第一部分 中国两头乌猪毛色主效基因EDNRB因果突变的鉴别及其遗传效应分析 | 第1-9页 |
中文摘要 | 第7-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
第二部分 猪MfCV基因核苷酸多态和连锁不平衡模式分析 | 第9-11页 |
中文摘要 | 第9-10页 |
ABSTRACT | 第10-11页 |
第一部分 中国两头乌猪毛色主效基因EDNRB因果突变的鉴别及其遗传效应分析 | 第11-52页 |
第一章 文献综述 | 第11-24页 |
1 家猪毛色的类型 | 第11-13页 |
·野生型 | 第11页 |
·白色 | 第11页 |
·全黑色 | 第11-12页 |
·红色 | 第12页 |
·棕褐色 | 第12页 |
·白环带 | 第12-13页 |
·乌云盖雪 | 第13页 |
·花斑 | 第13页 |
2 哺乳动物毛色形成的生理学基础 | 第13-19页 |
·黑色素细胞的起源 | 第13-15页 |
·影响黑色素细胞形成的调控基因及信号通路 | 第15-18页 |
·Pax3转录因子 | 第15页 |
·Sox10转录因子 | 第15页 |
·Mitf转录因子 | 第15-16页 |
·Wnt/β-catenin信号通路 | 第16页 |
·EDNRB/EDN3基因 | 第16页 |
·c-Kit/Kitl信号通路 | 第16-17页 |
·MC1R/ASIP/a-MSH信号通路 | 第17页 |
·酪氨酸酶基因家族(TYR\TYR1\TYR2) | 第17-18页 |
·黑色素的合成 | 第18-19页 |
3 EDNRB基因在动物毛色形成中的作用 | 第19-21页 |
·EDNRB基因的作用时间阶段及对成黑色素细胞迁移的重要作用 | 第20-21页 |
·EDNRB对黑色素细胞的增殖和分化作用 | 第21页 |
4 EDNRB变异对哺乳动物毛色表型的影响 | 第21-22页 |
5 畜禽毛色主效基因鉴别的最新研究进展 | 第22-23页 |
6 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
第二章 正文 | 第24-45页 |
1 引言 | 第24页 |
2 材料与方法 | 第24-30页 |
·实验动物 | 第24-28页 |
·EDNRB基因的重测序 | 第28页 |
·EDNRB基因因果突变位点的鉴别 | 第28-29页 |
·EDNRB基因标签突变位点的检测 | 第29-30页 |
·生物信息学分析 | 第30页 |
3 结果与讨论 | 第30-44页 |
·EDNRB基因组重测序及SNP的搜寻 | 第30-38页 |
·两头乌猪共享IBD区域的发现 | 第38-40页 |
·EDNRB基因候选因果SNP的鉴别及其生物信息学分析 | 第40-42页 |
·中西方种猪在EDNRB标签位点的遗传变异分析 | 第42-44页 |
4 小结 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-52页 |
第二部分 猪MUC4基因核苷酸多态和连锁不平衡模式分析 | 第52-84页 |
第一章 文献综述 | 第52-64页 |
1 MUC家族的特性 | 第52-55页 |
·MUC家族的结构 | 第52-53页 |
·MUC基因家族的分类 | 第53-54页 |
·MUC家族的功能 | 第54-55页 |
2 MUC4的结构和功能 | 第55-57页 |
·MUC4的结构 | 第55-56页 |
·MUC4的功能 | 第56-57页 |
3 群体进化研究的统计方法 | 第57-63页 |
·Tajima's D值检验 | 第57-58页 |
·种群分化的检验 | 第58-59页 |
·系统发生分析 | 第59页 |
·连锁不平衡分析 | 第59-63页 |
4 研究MUC4 历史进化的意义 | 第63-64页 |
第二章 正文 | 第64-79页 |
1 引言 | 第64-65页 |
2 材料与方法 | 第65-66页 |
·实验动物 | 第65页 |
·实验方法 | 第65页 |
·DNA样品的制备 | 第65页 |
·SNP的搜寻与判型 | 第65页 |
·统计分析 | 第65-66页 |
3 结果与讨论 | 第66-78页 |
·MUC4的多态分析 | 第66-71页 |
·单倍型的重构建与进化分析 | 第71-76页 |
·连锁不平衡分析 | 第76-78页 |
·平衡选择分析 | 第78页 |
4 小结 | 第78-79页 |
参考文献 | 第79-84页 |
附录1 | 第84-85页 |
博士期间论文发表情况 | 第85-86页 |
致谢 | 第86-87页 |