| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-17页 |
| 1.1 紫花苜蓿概述 | 第9-10页 |
| 1.1.1 紫花苜蓿起源与分类 | 第9页 |
| 1.1.2 紫花苜蓿研究价值与育种所面临的问题 | 第9-10页 |
| 1.2 分子标记研究进展 | 第10-12页 |
| 1.2.1 分子标记概述 | 第10-11页 |
| 1.2.2 紫花苜蓿简单重复序列标记的应用及开发进展 | 第11-12页 |
| 1.3 EST-SSR 标记开发 | 第12-14页 |
| 1.3.1 序列表达标签及其分类 | 第12-13页 |
| 1.3.2 EST-SSR 标记特点、开发与应用 | 第13-14页 |
| 1.4 高通量测序技术(NGS)应用研究进展 | 第14-15页 |
| 1.5 SSR 分子标记技术与高通量测序技术在紫花苜蓿育种中的展望 | 第15页 |
| 1.6 立题依据及研究目标 | 第15-17页 |
| 第二章 基于 RNA-SEQ 技术紫花苜蓿的 EST-SSR 引物开发 | 第17-29页 |
| 2.1 材料与方法 | 第17-21页 |
| 2.1.1 试验材料与 DNA 提取 | 第17-18页 |
| 2.1.2 实验试剂与仪器 | 第18-20页 |
| 2.1.3 RNA 分离，文库制备，Illumina 测序和起始转录组装配 | 第20页 |
| 2.1.4 EST-SSR 搜索、引物设计和 PCR 扩增 | 第20-21页 |
| 2.1.5 数据处理与分析 | 第21页 |
| 2.2 结果与分析 | 第21-25页 |
| 2.2.1 紫花苜蓿 EST-SSRs 的频率分布及特征分析 | 第21-23页 |
| 2.2.2 紫花苜蓿 EST-SSR 多态性分析 | 第23-25页 |
| 2.2.3 紫花苜蓿 EST-SSR 通用性分析 | 第25页 |
| 2.3 讨论 | 第25-27页 |
| 2.3.1 紫花苜蓿 EST-SSR 的频率分布及特征分析 | 第25-26页 |
| 2.3.2 紫花苜蓿 EST-SSR 多态性分析与通用性分析 | 第26-27页 |
| 2.4 小结 | 第27-29页 |
| 第三章 中国紫花苜蓿品种遗传多样性分析 | 第29-37页 |
| 3.1 材料与方法 | 第29-31页 |
| 3.1.1 实验材料和 DNA 提取 | 第29-30页 |
| 3.1.2 PCR 扩增产物检测 | 第30-31页 |
| 3.1.3 数据处理与分析 | 第31页 |
| 3.2 结果与分析 | 第31-35页 |
| 3.2.1 38 对 EST-SSR 多态性分析 | 第31-33页 |
| 3.2.2 聚类分析 | 第33-34页 |
| 3.2.3 主坐标分析 | 第34-35页 |
| 3.3 讨论 | 第35-36页 |
| 3.3.1 紫花苜蓿品种多样性 | 第35页 |
| 3.3.2 聚类分析 | 第35-36页 |
| 3.3.3 主坐标分析 | 第36页 |
| 3.4 小结 | 第36-37页 |
| 第四章 结论 | 第37-38页 |
| 4.1 基于 RNA-SEQ 技术紫花苜蓿的 EST-SSR 引物开发 | 第37页 |
| 4.2 中国紫花苜蓿品种遗传多样性分析 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-45页 |
| 附录 | 第45-70页 |
| 附表 1 | 第45-51页 |
| 附表 2 | 第51-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 作者简介 | 第71页 |
