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牡丹MADS-box基因家族生物信息学分析及花器官调控相关基因表达分析

致谢第4-9页
缩略词表Abbreviation第9-10页
摘要第10-12页
1 文献综述第12-19页
    1.1 植物花发育分子机制研究概述第12页
    1.2 植物花发育MADS-box基因研究进展第12-15页
        1.2.1 植物MADS-box基因发现与分布第12-13页
        1.2.2 植物MADS-box基因分类与结构第13页
        1.2.3 部分MADS-box基因功能研究进展第13-15页
            1.2.3.1 SEP基因功能研究进展第13-14页
            1.2.3.2 AGL6基因功能研究进展第14页
            1.2.3.3 PI基因功能研究进展第14-15页
    1.3 植物MADS-box基因的生物信息学研究进展第15页
    1.4 植物花发育模型发展第15-17页
    1.5 牡丹花发育研究第17-19页
        1.5.1 牡丹花芽分化及花型研究进展第17-18页
        1.5.2 牡丹花发育MADS-box基因研究进展第18-19页
2 引言第19-20页
3 材料与方法第20-31页
    3.1 牡丹MADS-box基因家族的生物信息学分析第20页
        3.1.1 实验方法第20页
            3.1.1.1 牡丹MADS-box基因家族筛选及鉴定第20页
            3.1.1.2 牡丹MADS-box基因家族理化性质分析第20页
            3.1.1.3 牡丹MADS-box基因家族保守基序分析第20页
            3.1.1.4 牡丹MADS-box基因家族二级结构及亚细胞定位预测第20页
            3.1.1.5 牡丹MADS-box基因家族系统进化分析第20页
    3.2 牡丹花器官调控相关MADS-box基因克隆及序列分析第20-25页
        3.2.1 实验材料第20-22页
            3.2.1.1 植物材料第20页
            3.2.1.2 菌株与载体第20-21页
            3.2.1.3 主要试剂第21页
            3.2.1.4 主要药品配制第21页
            3.2.1.5 PCR引物第21页
            3.2.1.6 主要仪器第21-22页
        3.2.2 实验方法第22-25页
            3.2.2.1 总RNA提取第22页
            3.2.2.2 RNA质量检测第22-23页
            3.2.2.3 反转录合成cDNA第23页
            3.2.2.4 PCR扩增第23-24页
            3.2.2.5 胶回收第24页
            3.2.2.6 目的片段与载体连接、转化第24-25页
            3.2.2.7 阳性克隆的鉴定与测序第25页
            3.2.2.8 基因的序列比对与进化分析第25页
    3.3 牡丹花芽分化进程研究第25-27页
        3.3.1 实验材料第25-26页
            3.3.1.1 植物材料第25-26页
            3.3.1.2 主要试剂及工具第26页
            3.3.1.3 主要仪器第26页
        3.3.2 实验方法第26-27页
            3.3.2.1 牡丹花芽分化观察第26-27页
    3.4 牡丹花器官调控相关MADS-box基因表达模式分析第27-31页
        3.4.1 实验材料第27-29页
            3.4.1.1 植物材料第27-28页
            3.4.1.2 主要试剂第28页
            3.4.1.3 qRT-PCR引物第28-29页
            3.4.1.4 主要仪器第29页
        3.4.2 实验方法第29-31页
            3.4.2.1 总RNA提取第29页
            3.4.2.2 反转录第29-30页
            3.4.2.3 qRT-PCR第30页
            3.4.2.4 数据分析与处理第30-31页
4 结果与分析第31-57页
    4.1 牡丹MADS-box基因家族的生物信息学分析第31-36页
        4.1.1 牡丹MADS-box基因家族筛选及鉴定第31-32页
        4.1.2 牡丹MADS-box基因家族理化性质分析第32页
        4.1.3 牡丹MADS-box基因家族保守基序分析第32-34页
        4.1.4 牡丹MADS-box基因家族二级结构及亚细胞定位预测第34-35页
        4.1.5 牡丹MADS-box基因家族系统进化分析第35-36页
    4.2 牡丹花器官调控相关MADS-box基因克隆及序列分析第36-45页
        4.2.1 牡丹总RNA质量检测第36-37页
        4.2.2 牡丹PsMADS5,PsMADS7,PsMADS12基因的克隆第37-39页
        4.2.3 牡丹PsMADS5,PsMADS7,PsMADS12基因序列比对与进化分析第39-45页
            4.2.3.1 牡丹PsMADS5基因多序列比对与系统进化分析第39-41页
            4.2.3.2 牡丹PsMADS7基因多序列比对与系统进化分析第41-43页
            4.2.3.3 牡丹PsMADS12基因多序列比对与系统进化分析第43-45页
    4.3 牡丹花芽分化进程研究第45-47页
    4.4 牡丹花器官调控相关MADS-box基因表达模式分析第47-57页
        4.4.1 牡丹MADS-box基因荧光定量结果可行性分析第47-48页
        4.4.2 牡丹花器官调控相关MADS-box基因在不同器官中的表达第48-50页
            4.4.2.1 牡丹PsMADS5在不同器官中的表达第48-49页
            4.4.2.2 牡丹PsMADS7在不同器官中的表达第49-50页
            4.4.2.3 牡丹PsMADS12在不同器官中的表达第50页
        4.4.3 牡丹花器官调控相关MADS-box基因在花芽分化不同时期的表达第50-53页
            4.4.3.1 牡丹PsMADS5在花芽分化不同时期的表达第50-51页
            4.4.3.2 牡丹PsMADS7在花芽分化不同时期的表达第51-52页
            4.4.3.3 牡丹PsMADS12在花芽分化不同时期的表达第52-53页
        4.4.4 牡丹花器官调控相关MADS-box基因在不同花型花器官中的表达第53-57页
            4.4.4.1 不同花型牡丹花器官PsMADS5的表达第53-54页
            4.4.4.2 不同花型牡丹花器官PsMADS7的表达第54-55页
            4.4.4.3 不同花型牡丹花器官PsMADS12的表达第55-57页
5 结论与讨论第57-62页
    5.1 讨论第57-60页
        5.1.1 牡丹MADS-box基因家族的生物信息学分析第57页
        5.1.2 牡丹花器官调控相关MADS-box基因克隆及序列分析第57-58页
        5.1.3 牡丹的花芽分化规律第58页
        5.1.4 牡丹花器官调控相关MADS-box基因表达模式分析第58-60页
            5.1.4.1 牡丹花器官调控相关MADS-box基因在不同器官中的表达第58-59页
            5.1.4.2 牡丹花器官调控相关MADS-box基因在花芽分化不同时期的表达第59页
            5.1.4.3 牡丹花器官调控相关MADS-box基因在不同花型花器官中的表达第59-60页
    5.2 结论第60-62页
参考文献第62-69页
ABSTRACT第69-71页

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