基于高维稀疏矩阵隐特征分析的蛋白质相互作用预测技术研究
中文摘要 | 第3-4页 |
英文摘要 | 第4-5页 |
1 绪论 | 第8-14页 |
1.1 研究背景与意义 | 第8-10页 |
1.1.1 蛋白质间相互作用预测的背景与意义 | 第8-9页 |
1.1.2 矩阵的隐特征分析研究背景与意义 | 第9-10页 |
1.2 研究现状与趋势 | 第10-11页 |
1.3 研究目的与内容 | 第11-13页 |
1.3.1 研究目的 | 第11-12页 |
1.3.2 研究内容 | 第12-13页 |
1.4 论文组织结构 | 第13-14页 |
2 基本方法 | 第14-20页 |
2.1 蛋白质相互作用预测模型 | 第14页 |
2.2 奇异值分解 | 第14-16页 |
2.3 隐特征模型 | 第16-20页 |
3 非负隐特征的正则化抽取 | 第20-32页 |
3.1 非负隐特征模型 | 第21-22页 |
3.2 抽取非负隐特征的正则化方法 | 第22-25页 |
3.2.1 频率加权正则化方案 | 第22-23页 |
3.2.2 带频率加权正则化的NLF模型 | 第23-25页 |
3.3 实验结果 | 第25-30页 |
3.3.1 实验设置 | 第25-26页 |
3.3.2 参数灵敏度测试 | 第26-29页 |
3.3.3 对比测试 | 第29-30页 |
3.4 本章小结 | 第30-32页 |
4 对称非负隐特征模型 | 第32-64页 |
4.1 蛋白质间相互作用预测模型 | 第33-34页 |
4.2 对称非负矩阵因式分解模型 | 第34页 |
4.3 对称非负隐特征模型相关理论与扩展 | 第34-39页 |
4.3.1 对称非负隐特征模型 | 第35-36页 |
4.3.2 对称与非对称隐特征模型的关系 | 第36-38页 |
4.3.3 偏差对称隐特征模型 | 第38-39页 |
4.4 相关算法设计与分析 | 第39-43页 |
4.5 实验结果与分析 | 第43-61页 |
4.5.1 实验设置 | 第43-45页 |
4.5.2 对比实验结果 | 第45-55页 |
4.5.3 蛋白质预测实验结果 | 第55-61页 |
4.6 本章小结 | 第61-64页 |
5 蛋白质相互作用预测应用展示图形化设计 | 第64-70页 |
5.1 需求分析 | 第64-65页 |
5.1.1 功能需求 | 第64页 |
5.1.2 性能需求 | 第64-65页 |
5.1.3 数据需求 | 第65页 |
5.2 系统设计 | 第65-69页 |
5.2.1 架构模式 | 第65-66页 |
5.2.2 模块设计 | 第66-69页 |
5.3 实现 | 第69页 |
5.4 本章小结 | 第69-70页 |
6 总结与展望 | 第70-72页 |
6.1 主要内容总结 | 第70-71页 |
6.2 后续研究工作展望 | 第71-72页 |
致谢 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-80页 |
附录I | 第80-82页 |
A. 作者在攻读学位期间发表的论文目录: | 第80-82页 |
附录II | 第82-88页 |