| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-30页 |
| ·质粒性质 | 第10-19页 |
| ·质粒长度 | 第10页 |
| ·质粒拷贝数 | 第10-11页 |
| ·质粒的不稳定性 | 第11-12页 |
| ·质粒载体不稳定性的类型 | 第11-12页 |
| ·影响质粒载体稳定性的因素 | 第12页 |
| ·质粒的复制方式 | 第12-15页 |
| ·Theta型复制 | 第13-14页 |
| ·滚环复制 | 第14-15页 |
| ·单链替换 | 第15页 |
| ·序列分析 | 第15-19页 |
| ·质粒基因组概况 | 第15-16页 |
| ·核酸序列检索 | 第16页 |
| ·分子质量、碱基组成、碱基分布 | 第16页 |
| ·序列变换 | 第16页 |
| ·限制性酶切分析 | 第16-17页 |
| ·克隆测序分析 | 第17-18页 |
| ·基于核酸序列对齐分析的功能预测 | 第18页 |
| ·开放阅读框分析 | 第18-19页 |
| ·引物设计 | 第19页 |
| ·向数据库中提交核酸序列 | 第19页 |
| ·质粒来源 | 第19-21页 |
| ·宿主来源 | 第19-21页 |
| ·真核生物中的质粒 | 第20页 |
| ·古细菌中的质粒 | 第20-21页 |
| ·生境来源 | 第21页 |
| ·细菌质粒提取 | 第21-23页 |
| ·质粒提取的原理 | 第21-22页 |
| ·质粒提取的一般方法 | 第22-23页 |
| ·碱裂解法 | 第22页 |
| ·煮沸裂解 | 第22页 |
| ·羟基磷灰石柱层析法 | 第22-23页 |
| ·酸酚法 | 第23页 |
| ·海洋细菌中质粒的研究进展 | 第23-26页 |
| ·海洋菌群中质粒的分离方法 | 第23-24页 |
| ·细菌培养依赖型方法 | 第23-24页 |
| ·细菌培养非依赖型方法 | 第24页 |
| ·筛选环境中的DNA | 第24页 |
| ·海洋质粒复制子的分离 | 第24页 |
| ·海洋微生物群落中的质粒多样性 | 第24-25页 |
| ·海洋微生物群落中的质粒迁移 | 第25-26页 |
| ·立题依据和研究意义 | 第26-30页 |
| 第二章 极地海冰细菌质粒的筛选、序列分析及性质描述 | 第30-50页 |
| ·材料和方法 | 第30-34页 |
| ·实验材料 | 第30-32页 |
| ·菌株 | 第30页 |
| ·试剂和药品 | 第30-31页 |
| ·培养基 | 第31-32页 |
| ·主要仪器 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-34页 |
| ·菌株的培养和保存 | 第32页 |
| ·含有质粒的菌株的筛选 | 第32-33页 |
| ·质粒的酶切和连接 | 第33页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备与转化 | 第33页 |
| ·极地海冰细菌P.sp.BSi20327和P.sp.BSi20429基因组DNA的提取及16SrDNA序列比对 | 第33-34页 |
| ·极地海冰细菌P.sp.BSi20327和P.sp.BSi20429的总RNA提取 | 第34页 |
| ·总RNA中DNA的去除及反转录实验 | 第34页 |
| ·质粒序列分析 | 第34页 |
| ·Southern blot | 第34页 |
| ·结果与分析 | 第34-46页 |
| ·质粒pSM327和pSM429的分离纯化和测序 | 第34-41页 |
| ·质粒图谱绘制 | 第41-42页 |
| ·质粒开放阅读框分析 | 第42-44页 |
| ·质粒开放阅读框转录活性检测 | 第44-45页 |
| ·质粒复制方式研究 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-50页 |
| 第三章 胶州湾沉积物细菌中质粒的筛选及序列分析 | 第50-70页 |
| ·材料和方法 | 第50-52页 |
| ·实验材料 | 第50-51页 |
| ·菌株 | 第50-51页 |
| ·试剂和药品 | 第51页 |
| ·培养基 | 第51页 |
| ·主要仪器 | 第51页 |
| ·实验方法 | 第51-52页 |
| ·菌株的培养和保存 | 第51页 |
| ·含有质粒的菌株的筛选 | 第51页 |
| ·质粒的酶切和连接 | 第51页 |
| ·含有质粒的胶州湾细菌基因组的提取及16S rDNA序列比对 | 第51页 |
| ·总RNA提取、DNA的去除以及反转录实验 | 第51-52页 |
| ·质粒序列分析 | 第52页 |
| ·结果与分析 | 第52-66页 |
| ·质粒的分离纯化及测序 | 第52-58页 |
| ·含质粒菌株的16S rDNA序列比对 | 第58-59页 |
| ·质粒图谱绘制以及序列分析 | 第59-65页 |
| ·质粒pA5-5的图谱绘制、比对结果及序列分析 | 第59-62页 |
| ·质粒pB2-12的图谱绘制、比对结果及序列分析 | 第62-64页 |
| ·光细菌属三株细菌中质粒的比对结果与分析 | 第64-65页 |
| ·质粒开放阅读框转录活性检测 | 第65-66页 |
| ·讨论 | 第66-70页 |
| 参考文献 | 第70-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
