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调控拟南芥雄性不育基因MA的定位及拟南芥MtN3/saliva基因家族分析

第一部分 调控拟南芥雄性不育基因MA的定位第1-39页
 摘要第9-10页
 ABSTRACT第10-11页
 1. 前言第11-24页
   ·拟南芥第11-12页
   ·花药与花粉发育第12-18页
   ·雄性不育第18-19页
   ·图位克隆第19-24页
     ·图位克隆原理第19-20页
     ·拟南芥基因的图位克隆第20-21页
     ·检测DNA多态性的方法第21页
     ·图位克隆一般流程第21-24页
 2. 材料与方法第24-30页
   ·实验材料第24-25页
     ·植物材料第24页
     ·试剂第24页
     ·主要仪器第24-25页
   ·实验方法第25-30页
     ·种植拟南芥第25页
     ·突变体ma的鉴定和遗传学分析第25页
     ·定位群体的建立第25-26页
     ·拟南芥植株的细胞学观察——树脂半薄切片第26-27页
     ·拟南芥植株DNA的小量抽提(研磨法)第27-28页
     ·高通量PCR模板DNA提取法(水煮法):第28页
     ·基因定位中PCR反应第28-29页
     ·分子标记的引物设计第29-30页
 3. 结果与讨论第30-37页
   ·突变体MA的表型与遗传学分析第30-32页
   ·突变体MA的定位第32-36页
     ·初定位第32-34页
     ·精细定位及等位分析第34-36页
   ·讨论第36-37页
 参考文献第37-39页
第二部分 拟南芥MTN3/SALIVA基因家族分析第39-71页
 摘要第39-41页
 ABSTRACT第41-42页
 1. 前言第42-52页
   ·生物信息学第42-45页
     ·生物信息学的产生第42页
     ·生物信息学的定义第42页
     ·生物信息学的研究内容第42-43页
     ·生物信息学的发展阶段第43-44页
     ·方法和技术第44-45页
   ·分子生物学基础第45页
   ·分子系统发生第45-46页
   ·系统进化树第46-50页
     ·构建系统进化树的依据第47页
     ·序列进化树步骤第47-49页
       ·序列相似性比较第47-48页
       ·序列同源性分析第48页
       ·序列文件格式(郝柏林等,2000)第48-49页
       ·构建系统进化树第49页
       ·稳定性检验第49页
     ·建树方法第49-50页
   ·基因家族第50-51页
     ·MtN3/saliva家族第50-51页
   ·RT-PCR第51页
   ·本文的意义第51-52页
 2. 材料与方法第52-58页
   ·实验材料第52-55页
     ·植物材料第52页
     ·生化试剂第52页
     ·主要仪器第52页
     ·实验所用的实时定量RT-PCR引物:(表1)第52-53页
     ·软件与网络资源第53-55页
       ·TAIR拟南芥信息资源(The Arabidopsis Information Resources)第53页
       ·TAIR 中的BLASTp(http://www.arabidopsis.org/Blast/index.jsp)第53-54页
       ·Chromosome Map Tool第54页
       ·Gene Structure Display Server第54页
       ·TMHMM Server v. 2.0第54页
       ·ClustalW第54页
       ·BOXSHADE第54页
       ·Mega软件(版本4.1)第54页
       ·e-FP Browser第54-55页
       ·Genevestigater第55页
       ·Pfam数据库信息第55页
   ·实验具体操作第55-58页
     ·拟南芥MtN3/saliva家族基因的获得第55页
     ·基因结构分析第55-56页
     ·MtN3 家族蛋白结构域分析第56页
     ·基因序列分析及构建系统进化树第56页
     ·表达分析第56页
       ·基因表达情况的获得第56页
       ·RNA抽提反转录第56-57页
       ·RNA反转录cDNA第57页
       ·定量PCR第57-58页
 3. 结果与讨论第58-68页
   ·拟南芥MTN3/SALIVA家族成员确定及染色体分布第58-60页
   ·MTN3/SALIVA家族的基因结构第60-61页
   ·MTN3/SALIVA家族蛋白结构域分析第61-62页
   ·家族成员序列分析及进化分析第62-63页
   ·拟南芥MTN3/SALIVA家族基因表达分析第63-66页
   ·讨论第66-68页
 参考文献第68-71页
附录第71-96页
致谢第96-97页
攻读学位期间发表的研究成果第97页

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