| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-10页 |
| 第一章 鲫鱼PKR-like Zα结构域与核酸的亲和性 | 第10-39页 |
| 1 综述 | 第10-21页 |
| ·Z-DNA的存在 | 第10-11页 |
| ·Z-DNA结构与功能 | 第11-15页 |
| ·B-DNA与Z-DNA的junction | 第12-14页 |
| ·Z-DNA的形成及功能 | 第14-15页 |
| ·Z-DNA结合蛋白家族 | 第15-18页 |
| ·ADAR1 | 第15-16页 |
| ·痘类病毒E3L | 第16页 |
| ·DLM-1(ZBP1) | 第16-17页 |
| ·鱼类PKR-like(PKZ) | 第17-18页 |
| ·Zα的结构 | 第18-20页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-29页 |
| ·主要仪器设备 | 第21页 |
| ·主要试剂、试剂盒 | 第21-22页 |
| ·质粒和菌株 | 第22页 |
| ·相关软件 | 第22页 |
| ·Zα蛋白定点突变 | 第22-25页 |
| ·引物设计 | 第22-24页 |
| ·质粒模板处理 | 第24页 |
| ·PCR扩增突变产物 | 第24-25页 |
| ·测序鉴定 | 第25页 |
| ·原核表达 | 第25-26页 |
| ·His-Bind蛋白纯化 | 第26-27页 |
| ·超声波破碎细菌 | 第26页 |
| ·His-Hind亲和层析 | 第26页 |
| ·透析 | 第26-27页 |
| ·Bradford法测定蛋白质浓度 | 第27-28页 |
| ·标准曲线的测定 | 第27页 |
| ·样品的测定 | 第27页 |
| ·数据处理 | 第27-28页 |
| ·重组d(GC)_(13)质粒的构建 | 第28页 |
| ·凝胶阻滞实验 | 第28-29页 |
| 3 实验结果 | 第29-36页 |
| ·PCR法定点突变 | 第29-30页 |
| ·蛋白原核表达及纯化 | 第30-31页 |
| ·蛋白质浓度测定 | 第31-32页 |
| ·d(GC)_(13)重组质粒的构建 | 第32-33页 |
| ·Zα蛋白与质粒DNA的结合 | 第33-34页 |
| ·负超螺旋对Zα蛋白结合质粒DNA的影响 | 第34页 |
| ·Zα蛋白与PolyI∶C的结合 | 第34-36页 |
| 4 讨论 | 第36-39页 |
| 第二章 Zα及趋化因子等蛋白的适应性进化分析 | 第39-64页 |
| 1 引言 | 第39-42页 |
| ·最大似然法模型 | 第39-40页 |
| ·密码子替换模型 | 第40-41页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第41-42页 |
| 2 材料与方法 | 第42-44页 |
| ·序列材料 | 第42页 |
| ·相关软件 | 第42页 |
| ·适应性进化分析 | 第42-43页 |
| ·序列的系统发生分析 | 第42页 |
| ·密码子替换模型的参数估计 | 第42-43页 |
| ·SWISS-MODEL同源模建 | 第43-44页 |
| 3 实验结果 | 第44-59页 |
| ·Zα的适应性进化分析 | 第44-46页 |
| ·Zα1同源序列系统发生树 | 第44-45页 |
| ·Zα1正选择检验 | 第45-46页 |
| ·Zα结构域的SWISS-MODEL同源模建 | 第46-47页 |
| ·干扰素的适应性进化 | 第47-50页 |
| ·哺乳类IFN-α的分析 | 第47-49页 |
| ·哺乳类IFN-γ的分析 | 第49-50页 |
| ·转铁蛋白的适应性进化分析 | 第50-54页 |
| ·转铁蛋白的系统发生 | 第51页 |
| ·数据分析 | 第51-54页 |
| ·趋化因子家族的适应性进化分析 | 第54-56页 |
| ·RANTES系统发生分析 | 第54页 |
| ·RANTES的正选择检验 | 第54-56页 |
| ·其他趋化因子基因的正选择检验 | 第56页 |
| ·趋化因子受体家族的适应性进化分析 | 第56-59页 |
| ·CCR5系统发生分析 | 第56-57页 |
| ·CCR5的正选择检验 | 第57-58页 |
| ·其他趋化因子受体正选择检验 | 第58-59页 |
| 4 讨论 | 第59-64页 |
| ·鲫鱼PKR-like Zα的结构保守性 | 第59-60页 |
| ·干扰素适应性进化分析 | 第60-61页 |
| ·转铁蛋白的适应性进化分析 | 第61-62页 |
| ·趋化因子及其受体家族分子适应性进化分析 | 第62-64页 |
| ·RANTES的结构、功能与适应性进化 | 第62页 |
| ·CCR5的结构、功能与适应性进化 | 第62-63页 |
| ·趋化因子及其受体的演化分析 | 第63-64页 |
| 第三章 小结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-73页 |
| 附录1:缩略语 | 第73-75页 |
| 附录2:论文列表 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76页 |