| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 功能注释表 | 第13-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-20页 |
| 1.1 细菌中第二信使c-di-GMP信号调控网络 | 第14-17页 |
| 1.1.1 c-di-GMP的合成途径 | 第14-15页 |
| 1.1.2 c-di-GMP的降解途径 | 第15页 |
| 1.1.3 c-di-GMP信号受体 | 第15-17页 |
| 1.1.4 c-di-GMP信号调控下游表型 | 第17页 |
| 1.2 水稻白叶枯病菌c-di-GMP信号网络 | 第17-18页 |
| 1.3 水稻白叶枯病菌c-di-GMP受体 | 第18页 |
| 1.3.1 转录调控因子Clp | 第18页 |
| 1.3.2 PilZ结构域蛋白 | 第18页 |
| 1.3.3 退化的GGDEF/EAL结构域蛋白 | 第18页 |
| 1.4 本研究的目的意义和技术路线 | 第18-20页 |
| 1.4.1 目的意义 | 第18-19页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第19-20页 |
| 第二章 Filp/PXO_02715 共调控元的验证 | 第20-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 菌株、质粒和引物 | 第20页 |
| 2.1.2 主要的仪器和试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.3 培养基和菌株培养条件 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 原核表达载体构建 | 第21页 |
| 2.2.2 蛋白表达和纯化 | 第21-22页 |
| 2.2.3 蛋白抗体制作 | 第22-23页 |
| 2.2.4 蛋白表达情况的分析 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-30页 |
| 2.3.1 目的基因PCR扩增及TA克隆 | 第24-26页 |
| 2.3.2 原核表达载体的构建 | 第26-28页 |
| 2.3.3 蛋白表达和纯化 | 第28-29页 |
| 2.3.4 不同Xoo菌株总蛋白的制备 | 第29-30页 |
| 2.3.5 蛋白表达情况的分析 | 第30页 |
| 2.4 讨论和小结 | 第30-32页 |
| 第三章 Filp/PXO_02715 共调控元转录分析 | 第32-36页 |
| 3.1 实验材料 | 第32-33页 |
| 3.1.1 菌株、质粒和引物 | 第32页 |
| 3.1.2 主要的仪器和试剂 | 第32页 |
| 3.1.3 培养基和菌株培养条件 | 第32-33页 |
| 3.2 实验方法 | 第33页 |
| 3.2.1 不同引物特异性验证 | 第33页 |
| 3.2.2 不同菌株RNA的提取 | 第33页 |
| 3.2.3 qRT-PCR检测下游共调控元基因的表达 | 第33页 |
| 3.3 结果与分析 | 第33-35页 |
| 3.3.1 不同菌株RNA的提取 | 第33-34页 |
| 3.3.2 qRT-PCR分析下调表达蛋白相对基因的表达 | 第34-35页 |
| 3.3.3 qRT-PCR分析上调表达蛋白相对基因的表达 | 第35页 |
| 3.4 讨论和小结 | 第35-36页 |
| 第四章 Filp/PXO_02715 共调控蛋白的功能分析 | 第36-51页 |
| 4.1 实验材料 | 第36-38页 |
| 4.1.1 菌株、质粒和引物 | 第36页 |
| 4.1.2 主要的试剂和仪器 | 第36页 |
| 4.1.3 培养基和菌株培养条件 | 第36-38页 |
| 4.2 实验方法 | 第38-41页 |
| 4.2.1 突变体及互补菌株构建 | 第38-39页 |
| 4.2.2 胞内c-di-GMP浓度测定 | 第39-40页 |
| 4.2.3 突变体表型测定 | 第40-41页 |
| 4.3 结果与分析 | 第41-49页 |
| 4.3.1 突变体及互补菌株构建 | 第41-45页 |
| 4.3.2 胞内c-di-GMP浓度测定 | 第45页 |
| 4.3.3 突变体表型测定 | 第45-49页 |
| 4.4 讨论和小结 | 第49-51页 |
| 第五章 水稻白叶枯病菌HD-GYP结构域蛋白PXO_03945 的功能鉴定（附录） | 第51-60页 |
| 5.1 实验材料 | 第51页 |
| 5.1.1 菌株、质粒和引物 | 第51页 |
| 5.1.2 主要的试剂和仪器 | 第51页 |
| 5.1.3 培养基和菌株培养条件 | 第51页 |
| 5.2 实验方法 | 第51-52页 |
| 5.2.1 突变体及互补菌株构建 | 第51-52页 |
| 5.2.2 胞内c-di-GMP浓度测定 | 第52页 |
| 5.2.3 突变体表型测定 | 第52页 |
| 5.3 结果与分析 | 第52-58页 |
| 5.3.1 PXO_03945 基因克隆、功能结构域和序列同源性 | 第52-53页 |
| 5.3.2 PXO_03945 突变体及互补菌株构建 | 第53-55页 |
| 5.3.3 ?PXO_03945 胞内c-di-GMP浓度 | 第55-56页 |
| 5.3.4 突变体表型测定 | 第56-58页 |
| 5.4 讨论和小结 | 第58-60页 |
| 第六章 全文结论和展望 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-69页 |
| 附录 | 第69-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 作者简历 | 第74页 |
