| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第1章 引言 | 第10-32页 |
| 1.1 放线菌概述 | 第10页 |
| 1.2 植物内生菌 | 第10-12页 |
| 1.2.1 植物内生菌研究简要历程 | 第10-11页 |
| 1.2.2 植物内生菌定义 | 第11-12页 |
| 1.3 小单孢菌的研究概况 | 第12-29页 |
| 1.3.1 小单孢菌的主要特性 | 第12-13页 |
| 1.3.2 小单孢菌在分类单元中的研究历史及现状 | 第13页 |
| 1.3.3 小单孢菌产生的活性物质 | 第13-29页 |
| 1.4 高通量测序技术在放线菌基因组学研究中的应用 | 第29-30页 |
| 1.5 东乡野生稻及其内生菌研究概况 | 第30页 |
| 1.5.1 东乡野生稻 | 第30页 |
| 1.5.2 东乡野生稻内生微生物研究现状 | 第30页 |
| 1.6 研究意义及主要内容 | 第30-32页 |
| 1.6.1 研究意义 | 第30-31页 |
| 1.6.2 主要研究内容 | 第31-32页 |
| 第2章 内生放线菌FORO54的多相分类 | 第32-44页 |
| 2.1 引言 | 第32页 |
| 2.2 实验材料 | 第32-35页 |
| 2.2.1 实验菌株 | 第32页 |
| 2.2.2 培养基 | 第32-33页 |
| 2.2.3 实验仪器 | 第33-34页 |
| 2.2.4 实验试剂 | 第34-35页 |
| 2.3 实验方法 | 第35-38页 |
| 2.3.1 放线菌基因组DNA的提取 | 第35页 |
| 2.3.2 放线菌 16S rRNA基因序列 的PCR扩增 | 第35-36页 |
| 2.3.3 16S rRNA基因序列测定及系统发育树的构建 | 第36页 |
| 2.3.4 形态学特征 | 第36页 |
| 2.3.5 培养特征 | 第36-37页 |
| 2.3.6 生理生化鉴定 | 第37-38页 |
| 2.4 结果与分析 | 第38-42页 |
| 2.4.1 菌株FORO54的 16S rRNA基因序列及系统发育分析 | 第38-40页 |
| 2.4.2 菌株FORO54的形态 | 第40页 |
| 2.4.3 菌株FORO54和M. rosaria DSM 803T的培养特征 | 第40-41页 |
| 2.4.4 菌株FORO54和M. rosaria DSM 803T的生理生化特征 | 第41-42页 |
| 2.5 本章小结 | 第42-44页 |
| 第3章 小单孢菌FORO54的全基因组测序及分析 | 第44-53页 |
| 3.1 引言 | 第44页 |
| 3.2 材料与方法 | 第44-45页 |
| 3.2.1 菌株及来源 | 第44页 |
| 3.2.2 培养基及试剂 | 第44页 |
| 3.2.3 菌株培养及基因组DNA提取 | 第44-45页 |
| 3.2.4 基因组测序、组装及基因组注释 | 第45页 |
| 3.2.5 次级代谢产物合成基因簇分析 | 第45页 |
| 3.3 结果与分析 | 第45-51页 |
| 3.3.1 小单孢菌FORO54基因组组装及序列基本特征比较分析 | 第45-46页 |
| 3.3.2 小单孢菌FORO54蛋白质COG聚类分析 | 第46-48页 |
| 3.3.3 小单孢菌FORO54蛋白质GO聚类分析 | 第48-49页 |
| 3.3.4 小单孢菌FORO54次级代谢产物合成基因簇分析 | 第49-51页 |
| 3.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 3.4.1 小单孢菌全基因组测序及分析 | 第51页 |
| 3.4.2 小单孢菌次级代谢产物研究 | 第51-53页 |
| 第4章 菌株FORO54的发酵液活性测试 | 第53-63页 |
| 4.1 引言 | 第53页 |
| 4.2 实验材料 | 第53-54页 |
| 4.2.1 供试菌株 | 第53页 |
| 4.2.2 培养基 | 第53-54页 |
| 4.2.3 实验仪器及试剂 | 第54页 |
| 4.3 实验方法 | 第54-56页 |
| 4.3.1 菌株FORO54发酵液的抗菌活性初步测定 | 第54-55页 |
| 4.3.2 菌株FORO54发酵液的理化稳定性 | 第55-56页 |
| 4.3.3 菌株FORO54发酵液的预处理 | 第56页 |
| 4.3.4 菌株FORO54活性浸膏的生物自显影实验 | 第56页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第56-61页 |
| 4.4.1 菌株FORO54发酵液抑细菌活性 | 第56-57页 |
| 4.4.2 菌株FORO54的发酵液的抑真菌活性 | 第57-58页 |
| 4.4.3 菌株FORO54发酵液的理化稳定性 | 第58-60页 |
| 4.4.4 菌株 FORO54 发酵液的分部萃取 | 第60-61页 |
| 4.4.5 菌株FORO54浸膏的生物自显影实验 | 第61页 |
| 4.5 本章小结 | 第61-63页 |
| 结论与展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
