摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
CHAPTER Ⅰ INTRODUCTION | 第17-30页 |
1.1 BACKGROUND | 第17页 |
1.2 ENDOPHYTES | 第17页 |
1.3 ENTRY OF ENDOPHYTES IN TO THE HOST PLANTS | 第17-18页 |
1.4 BENEFICIAL FUNCTIONS OF ENDOPHYTES FOR PLANTS | 第18-21页 |
1.4.1 ENHANCE PHYTOSTIMULATION | 第18-19页 |
1.4.2 NITROGEN FIXATION | 第19-20页 |
1.4.3 PHOSPHATE SOLUBILIZATION ABILITY OF ENDOPHYTES | 第20-21页 |
1.4.4 IRON HOMEOSTASIS | 第21页 |
1.4.5 ROLE IN INDUCED SYSTEMIC TOLERANCE | 第21页 |
1.5 GENES RELATED TO NITROGEN FIXATION | 第21-22页 |
1.6 MIRACULOUS DIAZOTROPHIC BACTERIA | 第22-25页 |
1.6.1 BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION OF DIAZOTROPHS | 第22页 |
1.6.2 SYMBIOTIC NITROGEN FIXERS PIONEERS FOR BNF | 第22-23页 |
1.6.2.1 IMPORTANCE OF SYMBIOTIC NITROGEN FIXATION IN LEGUMES | 第22页 |
1.6.2.2 ROLE OF SYMBIOTIC NITROGEN FIXATION IN NON-LEGUMES | 第22-23页 |
1.6.3 EFFECT OF ASSOCIATIVE DIAZOTROPHIC NITROGEN FIXERS | 第23页 |
1.6.4 ENDOPHYTIC DIAZOTROPHIC NITROGEN FIXERS | 第23页 |
1.6.5 FREE LIVING NITROGEN FIXERS | 第23-25页 |
1.7 NATURAL PRODUCTS FROM ENDOPHYTES | 第25-26页 |
1.7.1 ANTIBIOTICS | 第25页 |
1.7.2 ANTIVIRAL COMPOUNDS | 第25-26页 |
1.7.3 ANTICANCER COMPOUNDS | 第26页 |
1.7.4 ANTIOXIDANT PROPERTY | 第26页 |
1.7.5 ANTIDIABETIC ACTIVITY | 第26页 |
1.7.6 IMMUNOSUPPRESIVE COMPOUNDS FROM ENDOPHYTES | 第26页 |
1.8 MICROBIAL DIVERSITY RESEARCH METHODS AND PROGRESS | 第26-27页 |
1.9 JUSTIFICATION OF THE STUDY | 第27-28页 |
1.10 RESEARCH PLAN | 第28页 |
1.11 SCIENTIFIC QUESTIONS | 第28-29页 |
1.12 HYPOTHESIS | 第29页 |
1.13 OBJECTIVES | 第29-30页 |
CHAPTER Ⅱ MATERIALS AND METHODS | 第30-48页 |
2.1 PLANT SAMPLING AND ISOLATION OF ENDOPHYTES | 第30-31页 |
2.2 MOLECULAR IDENTIFICATION OF THE ISOLATED ENDOPHYTES | 第31-34页 |
2.3 ANALYSIS OF THE DIVERSITY OF WHEAT ENDOPHYTIC NITROGEN FIXING BACTERIA | 第34-35页 |
2.3.1 ENDOPHYTIC BACTERIA16S r DNA V5-V7 REGION AMPLIFICATION | 第34-35页 |
2.4 ANALYSIS OF THE DIVERSITY OF nif HCONTAINING DIAZOTROPHS | 第35-36页 |
2.5 DATA PROCESSING METHODS | 第36页 |
2.6 GROWTH PROMOTING AND STRESS TOLERANCE PROPERTIES OF WHEAT ENDOPHYTES | 第36-42页 |
2.6.1 EVALUATION OF SOME IMPORTANT PGP PROPERTIES | 第36-40页 |
2.6.1.1 QUALITATIVE AND QUANTITATIVE ESTIMATION OF ACC DEMINASEACTIVITY | 第36-37页 |
2.6.1.2 QUALITATIVE AND QUANTITATIVE SCREENING OF NITROGEN FIXING PROPERTY OF THE ISOLATED ENDOPHYTIC BACTERIA | 第37-38页 |
2.6.1.3 QUANTIFICATION OF IAA | 第38页 |
2.6.1.4 SIDEROPHORE PRODUCTION | 第38页 |
2.6.1.5 QUALITATIVE SCREENING OF PHOSPHATE SOLUBILIZATION POTENCY· | 第38-39页 |
2.6.1.6 AMMONIA(NH3)PRODUCTION | 第39页 |
2.6.1.7 CYANOGENESIS-HYDROGEN CYANIDE(HCN)PRODUCTION | 第39页 |
2.6.1.8 UREASE TEST | 第39页 |
2.6.1.9 CATALASE TEST | 第39-40页 |
2.6.2 ABIOTIC STRESS TOLERANCE PROPERTIES | 第40-41页 |
2.6.2.1 SALT TOLERANCE TEST | 第40页 |
2.6.2.2 HEAVY METAL RESISTANCE TEST | 第40页 |
2.6.2.3 DROUGHT TOLERANCE TEST | 第40页 |
2.6.2.4 TEMPERATURE TOLERANCE TEST | 第40-41页 |
2.6.2.5 ANTIBIOTIC SENSITIVITY TEST | 第41页 |
2.6.3 EFFECT OF ENDOPHYTIC INOCULATION ON WHEAT AND MAIZE GROWTH | 第41-42页 |
2.7 ANTIDIABETIC AND ANTIMICROBIAL POTENTIALS OF WHEAT ENDOPHYTES· | 第42-45页 |
2.7.1 SECONDARY METABOLITE EXTRACTION | 第42页 |
2.7.2 PHYTOCHEMICAL ANALYSIS | 第42-43页 |
2.7.2.1 TEST FOR PHENOLS | 第42页 |
2.7.2.2 TEST FOR TERPENOIDS | 第42页 |
2.7.2.3 TEST FOR FLAVONOIDS | 第42-43页 |
2.7.2.4 TEST FOR SAPONINS | 第43页 |
2.7.2.5 TEST FOR TANNINS | 第43页 |
2.7.2.6 TEST FOR ALKALOIDS | 第43页 |
2.7.2.7 TEST FOR CARBOHYDRATES | 第43页 |
2.7.2.8 TEST FOR STEROIDS | 第43页 |
2.7.3 ANTIDIABETIC SCREENING OF THE ENDOPHYTIC METABOLITES | 第43-44页 |
2.7.3.1 α-AMYLASE INHIBITION ASSAY | 第43-44页 |
2.7.3.2 α-GLUCOSIDASE INHIBITION ASSAY | 第44页 |
2.7.4 ANTIMICROBIAL TEST OF CRUDE METABOLITES OF ENDOPHYTES | 第44-45页 |
2.7.4.1 TEST STRAINS AND CULTURE MEDIA | 第44-45页 |
2.7.4.2 ANTIFUNGAL ASSAY | 第45页 |
2.7.4.3 ANTIBACTERIAL ASSAY | 第45页 |
2.8 CHARACTERIZATION OF THE ISOLATED NOVEL ENDOPHYTIC BACTERIAUM7197~T(Paenibacillus rhizophilus) | 第45-47页 |
2.8.1 GENOME SEQUENCING | 第45-46页 |
2.8.2 16S rRNA GENE SEQUENCING AND ANALYSIS | 第46页 |
2.8.3 MORPHOLOGICAL CHARACTERISTICS | 第46页 |
2.8.4 PHENOTYPICAL AND BIOCHEMICAL CHARACTERISTICS | 第46页 |
2.8.5 NITROGENASE ACTIVITY OF7197T | 第46-47页 |
2.8.6 CYTOCHEMICAL COMPONENTS | 第47页 |
2.8.7 Growth Promoting and Abiotic Stress Tolerance Properties of 7197~T | 第47页 |
2.8.8 INOCULATION EFFECT OF7197~T ON WHEAT AND MAIZE GROWTH | 第47页 |
2.9 STATISTICAL ANALYSIS | 第47-48页 |
CHAPTER Ⅲ ANALYSIS OF THE DIVERSITY OF WHEAT ENDOPHYTIC NITROGEN FIXING BACTERIA | 第48-86页 |
3.1 INTRODUCTION | 第48页 |
3.2 RESULTS AND ANALYSIS | 第48-77页 |
3.2.1 DIVESRSITY OF WHEAT ENDOPHYTIC NITROGEN FIXING BACTERIA WITH CULTURE DEPENDENT METHOD | 第48-55页 |
3.2.2 ANALYSIS OF DIVERSITY OF WHEAT ENDOPHYTIC NITROGEN FIXING BACTERIA BY CULTURE INDEPENDENT METHOD | 第55-77页 |
3.2.2.1 DATA QUALITY CONTROL AND OTU BASIS ANALYSIS | 第55-57页 |
3.2.2.2 GENUS ABUNDANCE HEAT-MAP | 第57-58页 |
3.2.2.3 ANALYSIS OFΑLPHA(α)DIVERSITY OF N-FIXING ENDOPHYTIC BACTERIA IN WHEAT | 第58-64页 |
3.2.2.4 ANALYSIS OF BETA(β)DIVERSITY OF N-FIXING ENDOPHYTIC BACTERIA IN WHEAT | 第64-66页 |
3.2.2.5 ANALYSIS OF N-FIXING ENDOPHYTIC BACTERIA CORE FLORA | 第66-68页 |
3.2.2.6 ANALYSIS OF N FIXING ENDOPHYTIC BACTERIA ON TAXONOMIC LEVELS· | 第68-77页 |
3.3 Comparison of Biodiversity of Endophytic Bacteria with Culture Dependent and Culture Independent Methods | 第77-83页 |
3.4 SUMMARY OF THE CHAPTER | 第83-86页 |
CHAPTER Ⅳ DIVERSITY OF nif H CONTAINING WHEAT DIAZOTROPHS | 第86-113页 |
4.1 INTRODUCTION | 第86页 |
4.2 RESULTS AND ANALYSIS | 第86-108页 |
4.2.1 DIVERSITY OF nif H CONTAINING DIAZOTROPHS WITH CULTURE DEPENDENT METHOD | 第86-93页 |
4.2.2 ANALYSIS OF DIVERSITY OF WHEAT ENDOPHYTIC NITROGENFIXINGDIAZOTROPHSIN WHEAT BY CULTURE INDEPENDENT METHOD | 第93-108页 |
4.2.2.1 DATA QUALITY CONTROL AND OTU BASIS ANALYSIS | 第93-95页 |
4.2.2.2 GENUS ABUNDANCE HEAT-MAP | 第95-97页 |
4.2.2.3 ANALYSIS OFΑLPHA(α)DIVERSITY OF NITROGEN FIXING DIAZOTROPHS IN WHEAT | 第97-100页 |
4.2.2.4 ANALYSIS OF BETA(β)DIVERSITY OF NITROGEN FIXING DIAZOTROPHS IN WHEAT | 第100-102页 |
4.2.2.5 ANALYSIS OF CORE FLORA OF ENDOPHYTIC NITROGEN FIXING DIAZOTROPHS | 第102-103页 |
4.2.2.6 ANALYSIS OF ENDOPHYTIC DIAZOTROPHS ON TAXONOMIC LEVELS | 第103-108页 |
4.3 COMPARISON OF DIAZOTROPHBIODIVERSITYWITH CULTURE DEPENDENTAND CULTURE INDEPENDENT METHODS | 第108-111页 |
4.4 SUMMARY OF THE CHAPTER | 第111-113页 |
CHAPTER Ⅴ GROWTH PROMOTING AND STRESS TOLERANCE PROPERTIES OF WHEAT ENDOPHYTES | 第113-133页 |
5.1 INTRODUCTION | 第113页 |
5.2 RESULTS | 第113-128页 |
5.2.1 PGP TRAITS OF THE ISOLATED ENDOPHYTIC MICROBES | 第113-119页 |
5.2.1.1 QUALITATIVE AND QUANTITATIVE SCREENING FOR NITROGENFIXATION ABILITY OF THE ISOLATED ENDOPHYTES | 第113-115页 |
5.2.1.2 QUALITATIVE AND QUANTITATIVE ESTIMATION OF ACC DEAMINASE ACTIVITY | 第115页 |
5.2.1.3 IAA PRODUCTION | 第115页 |
5.2.1.4 SIDEROPHORE PRODUCTION | 第115-116页 |
5.2.1.5 PHOSPHATE SOLUBILIZATION POTENCY | 第116页 |
5.2.1.6 AMMONIA PRODUCTION | 第116-117页 |
5.2.1.7 CYANOGENESIS | 第117页 |
5.2.1.8 UREASE TEST | 第117-118页 |
5.2.1.9 CATALASE TEST | 第118-119页 |
5.2.2 ABIOTIC STRESS TOLERANCE | 第119-128页 |
5.2.2.1 SALT TOLERANCE TEST | 第119-121页 |
5.2.2.2 HEAVY METAL RESISTANCE TEST | 第121-123页 |
5.2.2.3 DROUGHT RESISTANCE TEST | 第123-125页 |
5.2.2.4 TEMPERATURE TOLERANCE TEST | 第125-126页 |
5.2.2.5 ANTIBIOTIC SENSITIVITY TEST | 第126-128页 |
5.3 INOCULATION EFFECT OF ENDOPHYTES ON WHEAT AND MAIZE | 第128-131页 |
5.4 SUMMARY OF THE CHAPTER | 第131-133页 |
CHAPTER Ⅵ ANTIDIABETIC AND ANTIMICROBIAL POTENTIALS OF WHEATENDOPHYTES | 第133-142页 |
6.1 INTRODUCTION | 第133页 |
6.2 RESULTS | 第133-141页 |
6.2.1 PHYTOCHEMICAL ANALYSIS | 第133-136页 |
6.2.2 ANTIDIABETIC ACTIVITY OF THE MICROBIAL EXTRACTS | 第136-138页 |
6.2.3 ANTIMICROBIAL ACTIVITY OF THE MICROBIAL EXTRACTS | 第138-141页 |
6.3 SUMMARY OF THE CHAPTER | 第141-142页 |
CHAPTER Ⅶ CHARACTERIZATION OF THE ISOLATED NOVEL ENDOPHYTIC BACTERIUM7197T(Paenibacillus rhizophilus) | 第142-156页 |
7.1 INTRODUCTION | 第142页 |
7.2 RESULTS AND ANALYSIS | 第142-153页 |
7.2.1 PHYLOGENETIC ANALYSIS OF16S r RNA GENE SEQUENCES | 第142-144页 |
7.2.2 DETERMINATION OF DNA G+C MOL%AND DNA HOMOLOGY | 第144-145页 |
7.2.3 MORPHOLOGICAL CHARACTERISTICS | 第145-146页 |
7.2.4 PHENOTYPICAL AND BIOCHEMICAL CHARACTERISTICS | 第146-149页 |
7.2.5 NITROGENASE ACTIVITY OF7197T | 第149-150页 |
7.2.6 CYTOCHEMICAL COMPONENTS | 第150-153页 |
7.2.6.1ANALYSIS OF FATTY ACID COMPONENTS | 第150-151页 |
7.2.6.2 ANALYSIS OF POLAR VALUE COMPONENTS | 第151-152页 |
7.2.6.3 ANALYSIS OF BISMATH COMPONENT | 第152页 |
7.2.6.4 ANALYSIS OF AMINO ACID COMPOSITION IN CELL WALL | 第152-153页 |
7.3 GROWTH PROMOTING AND STRESS TOLERANCE PROPERTIES OF7197T | 第153页 |
7.4 INOCULATION EFFECT OF7197T ON WHEAT AND MAIZE PLANTS | 第153-154页 |
7.5 SUMMARY OF THE CHAPTER | 第154-156页 |
CHAPTER Ⅷ DISCUSSION | 第156-167页 |
8.1 ANALYSIS OF DIVERSITY OF WHEAT ENDOPHYTIC NITROGEN FIXING BACTERIA. | 第156-158页 |
8.2 ANALYSIS OF DIVERSITY OF nif H CONTAINING WHEAT DIAZOTROPHS | 第158-160页 |
8.3 GROWTH PROMOTING AND STRESS TOLERANCE PROPERTIES OF WHEAT ENDOPHYTES | 第160-163页 |
8.4 ANTIDIABETIC AND ANTIMICROBIAL POTENTIALS OF WHEAT ENDOPHYTES | 第163-165页 |
8.5 Characterization of the Isolated Novel Endophytic Bacterium 7197~T (Paenibacillus rhizophilus) | 第165-167页 |
CONCLUSION | 第167-170页 |
REFERENCES | 第170-193页 |
APPENDIX | 第193-206页 |
ACKNOWLEDGEMENTS | 第206-207页 |
RESUME | 第207-209页 |