| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第11-24页 |
| 1.1 引言 | 第11页 |
| 1.2 LSD1抑制剂研究简介 | 第11-16页 |
| 1.2.1 LSD1的结构及生理功能 | 第11-13页 |
| 1.2.2 LSD1抑制剂的研究现状 | 第13-16页 |
| 1.3 计算机辅助药物设计 | 第16-22页 |
| 1.3.1 三维定量构效关系 | 第18-19页 |
| 1.3.2 分子对接 | 第19-21页 |
| 1.3.3 分子动力学模拟 | 第21-22页 |
| 1.3.4 基于分子动力学的结合自由能计算 | 第22页 |
| 1.4 论文总体安排 | 第22-24页 |
| 2 6-苯基-5-氰基嘧啶类LSD1抑制剂的3D-QSAR,分子对接和分子动力学研究 | 第24-43页 |
| 2.1 引言 | 第24页 |
| 2.2 计算与研究方法 | 第24-29页 |
| 2.2.1 分子对接 | 第25-26页 |
| 2.2.2 分子叠合 | 第26页 |
| 2.2.3 3D-QSAR模型的构建 | 第26页 |
| 2.2.4 PLS分析和3D-QSAR模型的检验 | 第26-27页 |
| 2.2.5 分子动力学模拟 | 第27-28页 |
| 2.2.6 结合自由能的计算及分解 | 第28-29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-42页 |
| 2.3.1 分子对接结果分析 | 第29-31页 |
| 2.3.2 3D-QSAR统计结果分析 | 第31-34页 |
| 2.3.3 3D-QSAR三维等势图分析 | 第34-37页 |
| 2.3.4 分子动力学模拟结果分析 | 第37-40页 |
| 2.3.5 结合自由能计算结果分析 | 第40-42页 |
| 2.4 本章小结 | 第42-43页 |
| 3 吡啶类LSD1抑制剂的3D-QSAR,分子对接和分子动力学研究 | 第43-61页 |
| 3.1 引言 | 第43-44页 |
| 3.2 计算与研究方法 | 第44-47页 |
| 3.2.1 分子对接 | 第44-45页 |
| 3.2.2 分子叠合 | 第45页 |
| 3.2.3 3D-QSAR模型的构建 | 第45页 |
| 3.2.4 PLS分析和3D-QSAR模型的检验 | 第45-46页 |
| 3.2.5 分子动力学模拟 | 第46页 |
| 3.2.6 结合自由能的计算及分解 | 第46-47页 |
| 3.3 结果与分析 | 第47-59页 |
| 3.3.1 对接结果 | 第47-49页 |
| 3.3.2 3D-QSAR统计结果分析 | 第49-52页 |
| 3.3.3 3D-QSAR三维等势图分析 | 第52-55页 |
| 3.3.4 分子动力学模拟结果分析 | 第55-58页 |
| 3.3.5 结合自由能计算结果分析 | 第58-59页 |
| 3.4 本章小结 | 第59-61页 |
| 4 (4-氰基苯基)甘氨酸衍生物的3D-QSAR,分子对接和分子动力学研究 | 第61-79页 |
| 4.1 引言 | 第61-62页 |
| 4.2 计算与研究方法 | 第62-65页 |
| 4.2.1 分子对接 | 第62-63页 |
| 4.2.2 分子叠合 | 第63页 |
| 4.2.3 3D-QSAR模型的构建 | 第63页 |
| 4.2.4 PLS分析和3D-QSAR模型的检验 | 第63-64页 |
| 4.2.5 分子动力学模拟 | 第64页 |
| 4.2.6 结合自由能的计算及分解 | 第64-65页 |
| 4.3 结果与分析 | 第65-78页 |
| 4.3.1 对接结果 | 第65-66页 |
| 4.3.2 3D-QSAR统计结果分析 | 第66-71页 |
| 4.3.3 3D-QSAR三维等势图分析 | 第71-73页 |
| 4.3.4 分子动力学模拟结果分析 | 第73-76页 |
| 4.3.5 结合自由能计算结果分析 | 第76-78页 |
| 4.4 本章小结 | 第78-79页 |
| 5 全文总结 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-90页 |
| 个人简历及攻读硕士期间发表的论文 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91页 |
