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PGC7互作蛋白的鉴定及功能研究

摘要第5-7页
abstract第7-9页
第一章 文献综述第14-41页
    1.1 PGC7的生物学功能研究进展第14-20页
        1.1.1 PGC7蛋白的生物学特性第14页
        1.1.2 PGC7在早期胚胎发育中的作用第14-15页
        1.1.3 PGC7在DNA甲基化调控中的作用第15-18页
        1.1.4 PGC7在染色质调控中的作用第18页
        1.1.5 PGC7在iPS细胞诱导中的作用第18-20页
        1.1.6 PGC7的其他生物学功能第20页
    1.2 印记维持相关母源效应蛋白的功能无序研究第20-39页
        1.2.1 固有无序蛋白简介第20-22页
        1.2.2 PGC7蛋白的功能无序研究第22-27页
        1.2.3 ZFP57蛋白的功能无序研究第27-31页
        1.2.4 TRIM28蛋白的功能无序研究第31-34页
        1.2.5 DNMT1蛋白的功能无序研究第34-37页
        1.2.6 小结与展望第37-39页
    1.3 本研究的内容和意义第39-41页
第二章 PGC7互作蛋白的鉴定与分析第41-87页
    2.1 材料与方法第41-60页
        2.1.1 材料第41页
        2.1.2 主要试剂第41-42页
        2.1.3 主要仪器与耗材第42页
        2.1.4 主要溶液配制第42-45页
        2.1.5 细胞培养与传代第45页
        2.1.6 总RNA提取与反转录第45-46页
        2.1.7 细菌基因组DNA提取第46-47页
        2.1.8 载体构建第47-53页
        2.1.9 细胞转染第53-55页
        2.1.10 免疫印迹(Western Blot, WB)第55-56页
        2.1.11 亲和纯化富集PGC7蛋白复合体第56-57页
        2.1.12 蛋白质质谱鉴定第57-58页
        2.1.13 生物信息学分析第58-59页
        2.1.14 蛋白相互作用网络构建第59页
        2.1.15 蛋白质免疫共沉淀(Co-IP)第59-60页
        2.1.16 免疫荧光染色第60页
    2.2 实验结果第60-82页
        2.2.1 载体构建第60-64页
        2.2.2 生物素化PGC7蛋白的免疫印迹检测第64-65页
        2.2.3 生物素化PGC7蛋白的细胞内分布检测第65-66页
        2.2.4 链霉亲和素-生物素亲和纯化PGC7蛋白复合物第66-67页
        2.2.5 质谱鉴定PGC7蛋白复合物第67-75页
        2.2.6 PGC7互作蛋白的功能注释第75-79页
        2.2.7 蛋白质相互作用网络构建与分析第79-80页
        2.2.8 免疫共沉淀验证PGC7互作蛋白第80-82页
    2.3 讨论第82-86页
    2.4 结论第86-87页
第三章 PGC7与HP1BP3互作的功能研究第87-124页
    3.1 材料与方法第87-99页
        3.1.1 材料第87页
        3.1.2 主要试剂第87-88页
        3.1.3 主要仪器与耗材第88页
        3.1.4 主要溶液配制第88页
        3.1.5 细胞培养第88页
        3.1.6 蛋白质的固有无序和互作网络分析第88-89页
        3.1.7 真核表达载体构建第89-91页
        3.1.8 CRISPR-Cas9敲除Hp1bp3载体构建第91-93页
        3.1.9 蛋白质免疫共沉淀与免疫印迹检测第93-94页
        3.1.10 染色质免疫共沉淀-定量PCR(ChIP-qPCR)第94-96页
        3.1.11 实时荧光定量PCR第96-97页
        3.1.12 免疫荧光染色第97页
        3.1.13 亚硫酸盐处理与测序分析第97-99页
    3.2 实验结果第99-121页
        3.2.1 HP1BP3蛋白的固有无序和互作网络分析第99-101页
        3.2.2 真核表达载体构建第101-103页
        3.2.3 CRISPR-Cas9敲除Hp1bp3载体构建与验证第103-104页
        3.2.4 HP1BP3与PGC7的互作分析第104-107页
        3.2.5 PGC7表达对HP1和HP1BP3互作的影响第107-108页
        3.2.6 HP1表达对PGC7和HP1BP3互作的影响第108-109页
        3.2.7 Hp1bp3基因敲除F9细胞系建立第109-110页
        3.2.8 HP1BP3敲除对印记基因表达及甲基化的影响第110-116页
        3.2.9 PGC7和HP1BP3调控印记基因Gtl2表达及甲基化的机理研究第116-121页
    3.3 讨论第121-123页
    3.4 结论第123-124页
第四章 DMAP1蛋白的功能研究第124-147页
    4.1 材料与方法第124-130页
        4.1.1 材料第124页
        4.1.2 主要试剂第124-125页
        4.1.3 主要仪器与耗材第125页
        4.1.4 主要溶液配制第125页
        4.1.5 细胞培养第125页
        4.1.6 蛋白质的固有无序和互作网络分析第125-126页
        4.1.7 真核表达载体构建第126-127页
        4.1.8 CRISPR-Cas9敲除Dmap1载体构建与验证第127-129页
        4.1.9 DNA甲基化免疫荧光染色第129页
        4.1.10 蛋白质免疫共沉淀与免疫印迹第129-130页
        4.1.11 实时荧光定量PCR第130页
        4.1.12 亚硫酸盐处理与测序分析第130页
    4.2 实验结果第130-143页
        4.2.1 DMAP1蛋白的固有无序与互作网络分析第130-132页
        4.2.2 真核表达载体构建第132-134页
        4.2.3 CRISPR-Cas9敲除Dmap1载体构建与验证第134页
        4.2.4 DMAP1与PGC7的互作验证第134-137页
        4.2.5 PGC7对DMAP1-DNMT1互作的影响第137-138页
        4.2.6 DMAP1调控PGC7与DNMT1的互作第138-141页
        4.2.7 Dmap1基因敲除F9细胞克隆筛选第141页
        4.2.8 DMAP1敲降对F9细胞整体DNA甲基化的影响第141-142页
        4.2.9 DAMP1敲降对印记基因表达的影响第142页
        4.2.10 DAMP1敲降对印记基因甲基化的影响第142-143页
    4.3 讨论第143-146页
    4.4 结论第146-147页
全文结论第147-149页
创新之处和进一步的研究计划第149-150页
参考文献第150-164页
缩略词第164-165页
致谢第165-166页
作者简介第166页

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