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组蛋白甲基化位点结合结构域的结构与功能研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
目录第9-12页
第一章 绪论第12-42页
   ·表观遗传调控简介第12-16页
     ·DNA甲基化第12页
     ·染色质重塑第12-14页
     ·非编码RNA调控第14-16页
     ·组蛋白修饰第16页
   ·组蛋白的翻译后修饰与“组蛋白密码”第16-21页
     ·组蛋白乙酰化第17-18页
     ·组蛋白磷酸化第18页
     ·组蛋白泛素化和组蛋白SUMO化第18-20页
     ·组蛋白的其他修饰方式第20-21页
   ·组蛋白的甲基化与去甲基化第21-27页
     ·赖氨酸甲基化第21-23页
     ·精氨酸甲基化第23-24页
     ·去甲基化与去甲基化转移酶第24-26页
     ·甲基化与其他修饰方式的关系第26-27页
   ·组蛋白甲基化位点结合结构域第27-30页
   ·选题意义及主要研究内容第30-32页
 参考文献第32-42页
第二章 酿酒酵母中SAGA复合物Sgf29亚基的结构与功能研究第42-90页
   ·引言第42-44页
   ·实验材料与方法第44-62页
     ·Sgf29表达质粒构建第44-48页
     ·蛋白表达与纯化第48-51页
     ·Sgf29与甲基化组蛋白多肽的相互作用第51-52页
     ·蛋白质结晶,数据收集及结构解析第52-53页
     ·酵母菌株,培养基,质粒构建及酵母感受态制备与转化第53-56页
     ·半定量酵母表型实验(Semi-quantitative growth assay)第56页
     ·酿酒酵母孢子形成实验(Sporulation assay)第56-57页
     ·酵母细胞活体线粒体染色第57页
     ·酵母细胞mRNA提取与荧光定量PCR(qRT-PCR)第57-58页
     ·组蛋白乙酰化水平的Western Blotting检测第58-59页
     ·染色质免疫共沉淀(ChIP)第59-60页
     ·串联亲和层析(TAP)第60-61页
     ·乙酰转移酶活性检测(HAT assays)第61-62页
   ·结果与讨论第62-85页
     ·Sgf29的tandem Tudor结构域特异性识别组蛋白H3K4me2/3第62-63页
     ·Sgf29结构模型的质量评估第63-69页
     ·Sgf29的tandem Tudor结构域的整体结构第69-70页
     ·Sgf29特异性结合组蛋白H3K4me2/3的结构基础第70-73页
     ·Sgf29与其他蛋白的tandem Tudor结构域的结构比较第73-75页
     ·Sgf29与甲基化H3K4结合对SAGA复合物乙酰转移酶活性的作用第75-77页
     ·Sgf29对SAGA复合物的招募的作用第77-81页
     ·Sgf29对酵母以甘油/乙醇为碳源时的生长是必需的第81-82页
     ·Sgf29的缺失导致酵母细胞线粒体丢失第82-85页
   ·本章小结第85-86页
 参考文献第86-90页
第三章 人源异染色质蛋白Cbx3的结构与功能研究第90-110页
   ·引言第90-91页
   ·实验材料与方法第91-94页
     ·表达质粒构建第91-92页
     ·蛋白表达纯化第92-93页
     ·等温量热滴定(1TC)第93-94页
     ·蛋白质结晶、数据收集及结构解析第94页
   ·结果与讨论第94-104页
     ·Cbx3 Chromo结构域特异性识别甲基化组蛋白H1和G9a第94-96页
     ·Cbx3 Chromo结构域结构模型的质量评估第96-101页
     ·Cbx3 Chromo结构域结合甲基化组蛋白H1K26和G9aK185的结构基础第101-102页
     ·Cbx3 Chromo结构域结合甲基化组蛋白H3K9、H1K26和G9aK185多肽的复合物结构的比较第102-104页
   ·本章小结第104-106页
 参考文献第106-110页
第四章 人源有丝分裂M期磷蛋白Mpp8的结构与功能研究第110-132页
   ·引言第110-111页
   ·实验材料与方法第111-113页
     ·表达质粒构建第111页
     ·蛋白表达纯化第111-112页
     ·表面等离子共振实验(SPR)第112页
     ·等温量热滴定(ITC)第112-113页
     ·蛋白质结晶、数据收集及结构解析第113页
   ·结果与讨论第113-126页
     ·Mpp8 Chromo结构域结构模型的质量评估第113-118页
     ·Mpp8 Chromo结构域的结构分析第118-119页
     ·Mpp8 Chromo结构域特异性识别甲基化组蛋白H3K9的结构基础第119-124页
     ·Mpp8 Chromo结构域与其他蛋白Chromo结构域的结构比较第124-126页
   ·本章小结第126-128页
 参考文献第128-132页
致谢第132-134页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第134-135页

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