| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-30页 |
| 1 研究意义 | 第15-16页 |
| 2 研究概况及趋势 | 第16-29页 |
| ·分子标记的特点 | 第16-23页 |
| ·Sequence-related amplified polymorphism(SRAP)标记 | 第18-20页 |
| ·EST-SSR标记技术 | 第20-22页 |
| ·叶绿体SSR(cpSSR)标记技术 | 第22-23页 |
| ·柑橘分子标记的研究发展趋势 | 第23页 |
| ·核基因组和叶绿体基因组分析 | 第23-24页 |
| ·湖南宽皮柑橘的血缘与起源分析 | 第24-27页 |
| ·宽皮柑橘的分类 | 第25-26页 |
| ·宽皮柑橘的演化 | 第26-27页 |
| ·湖南的宽皮柑橘资源 | 第27-29页 |
| ·湖南栽培的宽皮柑橘资源 | 第27-28页 |
| ·湖南宽皮柑橘的野生资源 | 第28-29页 |
| 3 研究的目的和内容 | 第29-30页 |
| 第二章 宽皮柑橘SRAP和EST-SSR反应体系的建立 | 第30-42页 |
| 第一节 宽皮柑橘SRAP反应体系建立及引物筛选 | 第30-37页 |
| 1 材料与方法 | 第30-33页 |
| ·供试材料 | 第30页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第30-31页 |
| ·主要仪器 | 第30页 |
| ·主要试剂 | 第30-31页 |
| ·方法 | 第31-33页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第31-32页 |
| ·反应体系设计 | 第32页 |
| ·PCR扩增程序选择 | 第32页 |
| ·引物筛选 | 第32-33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-35页 |
| ·DNA提取与检测 | 第33页 |
| ·SRAP反应体系的建立 | 第33-34页 |
| ·Mg~(2+)浓度筛选 | 第33页 |
| ·DNA含量筛选 | 第33-34页 |
| ·dNTP含量筛选 | 第34页 |
| ·Taq酶含量筛选 | 第34页 |
| ·引物筛选的结果 | 第34-35页 |
| 3 讨论 | 第35-36页 |
| 4 小结 | 第36-37页 |
| 第二节 宽皮柑橘EST-SSR反应体系建立 | 第37-42页 |
| 1 材料与方法 | 第37-38页 |
| ·供试材料 | 第37页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第37页 |
| ·PCR扩增程序选择 | 第37页 |
| ·引物筛选 | 第37-38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-40页 |
| ·EST-SSR反应体系的建立 | 第38-39页 |
| ·Mg~(2+)浓度筛选 | 第38页 |
| ·DNA含量筛选 | 第38-39页 |
| ·dNTP含量筛选 | 第39页 |
| ·Taq酶含量筛选 | 第39页 |
| ·EST-SSR引物的筛选 | 第39-40页 |
| 3 讨论 | 第40-41页 |
| 4 小结 | 第41-42页 |
| 第三章 宽皮柑橘的SRAP和EST-SSR标记分析 | 第42-68页 |
| 第一节 宽皮柑橘及其近缘种SRAP和EST-SSR的大类分析 | 第42-48页 |
| 1 材料与方法 | 第42-43页 |
| ·供试材料 | 第42-43页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第43页 |
| ·PCR扩增程序选择 | 第43页 |
| ·数据统计分析 | 第43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-46页 |
| ·扩增图谱 | 第43-44页 |
| ·SRAP扩增图谱 | 第43-44页 |
| ·EST-SSR扩增图谱 | 第44页 |
| ·遗传多样性分析 | 第44-46页 |
| 3 讨论 | 第46-47页 |
| 4 小结 | 第47-48页 |
| 第二节 野生宽皮柑橘型的SRAP和EST-SSR分析 | 第48-54页 |
| 1 材料 | 第48-50页 |
| 2 结果与分析 | 第50-51页 |
| ·扩增图谱 | 第50页 |
| ·SRAP扩增图谱 | 第50页 |
| ·EST-SSR扩增图谱 | 第50页 |
| ·遗传多样性分析 | 第50-51页 |
| 3 讨论 | 第51-52页 |
| 4 小结 | 第52-54页 |
| 第三节 温州蜜柑品种类别的SRAP和EST-SSR分析 | 第54-58页 |
| 1 材料 | 第54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-56页 |
| ·扩增图谱 | 第54-55页 |
| ·SRAP扩增图谱 | 第54页 |
| ·EST-SSR扩增图谱 | 第54-55页 |
| ·遗传多样性分析 | 第55-56页 |
| 3 讨论 | 第56-57页 |
| 4 小结 | 第57-58页 |
| 第四节 宜昌橙类型的SRAP和EST-SSR分析 | 第58-62页 |
| 1 宜昌橙及香橙分析材料 | 第58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-60页 |
| ·扩增图谱 | 第58-59页 |
| ·SRAP扩增图谱 | 第58页 |
| ·EST-SSR扩增图谱 | 第58-59页 |
| ·遗传多样性分析 | 第59-60页 |
| 3 讨论 | 第60-61页 |
| 4 小结 | 第61-62页 |
| 第五节 地方品种和杂柑类型的SRAP和EST-SSR分析 | 第62-68页 |
| 1 杂柑分析材料 | 第62-63页 |
| 2 结果与分析 | 第63-66页 |
| ·扩增图谱 | 第63页 |
| ·SRAP扩增图谱 | 第63页 |
| ·EST-SSR扩增图谱 | 第63页 |
| ·遗传多样性分析 | 第63-66页 |
| 3 讨论 | 第66-67页 |
| 4 小结 | 第67-68页 |
| 第四章 宽皮柑橘的叶绿体SSR分析序列测定 | 第68-79页 |
| 1 前言 | 第68页 |
| 2 材料与方法 | 第68-72页 |
| ·用于cpSSR分析的材料 | 第68-69页 |
| ·方法 | 第69-70页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第69页 |
| ·引物来源 | 第69-70页 |
| ·反应体系 | 第70页 |
| ·总反应体系 | 第70页 |
| ·PCR反应程序 | 第70页 |
| ·电泳 | 第70页 |
| ·PCR扩增产物的回收与纯化 | 第70页 |
| ·纯化产物的克隆、测序 | 第70-72页 |
| ·PCR扩增片段的克隆 | 第70-71页 |
| ·鉴定携带重组质粒的克隆 | 第71-72页 |
| ·发阳性克隆测序 | 第72页 |
| ·生物信息学分析 | 第72页 |
| ·多态性位点的序列分析 | 第72页 |
| 3 结果与分析 | 第72-77页 |
| ·核酸序列测定结果 | 第72页 |
| ·采用DNAMAN软件的序列同源性分析 | 第72-75页 |
| ·DNA序列比对分析图 | 第75页 |
| ·SSRHunter1.3软件分析结果 | 第75-77页 |
| 3 讨论 | 第77-78页 |
| 4 小结 | 第78-79页 |
| 结论 | 第79-80页 |
| 论文创新点 | 第80-81页 |
| 下一步工作设想 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 个人简历 | 第96-98页 |
| 附录 | 第98-104页 |
| 附表1 用于筛选的SRAP引物 | 第98-99页 |
| 附表2 用于筛选的EST-SSR引物 | 第99-101页 |
| 附表3 用于筛选的cpSSR引物 | 第101-102页 |
| 附表4 部分样品的叶绿体基因组序列 | 第102-104页 |
| 图版和说明 | 第104-120页 |
