| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstrast | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-20页 |
| 1.1 分蘖发生的生物学特征 | 第12页 |
| 1.2 分蘖发生的影响因素 | 第12-15页 |
| 1.2.1 分蘖发生的激素变化机理 | 第12-14页 |
| 1.2.2 分蘖发生的分子机理 | 第14-15页 |
| 1.3 甘蔗的分蘖特征与机械化种植关系 | 第15-16页 |
| 1.4 植物生长调节剂 | 第16-17页 |
| 1.5 转录组技术研究进展 | 第17-18页 |
| 1.6 本研究立论依据以及研究意义 | 第18页 |
| 1.7 技术路线 | 第18-20页 |
| 第二章 甘蔗幼苗形态学指标统计及植物内源激素测定 | 第20-27页 |
| 2.1 实验材料及处理 | 第20页 |
| 2.1.1 材料处理 | 第20页 |
| 2.2 测定项目及方法 | 第20-21页 |
| 2.3 数据分析 | 第21页 |
| 2.4 结果与分析 | 第21-27页 |
| 2.4.1 DA-6处理的甘蔗组培苗形态学指标统计分析 | 第21-24页 |
| 2.4.1.1 DA-6处理对甘蔗幼苗平均分蘖率的影响 | 第21-22页 |
| 2.4.1.2 DA-6与6-BA浓度对甘蔗组培苗分蘖影响及互作分析 | 第22-24页 |
| 2.4.2 DA-6处理下的甘蔗组培苗不同生长阶段内源激素变化分析 | 第24-27页 |
| 第三章 甘蔗组培苗应答DA-6处理的转录组分析 | 第27-42页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第27-28页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第27页 |
| 3.1.2 实验方法与步骤 | 第27-28页 |
| 3.1.2.1 RNA样品检测 | 第27页 |
| 3.1.2.2 cDNA文库的构建 | 第27页 |
| 3.1.2.3 上机测序 | 第27-28页 |
| 3.2 转录组数据处理和分析 | 第28-31页 |
| 3.2.1 基因结构(CDS)分析 | 第29页 |
| 3.2.2 Unigene功能注释 | 第29-30页 |
| 3.2.3 差异表达基因分析 | 第30页 |
| 3.2.3.1 差异表达基因筛选 | 第30页 |
| 3.2.3.2 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第30页 |
| 3.2.4 甘蔗分蘖基因分析 | 第30-31页 |
| 3.3 结果与分析 | 第31-42页 |
| 3.3.1 RNA质量分析 | 第31-32页 |
| 3.3.2 产量统计 | 第32-33页 |
| 3.3.3 序列组装 | 第33-34页 |
| 3.3.4 基因结构(CDS)分析 | 第34-35页 |
| 3.3.5 Unigene注释 | 第35-36页 |
| 3.3.6 差异表达基因分析 | 第36-40页 |
| 3.3.6.1 差异表达基因筛选 | 第36-37页 |
| 3.3.6.2 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第37-40页 |
| 3.3.7 甘蔗分蘖基因分析 | 第40-42页 |
| 第四章 甘蔗分蘖相关基因ScTB1的克隆与表达分析 | 第42-52页 |
| 4.1 实验材料及处理 | 第42页 |
| 4.2 实验药品 | 第42页 |
| 4.3 实验方法 | 第42-45页 |
| 4.3.1 甘蔗基因组DNA和总RNA提取 | 第42页 |
| 4.3.2 cDNA第一链的合成 | 第42-43页 |
| 4.3.3 甘蔗分蘖相关基因ScTB1的克隆 | 第43-45页 |
| 4.3.3.1 引物设计 | 第43页 |
| 4.3.3.2 ScTB1基因的克隆 | 第43-44页 |
| 4.3.3.3 序列分析 | 第44-45页 |
| 4.3.4 实时荧光定量PCR表达 | 第45页 |
| 4.4 结果与分析 | 第45-52页 |
| 4.4.1 甘蔗ScTB1基因的克隆与分析 | 第45-47页 |
| 4.4.2 甘蔗ScTB1基因的生物信息学分析 | 第47-50页 |
| 4.4.2.1 甘蔗ScTB1基因编码蛋白理化性质分析 | 第47页 |
| 4.4.2.2 甘蔗ScTB1蛋白二级结构预测和分析 | 第47-48页 |
| 4.4.2.3 甘蔗ScTB1蛋白信号肽预测和分析 | 第48-49页 |
| 4.4.2.4 甘蔗ScTB1蛋白疏水性/亲水性预测和分析 | 第49页 |
| 4.4.2.5 甘蔗ScTB1蛋白亚细胞定位分析 | 第49-50页 |
| 4.4.2.6 甘蔗ScTB1氨基酸序列的保守结构域分析 | 第50页 |
| 4.4.3 实时荧光定量PCR表达分析 | 第50-52页 |
| 第五章 全文结论及讨论 | 第52-56页 |
| 5.1 DA-6的处理浓度对甘蔗幼苗分蘖影响与幼苗生长的影响 | 第52页 |
| 5.2 甘蔗组培苗分蘖期内源激素的作用 | 第52页 |
| 5.3 DA-6处理下甘蔗幼苗转录组分析 | 第52-53页 |
| 5.4 甘蔗分蘖相关基因分析 | 第53-54页 |
| 5.5 分蘖基因ScTB1的克隆与表达分析 | 第54-55页 |
| 5.6 后续研究 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 附录Ⅰ 甘蔗植株总RNA的提取步骤 | 第61-62页 |
| 附录Ⅱ 处理7与对照组两两比较差异基因COG功能注释图 | 第62-65页 |
| 附录Ⅲ 甘蔗分蘖相关基因序列 | 第65-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
