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高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息学分析及验证

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
缩略词对照表第9-10页
第一篇 文献综述第10-40页
 第一章 植物细胞程序性死亡及其研究进展第10-16页
  1 细胞坏死与细胞程序性死亡第10页
  2 植物细胞程序性死亡的特征第10-12页
  3 植物细胞程序性死亡的调控因子第12-13页
   ·活性氧第12页
   ·与植物PCD相关的蛋白第12-13页
  4 逆境条件下的细胞程序性死亡第13-16页
   ·生物胁迫诱导的植物细胞程序性死亡第13-14页
   ·非生物胁迫诱导的植物细胞程序性死亡第14-16页
 第二章 植物细胞程序性死亡中的类caspase蛋白酶第16-24页
  1 植物半胱氨酸蛋白酶概述第16-17页
   ·参与贮存蛋白沉积和降解第16页
   ·参与植物对胁迫的响应第16-17页
   ·参与衰老和细胞程序性死亡第17页
  2 植物中的类caspase蛋白酶第17-24页
   ·Metacaspases第18-19页
   ·Saspase第19页
   ·液泡加工酶第19-24页
 第三章 生物信息学研究进展第24-30页
  1. 生物信息学概述第24页
  2. 生物信息学的产生和发展第24-25页
  3. 生物信息学的研究内容第25-28页
   ·生物信息学数据库第25-26页
   ·基因组信息学的研究第26-27页
   ·蛋白质组信息学的研究第27-28页
  4 生物信息学的发展趋势第28-30页
   ·研究目标由组成转向功能第28页
   ·研究内容由静态转向动态第28-29页
   ·研究角度由局部性转向整体性第29页
   ·研究方法由单一转向综合第29-30页
 参考文献第30-40页
第二篇 研究论文第40-68页
 第一章 高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息学分析第40-62页
  1 前言第40-41页
  2 材料和方法第41-43页
   ·数据库的查询和搜索第41页
   ·序列联配和系统进化树分析第41-42页
   ·基序分析和亚细胞定位分析第42-43页
  3 结果与分析第43-60页
   ·水稻和拟南芥中VPE基因的鉴定第43-47页
   ·拟南芥和水稻中VPE蛋白的系统进化树分析第47-50页
   ·拟南芥和水稻中VPE蛋白的保守序列分析第50-55页
   ·拟南芥和水稻中VPE蛋白的亚细胞定位分析第55-60页
  4 本章小结第60-62页
 第二章 盐胁迫诱导水稻根尖细胞PCD过程中VPE转录水平变化第62-66页
  1 前言第62页
  2 材料与方法第62-64页
   ·水稻的培养第62页
   ·总RNA的提取第62-64页
   ·RT-PCR第64页
  3 结果与分析第64-65页
  4 本章小结第65-66页
 参考文献第66-68页
全文结论第68-70页
创新之处第70-72页
致谢第72-74页
攻读学位期间发表的论文第74页

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