| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第13-14页 |
| 文献综述 | 第14-21页 |
| 1 鼠伤寒沙门菌概况 | 第14页 |
| 2 喹诺酮类药物概况 | 第14-15页 |
| 3 沙门菌对喹诺酮类药物的耐药现状 | 第15页 |
| 4 FQs的作用机制 | 第15页 |
| 5 沙门菌对FQs的耐药机制 | 第15-18页 |
| 5.1 靶点酶氨基酸序列突变 | 第16页 |
| 5.2 主动外排系统表达 | 第16-17页 |
| 5.3 质粒介导耐药 | 第17-18页 |
| 5.4 细胞外膜蛋白表达量下降 | 第18页 |
| 6 诱导耐药与秀丽隐杆线虫 | 第18-19页 |
| 6.1 秀丽隐杆线虫研究进展 | 第18-19页 |
| 6.2 沙门菌体内诱导耐药 | 第19页 |
| 7 转录组测序技术研究进展 | 第19-21页 |
| 7.1 转录组测序技术原理 | 第19-20页 |
| 7.2 RNA-seq技术的应用 | 第20-21页 |
| 引言 | 第21-22页 |
| 1 材料与方法 | 第22-36页 |
| 1.1. 材料 | 第22-23页 |
| 1.1.1 实验菌株、质粒和线虫 | 第22页 |
| 1.1.2 抗菌药物 | 第22页 |
| 1.1.3 培养基和分子生物学试剂 | 第22页 |
| 1.1.4 培养基、缓冲液和常用试剂的配制 | 第22-23页 |
| 1.1.5 主要实验仪器 | 第23页 |
| 1.2 方法 | 第23-36页 |
| 1.2.1 沙门菌抗菌药物敏感性测定 | 第23-25页 |
| 1.2.2 ATCC13311-GFP重组菌株的构建 | 第25-26页 |
| 1.2.3 沙门菌-线虫定植模型的构建 | 第26-27页 |
| 1.2.4 沙门菌耐药性诱导 | 第27页 |
| 1.2.5 耐药相关基因扩增与测序 | 第27-30页 |
| 1.2.6 RNA测序文库构建 | 第30-34页 |
| 1.2.7 上机测序及数据分析 | 第34页 |
| 1.2.8 差异基因的RT-PCR分析 | 第34-36页 |
| 2 结果 | 第36-47页 |
| 2.1 重组沙门菌ATCC13311-GFP的鉴定及定植鉴定 | 第36-37页 |
| 2.1.1 重组沙门菌ATCC13311-GFP的鉴定 | 第36页 |
| 2.1.2 重组沙门菌ATCC13311-GFP的鉴定 | 第36-37页 |
| 2.2 诱导耐药实验结果及耐药菌MIC测定 | 第37-38页 |
| 2.2.1 菌株诱导耐药实验结果 | 第37页 |
| 2.2.2 耐药菌对常见抗生素的MIC值 | 第37-38页 |
| 2.3 耐药相关基因PCR扩增及测序比对 | 第38-40页 |
| 2.3.1 耐药相关基因PCR扩增鉴定 | 第38-39页 |
| 2.3.2 基因序列比对 | 第39-40页 |
| 2.4 ATCC13311与TW4转录组测序结果 | 第40-47页 |
| 2.4.1 原始测序数据分析 | 第40-41页 |
| 2.4.2 基因功能注释及分类结果 | 第41-43页 |
| 2.4.3 基因表达差异分析 | 第43-44页 |
| 2.4.4 RT-PCR验证实验结果 | 第44-45页 |
| 2.4.5 KEGG代谢途径途径分析及表达差异基因的KEGG富集分析 | 第45页 |
| 2.4.6 耐药相关基因分析 | 第45-47页 |
| 3 讨论 | 第47-50页 |
| 3.1 沙门菌-秀丽隐杆线虫体内诱导模型的建立 | 第47-48页 |
| 3.2 沙门菌的耐药性诱导 | 第48页 |
| 3.3 鼠伤寒沙门菌的转录组测序与分析 | 第48-50页 |
| 4 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 作者简介 | 第60页 |
