| 摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 符号说明 | 第8-10页 |
| 文献综述 | 第10-20页 |
| 1. 传染性支气管炎国内外流行概况 | 第10-12页 |
| 1.1 国外IB的流行情况 | 第10-11页 |
| 1.2 国内IB的流行情况 | 第11-12页 |
| 2. 传染性支气管炎病毒的分子生物学特性研究 | 第12-17页 |
| 2.1 病毒的生物学分类 | 第12-13页 |
| 2.2 病毒粒子结构 | 第13页 |
| 2.3 病毒的基因组结构与转录机制 | 第13-14页 |
| 2.4 病毒的变异机制 | 第14-15页 |
| 2.5 病毒编码的主要蛋白及功能 | 第15-17页 |
| 2.6 病毒的非编码区及其生物学功能 | 第17页 |
| 3. RNA病毒的反向遗传学技术研究进展 | 第17-20页 |
| 3.1 RNA病毒反向遗传学技术 | 第17-18页 |
| 3.2 冠状病毒反向遗传学技术 | 第18-20页 |
| 第一章 不同代次IBV CK/CH/JS/2010/12株的全基因序列测定与分析 | 第20-37页 |
| 1 材料 | 第20-21页 |
| 1.1 病毒 | 第20页 |
| 1.2 SPF鸡胚 | 第20页 |
| 1.3 主要试验试剂 | 第20-21页 |
| 1.4 主要仪器 | 第21页 |
| 2 方法 | 第21-25页 |
| 2.1 引物设计与合成 | 第21-22页 |
| 2.2 病毒RNA的提取及RT-PCR | 第22-25页 |
| 2.2.1 病毒RNA的提取 | 第22页 |
| 2.2.2 RT-PCR | 第22-23页 |
| 2.2.3 5’RACE和3’RACE | 第23-25页 |
| 2.3 目的片段的克隆与鉴定 | 第25页 |
| 2.4 序列测定与分析 | 第25页 |
| 2.5 不同毒株之间遗传变异轨迹分析 | 第25页 |
| 3 结果 | 第25-33页 |
| 3.1 各代次毒株全基因的克隆与结构分析 | 第25-27页 |
| 3.2 各代次毒株全基因序列的同源性分析 | 第27页 |
| 3.3 各基因变异分析 | 第27-29页 |
| 3.3.1 ORF1变异分析 | 第27-28页 |
| 3.3.2 ORF2变异分析 | 第28页 |
| 3.3.3 ORF3变异分析 | 第28页 |
| 3.3.4 ORF4变异分析 | 第28-29页 |
| 3.3.5 ORF5变异分析 | 第29页 |
| 3.3.6 ORF6变异分析 | 第29页 |
| 3.3.7 5’UTR和3’UTR的变异分析 | 第29页 |
| 3.4 不同毒株间遗传变异的比较分析 | 第29-33页 |
| 4 讨论 | 第33-37页 |
| 第二章 IBV QXL株反向遗传平台的建立 | 第37-48页 |
| 1 材料 | 第37-38页 |
| 1.1 病毒 | 第37页 |
| 1.2 SPF鸡胚 | 第37页 |
| 1.3 主要试验试剂 | 第37-38页 |
| 1.4 主要仪器 | 第38页 |
| 2 方法 | 第38-41页 |
| 2.1 引物设计与合成 | 第38-39页 |
| 2.2 病毒全长cDNA各片段的克隆与测序 | 第39页 |
| 2.2.1 病毒RNA的提取及RT-PCR | 第39页 |
| 2.2.2 全基因组的克隆与测序 | 第39页 |
| 2.3 基因组全长cDNA的获取 | 第39-40页 |
| 2.3.1 rIBV-1～rIBV-13重组质粒的提取 | 第39页 |
| 2.3.2 rIBV-1～rIBV-13重组质粒的酶切 | 第39-40页 |
| 2.3.3 基因组全长cDNA的连接 | 第40页 |
| 2.3.4 基因组全长cDNA的鉴定 | 第40页 |
| 2.4 基因组全长cDNA的体外转录 | 第40-41页 |
| 2.5 病毒拯救及其鉴定 | 第41页 |
| 2.6 病毒滴度的测定 | 第41页 |
| 3 结果 | 第41-45页 |
| 3.1 全基因组分段扩增结果 | 第41-42页 |
| 3.2 基因组全长cDNA的连接 | 第42-44页 |
| 3.2.1 全长cDNA的获得 | 第42-43页 |
| 3.2.2 全长cDNA的鉴定 | 第43-44页 |
| 3.3 拯救病毒的鉴定 | 第44-45页 |
| 3.4 病毒滴度的测定 | 第45页 |
| 4 讨论 | 第45-48页 |
| 全文总结 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
