| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12页 |
| 2 文献综述 | 第12-27页 |
| ·芸薹属物种基因组形成及比较基因组研究 | 第12-17页 |
| ·芸薹属物种形成简介 | 第12-14页 |
| ·芸薹属基因组间关系 | 第14-15页 |
| ·芸薹属基因组研究进展及其与拟南芥基因组的比较研究进展 | 第15-17页 |
| ·生物信息学在植物基因组研究中的应用 | 第17-25页 |
| ·生物信息学定义及研究方法 | 第17-21页 |
| ·生物信息学的产生及定义 | 第17-18页 |
| ·序列分析常用的数据库 | 第18-20页 |
| ·序列分析常用的分析工具 | 第20-21页 |
| ·生物信息学在植物基因组中的研究进展 | 第21-25页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第25-27页 |
| ·研究基础 | 第25-26页 |
| ·研究目的及意义 | 第26-27页 |
| ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝的三物种BAC末端序列 | 第26页 |
| ·甘蓝型油菜的BAC末端序列和拟南芥基因组双端比对 | 第26页 |
| ·甘蓝型油菜、白菜、甘蓝三物种EST序列SSR挖掘 | 第26-27页 |
| 3.甘蓝型油菜、白菜、甘蓝的BAC末端序列分析 | 第27-52页 |
| ·三物种BAC末端序列信息简介 | 第27页 |
| ·三物种BAC末端序列信息来源 | 第27页 |
| ·三物种BAC末端序列信息概况 | 第27页 |
| ·三物种BAC末端序列分析方法 | 第27-29页 |
| ·BAC末端序列分析工具 | 第27-29页 |
| ·BAC末端序列分析流程 | 第29页 |
| ·三物种BAC末端序列分析结果 | 第29-42页 |
| ·三物种BAC末端序列基本信息 | 第29-31页 |
| ·三物种BAC末端重复序列分析结果 | 第31-35页 |
| ·三物种BAC末端SSR分析 | 第35-42页 |
| ·三物种BAC末端SSR鉴定结果概况 | 第35-36页 |
| ·三物种BAC末端不同重复单元的分布 | 第36-40页 |
| ·三物种BAC末端SSR分布比较分析 | 第40-42页 |
| ·甘蓝型油菜BAC末端序列比对及在TN遗传图谱上的定位 | 第42-50页 |
| ·甘蓝型油菜BAC末端序列与拟南芥双端比对 | 第42-45页 |
| ·甘蓝型油菜BAC末端序列与拟南芥双端比对流程及结果 | 第42-43页 |
| ·基于与拟南芥的双端比对结果进行的遗传图谱定位 | 第43-45页 |
| ·甘蓝型油菜BAC末端序列与白菜A3、A9染色体的BAC序列比对 | 第45-50页 |
| ·甘蓝型油菜BAC末端序列与白菜A3、A9的BAC比对流程及结果 | 第45-47页 |
| ·基于与白菜BAC双端比对结果进行的遗传图谱定位 | 第47-50页 |
| ·小结 | 第50-52页 |
| 4、甘蓝型油菜、白菜、甘蓝的EST序列分析 | 第52-64页 |
| ·三物种EST序列信息简介 | 第52页 |
| ·三物种EST序列信息来源 | 第52页 |
| ·三物种EST序列信息概况 | 第52页 |
| ·三物种EST分析方法 | 第52-56页 |
| ·EST序列分析工具 | 第52-54页 |
| ·EST序列分析流程 | 第54-56页 |
| ·EST序列的预处理 | 第54页 |
| ·EST序列的拼接及Unigene预测及SSR鉴定 | 第54页 |
| ·EST的ORF预测 | 第54-56页 |
| ·三物种EST分析结果 | 第56-62页 |
| ·EST的拼接及UGMS鉴定结果 | 第56页 |
| ·三物种UGMS在不同基因组区域的分布 | 第56-59页 |
| ·三物种全部UGMS在不同基因在区域中的分布 | 第56-57页 |
| ·三物种的全长cDNA中UGMS在不同基因组区域的分布 | 第57-59页 |
| ·三物种UGMS不同motif在不同基因组区域的差异分布 | 第59-61页 |
| ·三物种翻译区的氨基酸差异分布 | 第61-62页 |
| ·小结 | 第62-64页 |
| 5.讨论 | 第64-67页 |
| ·BAC末端序列分析的作用及意义 | 第64-65页 |
| ·EST-SSR分析的作用及意义 | 第65页 |
| ·生物信息学对生物学工作者的作用及发展前景 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-77页 |
| 附录 | 第77-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
