酵母重复基因的适应性进化
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| ·重复基因 | 第11-12页 |
| ·重复基因的概念及产生缘由 | 第11页 |
| ·同源基因的分类 | 第11页 |
| ·重复基因的研究历史 | 第11-12页 |
| ·适应性进化 | 第12-13页 |
| ·什么是适应性进化 | 第12页 |
| ·适应性进化理论的发展历史 | 第12-13页 |
| ·正选择与适应性进化的关系 | 第13页 |
| ·基因重复的进化机制 | 第13-14页 |
| ·适应性进化机制 | 第13-14页 |
| ·非适应性进化机制 | 第14页 |
| ·正选择的直接判断指标d_N和d_S | 第14-15页 |
| ·用于正选择探测的基本工具PAML | 第15-21页 |
| ·PAML概述 | 第15-16页 |
| ·位点模型 | 第16-17页 |
| ·枝长-位点模型 | 第17页 |
| ·codeml的控制文件 | 第17-21页 |
| 第二章 引言 | 第21-23页 |
| ·研究的背景与意义 | 第21页 |
| ·研究的主要内容 | 第21-22页 |
| ·技术路线 | 第22-23页 |
| 第三章 实验材料与方法 | 第23-27页 |
| ·实验数据 | 第23-24页 |
| ·数据背景 | 第23页 |
| ·数据源 | 第23页 |
| ·原始数据的处理及筛选 | 第23-24页 |
| ·实验方法 | 第24-27页 |
| 第四章 结果与分析 | 第27-37页 |
| ·酵母中重复基因的适应性进化证据 | 第27-29页 |
| ·正选择位点的探测 | 第27-28页 |
| ·Gene Ontology | 第28-29页 |
| ·适应性进化基因的重复模型判定 | 第29-35页 |
| ·功能验证 | 第35页 |
| ·错误发现率的计算 | 第35-37页 |
| 第五章 讨论 | 第37-41页 |
| ·分析数据的筛选 | 第37页 |
| ·基因转换 | 第37-38页 |
| ·功能验证 | 第38页 |
| ·本研究所采用的方法策略 | 第38-41页 |
| 第六章 总结 | 第41-43页 |
| ·啤酒酵母重复基因正选择证据 | 第41页 |
| ·适应性进化模型的鉴定 | 第41页 |
| ·研究方法的创新 | 第41-43页 |
| 参考文献 | 第43-49页 |
| 硕士在读期间发表的论文 | 第49-51页 |
| 附表 | 第51-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
