碳纳米管固定Lip2脂肪酶的分子动力学研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-30页 |
| ·脂肪酶简介 | 第14-17页 |
| ·脂肪酶的概述 | 第14页 |
| ·脂肪酶的结构及其催化机制 | 第14-15页 |
| ·脂肪酶固定化 | 第15-16页 |
| ·非水相体系中脂肪酶的催化反应 | 第16-17页 |
| ·脂肪酶在手性拆分中的应用 | 第17页 |
| ·碳纳米管的简介 | 第17-19页 |
| ·碳纳米管的基本结构 | 第17-18页 |
| ·碳纳米管的结构特性 | 第18-19页 |
| ·Gaussian 简介 | 第19-20页 |
| ·Gaussian03 简介 | 第19页 |
| ·Gaussian03 计算原理 | 第19-20页 |
| ·分子动力学模拟 | 第20-27页 |
| ·分子动力学模拟介绍 | 第20-21页 |
| ·分子动力学方法 | 第21-23页 |
| ·GROMACS 简介 | 第23-26页 |
| ·分子力场简介 | 第26-27页 |
| ·分子动力学模拟在脂肪酶催化机理研究中的应用 | 第27页 |
| ·本课题研究的背景及主要内容 | 第27-30页 |
| ·研究背景 | 第27-28页 |
| ·研究内容 | 第28-30页 |
| 第二章 Lip2 脂肪酶的预处理及溶剂模型的建立 | 第30-40页 |
| ·前言 | 第30-31页 |
| ·固定化酶的建立 | 第31-35页 |
| ·通过共价键连接 Lip2 脂肪酶和碳纳米管 | 第31-32页 |
| ·通过吸附作用形成的固定化酶 | 第32-35页 |
| ·酶的预处理 | 第35-37页 |
| ·溶剂模型的建立 | 第37-39页 |
| ·小结 | 第39-40页 |
| 第三章 游离酶及固定化酶的分子动力学模拟 | 第40-62页 |
| ·前言 | 第40页 |
| ·计算方法 | 第40-41页 |
| ·总体计算方法 | 第40-41页 |
| ·模拟过程中各阶段的参数设置 | 第41页 |
| ·结果与讨论 | 第41-61页 |
| ·整体分析 | 第42-44页 |
| ·与碳纳米管相互作用的残基 | 第44-46页 |
| ·盖子构象的分析 | 第46-49页 |
| ·ED 分析 | 第49-55页 |
| ·氨基酸残基间的最小距离分析 | 第55-59页 |
| ·盐桥和氢键的分析 | 第59-61页 |
| ·小结 | 第61-62页 |
| 第四章 固定酶及游离酶与底物的分子动力学模拟 | 第62-72页 |
| ·前言 | 第62-63页 |
| ·底物分子模型的建立 | 第63-65页 |
| ·分子动力学模拟 | 第65-69页 |
| ·计算方法 | 第65-66页 |
| ·结果与讨论 | 第66-69页 |
| ·小结 | 第69-72页 |
| 第五章 结论 | 第72-74页 |
| ·结论 | 第72页 |
| ·创新 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-78页 |
| 附录 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第82-83页 |
| 作者和导师介绍 | 第83-84页 |
| 硕士研究生学位论文答辩委员会决议书 | 第84-85页 |
