| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 缩略词 | 第18-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-52页 |
| 1.1 水稻产量及农艺性状的遗传研究进展 | 第20-34页 |
| 1.1.1 水稻粒形性状的遗传研究进展 | 第20-27页 |
| 1.1.1.1 目前已克隆粒形性状基因 | 第20-25页 |
| 1.1.1.2 突变体克隆的稻谷粒形基因 | 第25-26页 |
| 1.1.1.3 初定位粒形QTL | 第26-27页 |
| 1.1.2 水稻农艺性状的遗传研究进展 | 第27-34页 |
| 1.1.2.1 水稻抽穗期的遗传研究进展 | 第27-31页 |
| 1.1.2.2 水稻株高、分蘖数和每穗粒数等株型性状的遗传研究进展 | 第31-34页 |
| 1.2 稻米蒸煮与食用品质的遗传研究进展 | 第34-43页 |
| 1.2.1 淀粉合成途径和淀粉酶突变体的研究 | 第35-40页 |
| 1.2.1.1 淀粉的结构 | 第35页 |
| 1.2.1.2 水稻淀粉合成酶的研究进展 | 第35-38页 |
| 1.2.1.3 水稻淀粉酶突变体的研究进展 | 第38-40页 |
| 1.2.2 评价稻米蒸煮与食用品质的指标 | 第40-42页 |
| 1.2.3 稻米蒸煮与食用品质的遗传研究进展 | 第42-43页 |
| 1.3 稻米营养品质的遗传研究进展 | 第43-48页 |
| 1.3.1 酚酸化合物的结构及其种类 | 第44页 |
| 1.3.2 酚酸在不同稻米中的抗氧化活性、分布及含量 | 第44-46页 |
| 1.3.3 稻米种皮颜色基因及酚酸QTL定位的遗传研究进展 | 第46-48页 |
| 1.4 QTL定位研究方法 | 第48-51页 |
| 1.4.1 作图亲本的选择 | 第48页 |
| 1.4.2 初级定位群体和次级定位群体 | 第48-50页 |
| 1.4.3 关联分析 | 第50-51页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第51-52页 |
| 第二章 水稻粒重QTL的快速定位及其育种应用 | 第52-62页 |
| 2.1 材料和方法 | 第52-55页 |
| 2.1.1 重组自交系群体的构建和表型测量 | 第52页 |
| 2.1.2 DNA提取纯化 | 第52-53页 |
| 2.1.3 SLAF文库构建和测序 | 第53页 |
| 2.1.4 分子标记的设计和群体基因型鉴定 | 第53-54页 |
| 2.1.5 连锁图谱的构建和数量性状位点定位 | 第54页 |
| 2.1.6 数据分析 | 第54-55页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第55-60页 |
| 2.2.1 SLAFs多态性分析及QTL热点区域的快速定位 | 第55-58页 |
| 2.2.2 连锁图谱构建和QTL定位 | 第58-59页 |
| 2.2.3 粒重相关性状的方差分析 | 第59-60页 |
| 2.2.4 优良等位基因聚合及分子辅助育种 | 第60页 |
| 2.3 结论 | 第60-62页 |
| 第三章 RIL群体遗传图谱构建及农艺性状的QTL定位 | 第62-72页 |
| 3.1 材料和方法 | 第62-63页 |
| 3.1.1 材料 | 第62页 |
| 3.1.2 表型性状测量 | 第62页 |
| 3.1.3 数据统计和QTL定位 | 第62-63页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第63-71页 |
| 3.2.1 亲本和RIL群体的表型变异 | 第63页 |
| 3.2.2 粒形性状和植株形态性状之间的相关性分析 | 第63-64页 |
| 3.2.3 QTL定位 | 第64-71页 |
| 3.2.3.1 粒形相关性状QTL定位 | 第64-68页 |
| 3.2.3.2 植株形态和分蘖性状QTL定位 | 第68-70页 |
| 3.2.3.3 成簇QTL | 第70-71页 |
| 3.3 结论 | 第71-72页 |
| 第四章 RIL群体淀粉品质性状的QTL定位 | 第72-86页 |
| 4.1 材料和方法 | 第72-73页 |
| 4.1.1 材料 | 第72页 |
| 4.1.2 AAC和蛋白质含量的测定 | 第72-73页 |
| 4.1.3 RVA谱性状测定 | 第73页 |
| 4.1.4 连锁图谱的构建和QTL定位 | 第73页 |
| 4.1.5 数据分析 | 第73页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第73-85页 |
| 4.2.1 表型性状在亲本和RIL群体间的变异 | 第74页 |
| 4.2.2 所有性状之间的相关性分析 | 第74-75页 |
| 4.2.3 遗传连锁图谱的构建和QTL定位 | 第75-77页 |
| 4.2.3.1 AAC | 第76页 |
| 4.2.3.2 蛋白质含量 | 第76页 |
| 4.2.3.3 PV、HPV、CPV、BD、SB和CS | 第76-77页 |
| 4.2.3.4 Ptime和PTemp | 第77页 |
| 4.2.4 不同Wx_基因型RIL亚群中Wx基因相关性状的多重比较 | 第77-78页 |
| 4.2.5 基于Wx基因型的两个亚群的QTL定位 | 第78-85页 |
| 4.3 结论 | 第85-86页 |
| 第五章 稻米淀粉品质的全基因组关联分析 | 第86-101页 |
| 5.1 材料和方法 | 第86-87页 |
| 5.1.1 数据分析 | 第86页 |
| 5.1.2 群体结构和主成分分析 | 第86页 |
| 5.1.3 全基因组关联分析 | 第86-87页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第87-99页 |
| 5.2.1 稻米品质性状的表型变异和群体结构对表型变异的影响 | 第87-89页 |
| 5.2.2 关联分析 | 第89-96页 |
| 5.2.2.1 Whole panel全基因组关联分析 | 第89页 |
| 5.2.2.2 Panel 1和Panel 2全基因组关联分析 | 第89-90页 |
| 5.2.2.3 籼稻panel和粳稻panel全基因组关联分析 | 第90-96页 |
| 5.2.3 不同panel之间的QTL比较 | 第96-99页 |
| 5.2.4 在特定panel中存在的QTL | 第99页 |
| 5.3 结论 | 第99-101页 |
| 第六章 稻米抗氧化特性的全基因组关联分析 | 第101-116页 |
| 6.1 材料和方法 | 第101-105页 |
| 6.1.1 可溶性自由酚酸的提取 | 第101页 |
| 6.1.2 不可溶性结合酚酸的提取 | 第101-102页 |
| 6.1.3 酚酸含量的测定 | 第102页 |
| 6.1.4 类黄酮含量的测定 | 第102页 |
| 6.1.5 ABTS分析 | 第102-103页 |
| 6.1.6 DPPH分析 | 第103页 |
| 6.1.7 高效液相色谱分析 | 第103-104页 |
| 6.1.8 数据分析和全基因组关联分析 | 第104-105页 |
| 6.2 结果和讨论 | 第105-115页 |
| 6.2.1 酚酸和总类黄酮在3个panel的表型变异 | 第105-106页 |
| 6.2.2 抗氧化特性 | 第106-109页 |
| 6.2.3 结合酚酸的定性和定量分析 | 第109页 |
| 6.2.4 相关性分析 | 第109-110页 |
| 6.2.5 全基因组关联分析 | 第110-115页 |
| 6.2.5.1 whole panel全基因组关联分析 | 第110-111页 |
| 6.2.5.2 白米panel全基因组关联分析 | 第111-115页 |
| 6.3 结论 | 第115-116页 |
| 第七章 总结与展望 | 第116-118页 |
| 参考文献 | 第118-129页 |
| 作者简历 | 第129页 |
