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全基因组关联分析揭示主效基因及修饰基因共同作用决定中国地方猪两头乌毛色

中文摘要第1-7页
ABSTRACT第7-8页
缩略语第8-9页
第一章 文献综述第9-35页
 1 中国地方猪两头乌毛色表型及代表性猪种第9-12页
   ·华中两头乌猪第9-10页
     ·沙子岭猪第10页
     ·监利猪第10页
     ·通城猪第10页
     ·赣西两头乌猪第10页
     ·东山猪第10页
   ·巴马香猪第10-11页
   ·剑白香猪第11页
   ·官庄花猪第11页
   ·金华猪第11页
   ·其他含有类似两头乌毛色表型的中国地方猪第11-12页
     ·荣昌猪第11页
     ·大花白猪第11-12页
     ·乐平猪第12页
     ·黔邵花猪第12页
     ·黔东花猪第12页
 2 毛色形成的细胞生物学基础及信号通路第12-21页
   ·黑色素细胞的发育分化第12-14页
   ·黑色素的合成及迁移第14-15页
   ·毛色形成的信号通路及分子调控第15-21页
     ·黑色素细胞发育分化过程中的信号通路及分子调控第17-21页
     ·黑色素合成及迁移的信号通路及分子调控第21页
 3 猪毛色遗传位点研究进展第21-27页
   ·显性白(I)位点第22-23页
   ·毛色扩展(E)位点第23-26页
   ·鼠灰色(A)位点第26页
   ·棕褐色(B)位点第26页
   ·其他位点第26-27页
 4 畜禽动物毛色基因鉴别的最新研究进展第27-33页
   ·狗的白斑毛色基因MITF及显性黑毛基因β-defensin第27-29页
   ·羊的黑白毛基因ASIP第29-30页
   ·马的灰毛基因STX17第30-31页
   ·牛的白背脊带毛色基因c-KIT第31-32页
   ·鸡的乌骨白羽基因EDN3第32-33页
 5 本研究的目的和意义第33-35页
   ·本研究的目的第34页
   ·本研究的意义第34-35页
第二章 全基因组关联分析揭示主效基因及修饰基因共同作用决定中国地方猪两头乌毛色第35-65页
 1 引言第35-36页
 2 材料与方法第36-39页
   ·实验动物第36页
   ·表型测定第36页
   ·全基因组60k芯片的检测第36-37页
   ·EDNRB基因标签SNP位点的检测第37-38页
   ·EDN3基因的重测序第38页
   ·EDN3基因标签SNP位点的检测第38-39页
   ·数据统计分析第39页
 3 结果第39-55页
   ·资源群体两头乌毛色表型分离情况第39-42页
   ·全基因组关联分析定位结果第42-47页
     ·二花脸×沙子岭猪F_2资源群体全基因组关联分析定位结果第42页
     ·二花脸×巴马香猪F2资源群体全基因组关联分析定位结果第42页
     ·二花脸×通城猪F2资源群体全基因组关联分析定位结果第42-43页
     ·二花脸×荣昌猪F2资源群体全基因组关联分析定位结果第43-47页
     ·资源群体合并分析的全基因组连锁定位结果第47页
   ·两头乌毛色主效基因EDNRB标签SNP的鉴别及判型第47-48页
   ·两头乌毛色修饰基因EDN3的发现及标签SNP的鉴别第48-54页
     ·两头乌毛色修饰基因EDN3的发现第48-49页
     ·两头乌毛色修饰基因EDN3的重测序结果第49-54页
     ·两头乌毛色修饰基因EDN3标签SNP的判型第54页
   ·两头乌毛色修饰基因KITLG和KIT的发现第54-55页
 4 分析与讨论第55-63页
   ·两头乌毛色表型遗传模式第55-56页
   ·全基因组关联分析法第56-57页
   ·EDNRB基因对两头乌毛色影响的主效效应第57页
   ·不同两头乌猪种表型的修饰基因第57-62页
   ·荣昌猪毛色遗传位点简析第62-63页
 5 小结第63-64页
 6 结论第64-65页
参考文献第65-73页
附录1第73-77页
附录2 作者简历及博士期间发表文章第77-79页
致谢第79-80页

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