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牛狂犬病的病毒全基因组序列分析及病理学研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
插图和附表清单第13-16页
縮略语表第16-18页
1 引言第18-35页
    1.1 病原学第18-23页
        1.1.1 狂犬病毒的分类第18-19页
        1.1.2 狂犬病病毒的分子生物学特点第19-23页
    1.2 流行病学研究进展第23-27页
        1.2.1 传染源和宿主第23-25页
        1.2.2 传播途径第25-26页
        1.2.3 影响发病的因素第26页
        1.2.4 狂犬病流行范围第26-27页
    1.3 病理学研究第27-30页
        1.3.1 病理学变化第27-29页
        1.3.2 发病机理研究进展第29-30页
    1.4 狂犬病的诊断与防制第30-33页
        1.4.1 狂犬病的诊断第30-31页
        1.4.2 狂犬病的防制第31-33页
    1.5 研究目的和意义第33-35页
2 牛狂犬病自然病例的病理学研究第35-56页
    2.1 材料与方法第35-40页
        2.1.1 材料第35-37页
        2.1.2 方法第37-40页
    2.2 结果第40-54页
        2.2.1 动物自然病例发病情况与临床症状第40-41页
        2.2.2 自然病例病理学检查第41-53页
        2.2.3 自然病例核酸检测第53-54页
    2.3 讨论第54-55页
    2.4 小结第55-56页
3 3株狂犬病病毒的全基因组测序第56-72页
    3.1 实验材料第56-57页
        3.1.1 狂犬病犬牛脑标本来源第56页
        3.1.2 实验动物第56页
        3.1.3 狂犬病病毒全基因组测序所用标本第56页
        3.1.4 实验道德规范第56页
        3.1.5 主要仪器设备第56-57页
        3.1.6 主要试剂第57页
    3.2 实验方法第57-64页
        3.2.1 接种用脑组织的处理第57页
        3.2.2 接种方法第57-58页
        3.2.3 小鼠接种后观察第58页
        3.2.4 接种后直接免疫荧光检测第58-59页
        3.2.5 用于狂犬病毒N基因序列的扩增引物第59页
        3.2.6 设计用于分段扩增狂犬病病毒全基因组序列的引物第59-60页
        3.2.7 设计用于病毒基因组末端的基因序列扩增引物第60页
        3.2.8 细胞总RNA的提取第60-61页
        3.2.9 cDNA合成第61页
        3.2.10 PCR和序列测定第61页
        3.2.11 狂犬病病毒基因组末端的基因序列扩增第61-64页
    3.3 实验结果第64-69页
        3.3.1 狂犬病毒分离扩增结果第64页
        3.3.2 直接免疫荧光检测结果第64-65页
        3.3.3 狂犬病毒N基因的PCR扩增结果第65-66页
        3.3.4 全基因组序列PCR反应产物电泳结果第66-67页
        3.3.5 狂犬病毒的基因组全长与各基因及其编码区域第67-69页
    3.4 讨论第69-70页
        3.4.1 引物设计第69-70页
        3.4.2 确保序列测定的准确性第70页
        3.4.3 全基因组的长度第70页
        3.4.4 (G+C)%含量第70页
    3.5 小结第70-72页
4 3株内蒙古狂犬病病毒的全基因组序列的分析第72-135页
    4.1 材料与方法第72-74页
        4.1.1 用于狂犬病毒全基因组序列分析的参考序列第72页
        4.1.2 用于狂犬病病毒N基因序列分析的参考序列第72-74页
    4.2 用于序列分析的生物信息学常用软件第74-75页
        4.2.1 用于序列拼接的ATGC软件第74-75页
        4.2.2 ClustalX(1.8)软件第75页
        4.2.3 BioEdit软件第75页
        4.2.4 GeneDoc软件第75页
        4.2.5 MEGA(5)软件第75页
        4.2.6 DNAStar(5.01)软件包中MegAlign软件第75页
    4.3 狂犬病病毒的全基因组序列分析结果第75-126页
        4.3.1 狂犬病毒全基因序列的同源性分析第75-76页
        4.3.2 各结构基因所编码蛋白情况分析第76页
        4.3.3 结构蛋白基因同源性比较第76-78页
        4.3.4 非编码区序列比较第78-81页
        4.3.5 各结构蛋白的功能位点比较第81-126页
    4.4 讨论第126-133页
        4.4.1 3株狂犬病毒街毒株N基因(核蛋白)分析第126-127页
        4.4.2 基因组分子特征第127-130页
        4.4.3 遗传系谱间差异比较第130-131页
        4.4.4 种系发生分析第131页
        4.4.5 街毒株与疫苗株的比较研究第131-132页
        4.4.6 同源性分析第132页
        4.4.7 3株病毒致病性差异分析第132-133页
    4.5 小结第133-135页
5 牛狂犬病病毒毒株实验感染小鼠的病理学研究第135-173页
    5.1 材料与方法第135-139页
        5.1.1 实验道德规范第135页
        5.1.2 病毒株第135页
        5.1.3 实验动物第135页
        5.1.4 病毒悬液的制备与病毒滴度的检测第135页
        5.1.5 狂犬病病毒的接种与接种后观察第135-136页
        5.1.6 小鼠脑组织的收集与组织切片的制备第136页
        5.1.7 狂犬病病毒特异性抗原定位第136页
        5.1.8 电镜检查第136页
        5.1.9 脑标本的病理组织学观察第136页
        5.1.10 脑组织切片CD3+T淋巴细胞的免疫荧光染色第136-137页
        5.1.11 CD11b小胶质细胞的免疫荧光染色第137页
        5.1.12 活化的半胱天冬酶-3(Caspase-3)的间接免疫荧光染色第137页
        5.1.13 微管相关蛋白(MAP-2)的免疫荧光染色第137-138页
        5.1.14 神经细胞MAP-2与狂犬病毒抗原共定位第138页
        5.1.15 IL-1βmRNA、RANTES mRNA及TIMP-1 mRNA原位杂交检测第138页
        5.1.16 脑组织免疫荧光染色与激光扫描共聚焦观察第138-139页
        5.1.17 数据处理与统计第139页
    5.2 实验结果第139-164页
        5.2.1 乳鼠接种病毒后的脑内病毒滴度、体重变化及病死率第139-140页
        5.2.2 外周和颅内两种接种方式对不同年龄段小鼠的致病性和感染能力第140-141页
        5.2.3 狂犬病病毒特异性抗原检测结果第141-142页
        5.2.4 神经细胞与神经纤维的病理变化第142-143页
        5.2.5 电镜检查第143-146页
        5.2.6 3株狂犬病毒在发病后濒死前乳鼠脑内的抗原分布第146-148页
        5.2.7 3株狂犬病毒在乳鼠脑组织内不同部位的病毒抗原含量第148-151页
        5.2.8 乳鼠脑组织内CD3+T淋巴细胞的浸润第151-153页
        5.2.9 乳鼠脑组织内CD11b小胶质细胞的活化第153-155页
        5.2.10 3株狂犬病毒乳鼠脑组织内Caspase-3免疫荧光染色结果第155-157页
        5.2.11 乳鼠脑组织微管相关蛋白2的荧光免疫荧光染色结果第157页
        5.2.12 乳鼠脑组织病毒抗原与微管相关蛋白2病变的相关性第157-158页
        5.2.13 乳鼠脑组织狂犬病病毒抗原阳性细胞激光扫描共聚焦观察结果第158-159页
        5.2.14 乳鼠脑组织原位杂交IL-1β mRNA染色结果第159-161页
        5.2.15 乳鼠脑组织原位杂交RANTES mRNA染色结果第161-163页
        5.2.16 乳鼠脑组织原位杂交TIMP-1 mRNA染色结果第163-164页
    5.3 讨论第164-172页
        5.3.1 乳鼠脑组织神经细胞的病理学变化第164-166页
        5.3.2 3株病毒脑组织内抗原分布差异分析第166页
        5.3.3 3株病毒致乳鼠脑组织细胞凋亡情况第166-167页
        5.3.4 乳鼠脑组织炎性细胞情况第167-168页
        5.3.5 乳鼠脑组织神经细胞树突的病变第168-169页
        5.3.6 乳鼠脑组织狂犬病病毒抗原阳性细胞免疫荧光方法特异性鉴定第169页
        5.3.7 乳鼠脑组织原位杂交IL-1β mRNA染色结果第169-170页
        5.3.8 乳鼠脑组织原位杂交RANTES mRNA染色结果第170-171页
        5.3.9 乳鼠脑组织原位杂交TIMP-1 mRNA染色结果第171-172页
    5.4 小结第172-173页
6 结论第173-174页
7 创新点第174-175页
致谢第175-176页
附录第176-197页
参考文献第197-216页
作者简介第216页

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