| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-16页 |
| 第1章 绪论 | 第16-40页 |
| ·水环境病原微生物污染及其危害 | 第16-19页 |
| ·病原微生物污染的来源 | 第16页 |
| ·水环境中主要常见病原微生物 | 第16-17页 |
| ·水环境中新型病原微生物 | 第17-18页 |
| ·病原微生物污染的危害 | 第18-19页 |
| ·水环境病原微生物污染控制标准 | 第19-20页 |
| ·水处理工艺对病原微生物去除的措施 | 第20页 |
| ·研究问题的提出 | 第20-22页 |
| ·分子生物学在环境微生物领域的应用 | 第22-37页 |
| ·现代分子生物学检测微生物主要方法与技术 | 第23-26页 |
| ·检测环境微生物分子生物学方法面临的问题 | 第26-28页 |
| ·16S rDNA克隆文库的构建 | 第28-33页 |
| ·16S rDNA克隆文库的分析 | 第33-37页 |
| ·研究区域简介 | 第37-39页 |
| ·本文的研究内容 | 第39-40页 |
| 第2章 内江水体细菌16S rRNA基因文库的建立及分析 | 第40-54页 |
| ·试验材料和方法 | 第40-46页 |
| ·试验材料 | 第40-41页 |
| ·试验方法 | 第41-46页 |
| ·试验结果与分析 | 第46-51页 |
| ·细菌基因组DNA的提取和纯化 | 第46-47页 |
| ·16S rRNA基因的PCR扩增 | 第47页 |
| ·16S rDNA阳性克隆鉴定 | 第47-49页 |
| ·内江水体细菌微生物群落分析 | 第49-50页 |
| ·内江水体中主要病原微生物种属 | 第50-51页 |
| ·讨论 | 第51-54页 |
| 第3章 基子16S rDNA分析的内江水体中主要病原细菌的分离和鉴定 | 第54-68页 |
| ·实验材料 | 第54-55页 |
| ·水样 | 第54页 |
| ·分离培养基 | 第54-55页 |
| ·实验方法 | 第55-59页 |
| ·分离纯化 | 第55页 |
| ·菌落及菌属形态特征观察 | 第55-56页 |
| ·以16S rRNA基因为指标的菌种分类与鉴定 | 第56页 |
| ·溶血性检查 | 第56页 |
| ·敏感性实验 | 第56-57页 |
| ·其他生理生化实验 | 第57页 |
| ·致病性Arcobacter的分子生物学活性检测 | 第57-59页 |
| ·实验结果 | 第59-66页 |
| ·菌落特征和菌体形态 | 第59-61页 |
| ·基于16S rDNA的分类与鉴定 | 第61-62页 |
| ·溶血性 | 第62-63页 |
| ·基于生理生化的鉴定 | 第63页 |
| ·其他基于16S rDNA鉴定的分离菌株 | 第63-64页 |
| ·致病性Arcobacter sp.的活性检测结果 | 第64-66页 |
| ·讨论 | 第66-68页 |
| 第4章 16S rDNA分析内江细菌多样性的最佳克隆库容实验及理论研究 | 第68-80页 |
| ·试验材料和方法 | 第69-71页 |
| ·水样的采集和处理 | 第69页 |
| ·试验材料和分子生物学操作 | 第69页 |
| ·16S rDNA克隆文库的分析方法 | 第69-71页 |
| ·结果与分析 | 第71-78页 |
| ·不同克隆文库库容的内江水体中微生物群落结构分析 | 第71-72页 |
| ·内江水体微生物多样性的统计学方法分析 | 第72-77页 |
| ·反映区域水体细菌多样性的最佳测序克隆库容 | 第77-78页 |
| ·讨论 | 第78-80页 |
| 第5章 内江水体细菌群落结构特征研究 | 第80-94页 |
| ·材料和方法 | 第80-81页 |
| ·采样点 | 第80-81页 |
| ·试验材料和分子操作方法 | 第81页 |
| ·结果与分析 | 第81-91页 |
| ·内江不同区域位置水体中微生物群落结构特征分析 | 第81-84页 |
| ·内江水体中主要细菌群的地理分布特征 | 第84-85页 |
| ·内江水体中主要细菌群落的时间分布特征 | 第85-87页 |
| ·内江水体中主要细菌群落时空分布特征差异分析 | 第87页 |
| ·内江不同区域位置水体中主要病原细菌之间关系 | 第87-90页 |
| ·内江水体中致病性Arcobacter生物信息学分析 | 第90-91页 |
| ·讨论 | 第91-94页 |
| 第6章 内江水体中主要病原菌的溯源研究 | 第94-108页 |
| ·试验材料与方法 | 第94页 |
| ·分析水样来源 | 第94页 |
| ·分子实验操作方法 | 第94页 |
| ·结果与分析 | 第94-106页 |
| ·污水处理厂出水微生物群落分析 | 第94-96页 |
| ·不同来源城市污水中细菌群落结构分析 | 第96-99页 |
| ·不同来源城市污水中主要细菌种群的时空分布特征分析 | 第99-103页 |
| ·内江与不同来源城市污水中主要病原菌之间的关系 | 第103-104页 |
| ·内江与城市污水中主要病原菌生物信息学分析 | 第104-106页 |
| ·讨论 | 第106-108页 |
| 第7章 污水处理工艺对病原微生物去除效果 | 第108-120页 |
| ·材料和方法 | 第108-109页 |
| ·水样采集 | 第108页 |
| ·试验材料与分子生物学操作 | 第108页 |
| ·污水处理技术工艺 | 第108-109页 |
| ·结果 | 第109-117页 |
| ·污水处理厂进水水样中微生物群落分析 | 第109-111页 |
| ·污水处理工艺Ⅰ对主要细菌种群结构的影响 | 第111-113页 |
| ·污水处理工艺Ⅱ对主要病原微生物种结构的影响 | 第113-115页 |
| ·不同处理工艺对污水细菌克隆数的影响 | 第115-116页 |
| ·两种处理工艺对微生物种群结构影响的相关性分析 | 第116-117页 |
| ·讨论 | 第117-120页 |
| 第8章 结论与展望 | 第120-124页 |
| ·主要研究内容与结论 | 第120-121页 |
| ·创新点 | 第121-122页 |
| ·展望 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-134页 |
| 致谢 | 第134-136页 |
| 读博期间相关科研成果 | 第136-138页 |
| 一、攻读博士学位期间发表的论文 | 第136页 |
| 二、申请和授权专利 | 第136页 |
| 三、攻读博士学位期间参加的科研项目 | 第136-138页 |
| 附录 | 第138-147页 |
| Ⅰ 缩略语表 | 第138页 |
| Ⅱ 主要实验仪器 | 第138-139页 |
| Ⅲ 主要试剂及配制 | 第139-141页 |
| Ⅳ 软件计算中导入的文本数据 | 第141-147页 |
