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互花米草入侵对沿海滩涂湿地好氧甲烷氧化菌的影响

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
第1章 文献综述第10-25页
    1.1 沿海湿地分布与CH_4排放第10-13页
        1.1.1 大气CH_4的来源第10-11页
        1.1.2 沿海湿地CH_4排放第11-12页
        1.1.3 沿海湿地的类型与分布第12页
        1.1.4 植被类型对沿海湿地CH_4排放的影响第12-13页
    1.2 湿地CH_4氧化途径与甲烷氧化菌第13-20页
        1.2.1 湿地CH_4的产生与氧化途径第13-14页
        1.2.2 甲烷氧化菌及甲烷单加氧酶和标记基因第14-17页
        1.2.3 自然湿地中甲烷氧化菌群落结构的研究第17-18页
        1.2.4 甲烷氧化菌群落结构的研究方法第18-20页
    1.3 植物入侵对土壤性质及微生物群落结构的影响第20-25页
        1.3.1 植物入侵的途径第20页
        1.3.2 植物入侵对土壤性质及微生物群落结构的影响第20-21页
        1.3.3 互花米草入侵对沿海湿地土壤性质和微生物群落结构的影响第21-25页
第2章 研究背景和研究内容第25-28页
    2.1 研究背景第25-26页
    2.2 研究内容与技术路线第26-28页
        2.2.1 研究内容第26页
        2.2.2 研究目标第26-27页
        2.2.3 技术路线第27页
        2.2.4 拟解决的科学问题第27-28页
第3章 不同入侵年限互花米草对沿海湿地表层土壤好氧甲烷氧化菌的影响第28-42页
    3.1 前言第28-29页
    3.2 材料与方法第29-33页
        3.2.1 研究区域概况第29-30页
        3.2.2 土壤样品采集和理化指标分析第30页
        3.2.3 甲烷氧化潜势测定第30-31页
        3.2.4 DNA提取第31页
        3.2.5 T-RFLP分析第31-32页
        3.2.6 pmoA功能基因克隆、测序和构建系统发育树第32页
        3.2.7 实时荧光定量PCR第32页
        3.2.8 数据处理及分析第32-33页
    3.3 结果与分析第33-40页
        3.3.1 土壤和植被性质第33页
        3.3.2 甲烷氧化潜势第33-36页
        3.3.3 细菌16S rRNA基因和甲烷氧化菌pmoA基因的丰度第36-37页
        3.3.4 甲烷氧化菌群落结构和多样性第37-38页
        3.3.5 pmoA基因克隆文库的构建第38-40页
    3.4 讨论第40-41页
        3.4.1 不同入侵年限互花米草对盐城湿地土壤理化性质的影响第40页
        3.4.2 不同入侵年限互花米草对盐城湿地甲烷氧化潜势的影响第40-41页
        3.4.3 不同入侵年限互花米草对盐城湿地甲烷氧化菌的影响第41页
    3.5 结论第41-42页
第4章 互花米草入侵对沿海湿地剖面土壤好氧甲烷氧化菌的影响第42-54页
    4.1 前言第42-43页
    4.2 材料与方法第43-44页
        4.2.1 研究区域概况第43页
        4.2.2 土壤样品采集和理化性质分析第43页
        4.2.3 甲烷氧化潜势测定第43页
        4.2.4 DNA提取第43页
        4.2.5 T-RFLP分析第43-44页
        4.2.6 实时荧光定量PCR第44页
        4.2.7 数据分析第44页
    4.3 结果与分析第44-51页
        4.3.1 土壤理化性质第44-45页
        4.3.2 甲烷氧化潜势第45-48页
        4.3.3 pmoA基因丰度第48-49页
        4.3.4 甲烷氧化菌群落结构第49-51页
    4.4 讨论第51-53页
        4.4.1 互花米草入侵对盐城湿地剖面土壤理化性质的影响第51页
        4.4.2 互花米草入侵对盐城湿地剖面土壤甲烷氧化潜势的影响第51-52页
        4.4.3 互花米草入侵对盐城湿地剖面土壤甲烷氧化菌的影响第52-53页
    4.5 结论第53-54页
第5章 互花米草入侵对沿海湿地“活跃”甲烷氧化菌类群的影响第54-70页
    5.1 前言第54页
    5.2 材料与方法第54-57页
        5.2.1 研究区域概况第54页
        5.2.2 ~(13)C-CH_4培养实验和甲烷氧化潜势测定第54-55页
        5.2.3 DNA提取和氯化铯密度梯度离心第55-56页
        5.2.4 16S rRNA基因T-RFLP分析第56页
        5.2.5 16S rRNA基因克隆、测序和构建系统发育树第56页
        5.2.6 pmoA基因的qPCR分析第56页
        5.2.7 Miseq高通量测序第56-57页
        5.2.8 数据分析第57页
    5.3 结果与分析第57-67页
        5.3.1 土壤性质第57-59页
        5.3.2 培养过程中的甲烷氧化速率第59-60页
        5.3.3 ~(12)C-CH_4和~(13)C-CH_4微域培养后甲烷氧化菌丰度第60页
        5.3.4 pmoA-qPCR检测不同密度梯度中甲烷氧化菌丰度第60-61页
        5.3.5 T-RFLP检测不同密度梯度中细菌的相对丰度第61页
        5.3.6 重组DNA中16S rRNA基因细菌克隆文库的构建第61-64页
        5.3.7 土壤中~(13)C-CH_4标记的Miseq测序第64-67页
    5.4 讨论第67-69页
    5.5 结论第69-70页
第6章 总结与展望第70-72页
    6.1 主要结论第70-71页
    6.2 研究特色与创新点第71页
    6.3 研究不足和展望第71-72页
参考文献第72-88页
附录第88-89页
致谢第89页

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