生物途径数字化策略及其在共生固氮网络数据库中的实现
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 主要符号和缩略词表 | 第8-13页 |
| 1 绪论 | 第13-27页 |
| ·途径生物信息学和生物途径数据库 | 第13-20页 |
| ·豆科植物-根瘤菌共生固氮作用 | 第20-26页 |
| ·论文研究内容与目标 | 第26-27页 |
| 2 生物途径数字化策略 | 第27-48页 |
| ·KEGG 的途径描述 | 第27-30页 |
| ·BioCyc 的途径描述 | 第30-33页 |
| ·PID 的途径描述 | 第33-34页 |
| ·Ontology | 第34-38页 |
| ·我们的数字化策略 | 第38-48页 |
| 3 共生体固氮作用数字化的实现 | 第48-71页 |
| ·共生体固氮网络数据来源 | 第48页 |
| ·共生体的固氮网络的初步分析 | 第48-52页 |
| ·共生体固氮网络的数字化描述 | 第52-61页 |
| ·共生体固氮网络的搜索和固氮网络可视化 | 第61-64页 |
| ·共生体固氮网络的层次化和结构变化 | 第64-68页 |
| ·其他附属软件 | 第68-69页 |
| ·讨论 | 第69-71页 |
| 4 共生固氮途径研究方法数据库的设计与实现 | 第71-87页 |
| ·数据来源 | 第71-72页 |
| ·数据库发布 | 第72-74页 |
| ·固氮蛋白质互作研究方法分类 | 第74-76页 |
| ·数据库系统设计环境 | 第76-78页 |
| ·数据库系统结构设计 | 第78-80页 |
| ·发布与维护 | 第80-83页 |
| ·实验编辑器 | 第83-87页 |
| 5 总结和展望 | 第87-90页 |
| 致谢 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-96页 |
| 附录 攻读学位期间发表的论文目录 | 第96页 |
