| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| 符号说明及缩写词 | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-33页 |
| ·粘细菌简介 | 第16-23页 |
| ·粘细菌的基本特征及分类地位 | 第16-17页 |
| ·粘细菌社会学行为特征 | 第17-21页 |
| ·双运动系统支配的菌株滑行运动 | 第17-19页 |
| ·子实体的发育及抗逆性粘孢子的形成 | 第19-20页 |
| ·自然环境下的群体捕食行为 | 第20-21页 |
| ·粘细菌次级代谢产物 | 第21-23页 |
| ·粘细菌次级代谢产物种类及特点 | 第21-22页 |
| ·纤维堆囊菌及其次级代谢产物研究 | 第22-23页 |
| ·海洋耐盐橙色粘球菌HW-1研究进展 | 第23-25页 |
| ·海洋耐盐粘细菌特殊的海洋环境适应模式 | 第23-24页 |
| ·HW-1环境适应分子机制研究进展 | 第24-25页 |
| ·基因组最小化研究进展 | 第25-31页 |
| ·合成生物学简介 | 第25-26页 |
| ·基因组最小化 | 第26-27页 |
| ·基因组岛研究进展 | 第27-31页 |
| ·基因组岛的定义及生物学功能 | 第28-29页 |
| ·基因组岛的特征及预测方法 | 第29-31页 |
| ·本论文开展思路和研究内容 | 第31-33页 |
| 第二章 粘球菌DK1622基因组岛预测与基因必需性分析 | 第33-58页 |
| ·实验材料 | 第34-40页 |
| ·粘球菌基因组信息 | 第34页 |
| ·生物信息数据库及分析软件 | 第34页 |
| ·菌株及质粒 | 第34-37页 |
| ·培养基 | 第37页 |
| ·试剂和仪器耗材 | 第37-40页 |
| ·室验方法 | 第40-45页 |
| ·DK1622基因组岛预测分析方法 | 第40页 |
| ·基因组测序和比较基因组方法 | 第40-41页 |
| ·报告基因融合表达载体构建方法 | 第41-44页 |
| ·引物的设计及合成 | 第41-42页 |
| ·同源臂片段的扩增及纯化 | 第42页 |
| ·同源臂片段与质粒的连接及转化 | 第42-44页 |
| ·表达载体电转化及突变株的筛选 | 第44页 |
| ·X-gal底物平板显色实验 | 第44-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-56页 |
| ·DK1622的基因组岛预测结果 | 第45-48页 |
| ·M.xanthusDK1622和M.fulvusHW-1比较基因组 | 第48-49页 |
| ·基因组岛的表达分析结果 | 第49-56页 |
| ·报告基因融合表达载体构建 | 第49-53页 |
| ·表达载体的电转化及突变株筛选 | 第53-54页 |
| ·表达菌株的X-gal底物平板检测 | 第54-56页 |
| ·本章小结 | 第56-58页 |
| 第三章 基因组岛的敲除及突变株的表型特征分析 | 第58-84页 |
| ·实验材料 | 第59-61页 |
| ·菌株及质粒 | 第59-60页 |
| ·培养基 | 第60页 |
| ·实验试剂 | 第60-61页 |
| ·室验方法 | 第61-67页 |
| ·基因组岛敲除载体的构建 | 第61-64页 |
| ·引物的设计及合成 | 第61-62页 |
| ·同源臂的扩增及连接 | 第62-63页 |
| ·同源臂片段和质粒的预处理 | 第63-64页 |
| ·质粒和同源臂的连接及转化 | 第64页 |
| ·敲除载体电转化野生株DK1622 | 第64-65页 |
| ·基因组岛敲除突变株的筛选及纯化 | 第65-66页 |
| ·基因组岛敲除突变株的表型特征分析 | 第66-67页 |
| ·生长能力分析 | 第66页 |
| ·子实体发育及生孢能力分析 | 第66页 |
| ·菌落边缘观察及运动能力分析 | 第66-67页 |
| ·捕食能力分析 | 第67页 |
| ·实验结果与分析 | 第67-82页 |
| ·基因组岛敲除载体的构建及验证 | 第67-70页 |
| ·基因组岛敲除突变株的筛选及纯化 | 第70-72页 |
| ·基因组岛敲除突变株的表型特征分析 | 第72-82页 |
| ·生长能力的分析 | 第72-73页 |
| ·菌落边缘及运动能力分析 | 第73-75页 |
| ·子实体发育及粘孢子形成能力的分析 | 第75-80页 |
| ·捕食能力的分析 | 第80-82页 |
| ·本章小结 | 第82-84页 |
| 总结与展望 | 第84-86页 |
| 附录1 论文涉及的引物信息 | 第86-91页 |
| 附录1.1 报告基因融合表达载体构建所需引物信息 | 第86-88页 |
| 附录1.2 基因组岛定点敲除载体构建所需引物信息 | 第88-91页 |
| 附录2 论文相关的质粒信息 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第103-104页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第104-105页 |
| 附件 | 第105-107页 |