中文摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第1章 引言 | 第8-16页 |
1.1 研究背景 | 第8-13页 |
1.1.1 MicroRNA的概念 | 第8-9页 |
1.1.2 MicroRNA的命名规则 | 第9页 |
1.1.3 生物标志物的定义及分类 | 第9-10页 |
1.1.4 MicroRNA作为疾病生物标志物 | 第10-13页 |
1.2 研究内容 | 第13-14页 |
1.2.1 人类microRNA-mRNA调控网络的重构与分析 | 第13页 |
1.2.2 MicroRNA生物标志物识别模型的构建与实现 | 第13-14页 |
1.3 研究目的和意义 | 第14-16页 |
1.3.1 研究目的 | 第14页 |
1.3.2 研究意义 | 第14-15页 |
1.3.3 创新性分析 | 第15-16页 |
第2章 MicroRNA生物标志物识别的研究现状 | 第16-22页 |
2.1 生物学实验筛选 | 第16-17页 |
2.1.1 原理与方法 | 第16-17页 |
2.1.2 优势与局限 | 第17页 |
2.2 生物信息学模型预测 | 第17-22页 |
2.2.1 原理与方法 | 第17-20页 |
2.2.2 优势与局限 | 第20-22页 |
第3章 人类microRNA-mRNA调控网络的重构与分析 | 第22-33页 |
3.1 数据准备 | 第22-23页 |
3.1.1 人类microRNA及microRNA-mRNA靶标对 | 第22页 |
3.1.2 人类蛋白质-蛋白质相互作用关系 | 第22-23页 |
3.1.3 转录因子基因和基因年龄信息 | 第23页 |
3.1.4 已报道的microRNA生物标志物 | 第23页 |
3.2 网络构建与分析 | 第23-26页 |
3.2.1 数据预处理 | 第23-24页 |
3.2.2 网络整合 | 第24页 |
3.2.3 网络属性分析 | 第24-26页 |
3.3 MicroRNA生物标志物的网络特征 | 第26-33页 |
3.3.1 MicroRNA-mRNA调控模式 | 第26-27页 |
3.3.2 网络特征挖掘 | 第27-29页 |
3.3.3 网络特征分析 | 第29-33页 |
第4章 MicroRNA生物标志物识别模型的构建与实现 | 第33-54页 |
4.1 模型构建 | 第33-35页 |
4.2 算法设计与实现 | 第35-37页 |
4.2.1 算法设计 | 第35-36页 |
4.2.2 程序实现 | 第36-37页 |
4.3 数据库设计与实现 | 第37-39页 |
4.3.1 需求分析 | 第37-38页 |
4.3.2 结构设计 | 第38-39页 |
4.3.3 数据库实现 | 第39页 |
4.4 软件架构与实现 | 第39-46页 |
4.4.1 软件架构 | 第39-41页 |
4.4.2 开发环境 | 第41页 |
4.4.3 系统集成 | 第41-46页 |
4.5 软件应用与性能分析 | 第46-54页 |
4.5.1 案例应用 | 第46-48页 |
4.5.2 网络可靠性分析 | 第48-51页 |
4.5.3 预测精度比较 | 第51-54页 |
第5章 总结与展望 | 第54-56页 |
5.1 课题总结 | 第54-55页 |
5.2 研究展望 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-62页 |
附录 | 第62-70页 |
攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第70-71页 |
致谢 | 第71-72页 |