| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-35页 |
| ·猪基因组计划和基因图谱 | 第14-15页 |
| ·猪疾病与抗病力、免疫性状相关的候选基因研究现状 | 第15-21页 |
| ·猪疾病相关的候选基因 | 第15-16页 |
| ·猪免疫性状、抗病力相关候选基因的研究进展 | 第16-18页 |
| ·猪免疫性状与抗病力相关QTL的研究现状 | 第18-20页 |
| ·猪抗病与高免疫力育种的可行性 | 第20-21页 |
| ·蛋白酶体激活因子及其基因研究进展 | 第21-35页 |
| ·蛋白酶体系统的组成成分 | 第21-24页 |
| ·蛋白酶体的生物学功能 | 第24-25页 |
| ·蛋白酶体基因和激活因子基因的成员 | 第25-27页 |
| ·蛋白酶体激活因子PA28基因家族的研究进展 | 第27-32页 |
| ·PSME1和PSME2基因的结构和生物学特性 | 第27-29页 |
| ·PSME3基因的结构和生物学特性 | 第29-30页 |
| ·PA28在MHCI类分子介导的抗原提呈中的作用 | 第30页 |
| ·PA28与一些疾病的关系 | 第30-32页 |
| ·PA700基因家族相关基因的研究进展 | 第32-34页 |
| ·蛋白酶体的应用前景 | 第34-35页 |
| 2 本研究的目的意义 | 第35-36页 |
| 3 材料与方法 | 第36-52页 |
| ·材料 | 第36-39页 |
| ·DNA样品 | 第36-37页 |
| ·组织样品 | 第37页 |
| ·培养基、酶及试剂盒 | 第37页 |
| ·主要试剂 | 第37页 |
| ·试剂的配制 | 第37-38页 |
| ·主要仪器设备 | 第38页 |
| ·主要分子生物学数据库及软件 | 第38-39页 |
| ·方法 | 第39-52页 |
| ·候选基因cDNA全长序列的克隆方法 | 第39-43页 |
| ·PSME1、PSME2和PSMC5基因组DNA全长序列的克隆方法 | 第43-45页 |
| ·PA700相关基因片段的分离方法 | 第45-47页 |
| ·基因物理定位的SCHP和RH方法 | 第47-49页 |
| ·基因的多态性检测方法 | 第49-50页 |
| ·基因多态性与性状的关联分析方法 | 第50-52页 |
| 4 结果 | 第52-106页 |
| ·猪PA28家族PSME1和PSME2基因序列的分离鉴定及相关研究 | 第52-60页 |
| ·总RNA的提取和检测 | 第52页 |
| ·PSME1基因的RACE结果及cDNA序列分析 | 第52-54页 |
| ·PSME2基因的RACE结果及cDNA序列分析 | 第54-55页 |
| ·猪PSME基因家族系统发生树的构建 | 第55-57页 |
| ·猪PSME1和PSME2基因的组织表达谱分析 | 第57页 |
| ·PSME1基因全长基因组DNA的克隆及序列分析 | 第57-58页 |
| ·PSME2基因全长基因组DNA的克隆及序列分析 | 第58-60页 |
| ·PSME1基因和PSME2基因剪切位点的分析 | 第60页 |
| ·PSME1和PSME2基因的物理定位结果 | 第60-63页 |
| ·SCHP的染色体区域定位结果 | 第60-62页 |
| ·IMpRH的染色体精细定位结果 | 第62-63页 |
| ·PSME1基因多态性的检测及其与性状的关联分析 | 第63-66页 |
| ·PSME1基因第八内含子SphI酶切多态的检测 | 第63-64页 |
| ·PSME1基因第八内含子SphI酶切多态在不同猪群中的检测 | 第64-65页 |
| ·PSME1基因SphI多态的遗传方式检测 | 第65页 |
| ·PSME1基因与部分生产性状的关联分析 | 第65-66页 |
| ·PA700相关基因全长cDNA的分离、鉴定与序列分析 | 第66-71页 |
| ·PSMC1基因的cDNA序列分析 | 第66-67页 |
| ·PSMC2基因的cDNA序列分析 | 第67页 |
| ·PSMC4基因的cDNA序列分析 | 第67-68页 |
| ·PSMC5基因的cDNA序列分析 | 第68页 |
| ·PSMD4基因的cDNA序列分析 | 第68-69页 |
| ·PSMC1、PSMC2、PSMC4和PSMC5基因的氨基酸序列同源分析 | 第69-70页 |
| ·PSMC5基因的全长基因组DNA序列的克隆及序列分析 | 第70-71页 |
| ·PA700相关基因的基因组DNA序列的分离及鉴定 | 第71-78页 |
| ·电脑克隆和生物信息学研究 | 第71-72页 |
| ·基因扩增产物的序列分析结果 | 第72-77页 |
| ·基因扩增产物的同源性比较及序列鉴定 | 第77-78页 |
| ·猪PA700相关基因的染色体精细定位结果 | 第78-80页 |
| ·猪PA700相关基因的遗传变异分析 | 第80-101页 |
| ·猪PSMC2基因的遗传变异分析 | 第82-84页 |
| ·猪PSMC3基因的遗传变异分析 | 第84-86页 |
| ·猪PSMC5基因的遗传变异分析 | 第86-94页 |
| ·猪PSMC6基因的遗传变异分析 | 第94-96页 |
| ·猪PSMD2基因的遗传变异分析 | 第96-97页 |
| ·猪PSMD3基因的遗传变异分析 | 第97-99页 |
| ·猪PSMD4基因的遗传变异分析 | 第99-101页 |
| ·基因SNPs与部分生产性状、生理指标和免疫性状的关联分析 | 第101-106页 |
| ·PSMC2基因SNP与部分性状的关联分析 | 第102页 |
| ·PSMC3基因SNP与部分性状的关联分析 | 第102-103页 |
| ·PSMC5基因SacI酶切多态与部分性状的关联分析 | 第103-104页 |
| ·PSMC5基因MunI酶切多态与部分性状的关联分析 | 第104页 |
| ·PSMC6基因SNP与部分性状的关联分析 | 第104页 |
| ·PSMD3基因SNP与部分性状的关联分析 | 第104-105页 |
| ·PSMD4基因SNP与部分性状的关联分析 | 第105-106页 |
| 5 讨论 | 第106-118页 |
| ·利用EST数据库快速克隆猪新基因 | 第106页 |
| ·关于总RNA的提取及RACE质量 | 第106-107页 |
| ·关于新分离基因的鉴定问题 | 第107页 |
| ·关于PSME1和PSME2基因的序列分析和结构 | 第107-108页 |
| ·关于PSME基因家族的系统发生树 | 第108-109页 |
| ·关于PA700蛋白酶体激活因子的6个ATPase亚基 | 第109页 |
| ·关于基因的物理定位 | 第109-111页 |
| ·关于定位引物的设计 | 第109-110页 |
| ·关于PSME1和PSME2基因的物理定位结果 | 第110-111页 |
| ·关于PA700蛋白酶体激活因子10个基因的物理定位结果 | 第111页 |
| ·关于寻找基因SNPs的一些想法 | 第111-113页 |
| ·基因变异在不同群体中的分析 | 第113-114页 |
| ·基因多态性与性状的关联分析 | 第114-118页 |
| ·PSME1基因多态性与性状的关联分析 | 第114-115页 |
| ·与背膘厚、生长速度等性状的关系 | 第115-116页 |
| ·与肌肉pH值的关系 | 第116页 |
| ·关于与免疫指标IgG含量的关系 | 第116页 |
| ·关于与血液生理指标的关系 | 第116-118页 |
| 6 小结 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-131页 |
| 附录 | 第131-138页 |
| 在读期间已发表论文题录 | 第138-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
