 | 第46-52页 |
| ·背景介绍 | 第46-47页 |
| ·网络整合 | 第47-48页 |
| ·最优信号网络 | 第48-50页 |
| ·用扩散的方法发掘子网络 | 第50-52页 |
| 第四章 对NWS类髓母细胞瘤的药物重新定位与机理研究 | 第52-72页 |
| ·背景介绍 | 第52-55页 |
| ·方法 | 第55-57页 |
| ·发掘主导基因 | 第55页 |
| ·子网络发掘问题公式 | 第55-56页 |
| ·用扩散的方法发掘子网络 | 第56-57页 |
| ·结果 | 第57-67页 |
| ·数据资源库 | 第57页 |
| ·NWS类髓母细胞瘤MED8A细胞株的药物筛选 | 第57-58页 |
| ·重新定位药物治疗NWS类髓母细胞瘤 | 第58-62页 |
| ·预测药物作用于NWS类髓母细胞瘤的机制(信号网络) | 第62-67页 |
| ·讨论 | 第67-72页 |
| 第五章 图的[r,s,c,t]-染色 | 第72-80页 |
| ·图的基本概念 | 第72-73页 |
| ·图的[r,s,c,t]-染色背景介绍 | 第73-74页 |
| ·主要定理和结果 | 第74-78页 |
| ·讨论 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-92页 |
| 致谢 | 第92-94页 |
| 攻读博士学位期间完成论文情况 | 第94-96页 |
| 作者简介 | 第96-98页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第98页 |
