| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-41页 |
| 1.1 PGC7的生物学功能研究进展 | 第14-20页 |
| 1.1.1 PGC7蛋白的生物学特性 | 第14页 |
| 1.1.2 PGC7在早期胚胎发育中的作用 | 第14-15页 |
| 1.1.3 PGC7在DNA甲基化调控中的作用 | 第15-18页 |
| 1.1.4 PGC7在染色质调控中的作用 | 第18页 |
| 1.1.5 PGC7在iPS细胞诱导中的作用 | 第18-20页 |
| 1.1.6 PGC7的其他生物学功能 | 第20页 |
| 1.2 印记维持相关母源效应蛋白的功能无序研究 | 第20-39页 |
| 1.2.1 固有无序蛋白简介 | 第20-22页 |
| 1.2.2 PGC7蛋白的功能无序研究 | 第22-27页 |
| 1.2.3 ZFP57蛋白的功能无序研究 | 第27-31页 |
| 1.2.4 TRIM28蛋白的功能无序研究 | 第31-34页 |
| 1.2.5 DNMT1蛋白的功能无序研究 | 第34-37页 |
| 1.2.6 小结与展望 | 第37-39页 |
| 1.3 本研究的内容和意义 | 第39-41页 |
| 第二章 PGC7互作蛋白的鉴定与分析 | 第41-87页 |
| 2.1 材料与方法 | 第41-60页 |
| 2.1.1 材料 | 第41页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第41-42页 |
| 2.1.3 主要仪器与耗材 | 第42页 |
| 2.1.4 主要溶液配制 | 第42-45页 |
| 2.1.5 细胞培养与传代 | 第45页 |
| 2.1.6 总RNA提取与反转录 | 第45-46页 |
| 2.1.7 细菌基因组DNA提取 | 第46-47页 |
| 2.1.8 载体构建 | 第47-53页 |
| 2.1.9 细胞转染 | 第53-55页 |
| 2.1.10 免疫印迹(Western Blot, WB) | 第55-56页 |
| 2.1.11 亲和纯化富集PGC7蛋白复合体 | 第56-57页 |
| 2.1.12 蛋白质质谱鉴定 | 第57-58页 |
| 2.1.13 生物信息学分析 | 第58-59页 |
| 2.1.14 蛋白相互作用网络构建 | 第59页 |
| 2.1.15 蛋白质免疫共沉淀(Co-IP) | 第59-60页 |
| 2.1.16 免疫荧光染色 | 第60页 |
| 2.2 实验结果 | 第60-82页 |
| 2.2.1 载体构建 | 第60-64页 |
| 2.2.2 生物素化PGC7蛋白的免疫印迹检测 | 第64-65页 |
| 2.2.3 生物素化PGC7蛋白的细胞内分布检测 | 第65-66页 |
| 2.2.4 链霉亲和素-生物素亲和纯化PGC7蛋白复合物 | 第66-67页 |
| 2.2.5 质谱鉴定PGC7蛋白复合物 | 第67-75页 |
| 2.2.6 PGC7互作蛋白的功能注释 | 第75-79页 |
| 2.2.7 蛋白质相互作用网络构建与分析 | 第79-80页 |
| 2.2.8 免疫共沉淀验证PGC7互作蛋白 | 第80-82页 |
| 2.3 讨论 | 第82-86页 |
| 2.4 结论 | 第86-87页 |
| 第三章 PGC7与HP1BP3互作的功能研究 | 第87-124页 |
| 3.1 材料与方法 | 第87-99页 |
| 3.1.1 材料 | 第87页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第87-88页 |
| 3.1.3 主要仪器与耗材 | 第88页 |
| 3.1.4 主要溶液配制 | 第88页 |
| 3.1.5 细胞培养 | 第88页 |
| 3.1.6 蛋白质的固有无序和互作网络分析 | 第88-89页 |
| 3.1.7 真核表达载体构建 | 第89-91页 |
| 3.1.8 CRISPR-Cas9敲除Hp1bp3载体构建 | 第91-93页 |
| 3.1.9 蛋白质免疫共沉淀与免疫印迹检测 | 第93-94页 |
| 3.1.10 染色质免疫共沉淀-定量PCR(ChIP-qPCR) | 第94-96页 |
| 3.1.11 实时荧光定量PCR | 第96-97页 |
| 3.1.12 免疫荧光染色 | 第97页 |
| 3.1.13 亚硫酸盐处理与测序分析 | 第97-99页 |
| 3.2 实验结果 | 第99-121页 |
| 3.2.1 HP1BP3蛋白的固有无序和互作网络分析 | 第99-101页 |
| 3.2.2 真核表达载体构建 | 第101-103页 |
| 3.2.3 CRISPR-Cas9敲除Hp1bp3载体构建与验证 | 第103-104页 |
| 3.2.4 HP1BP3与PGC7的互作分析 | 第104-107页 |
| 3.2.5 PGC7表达对HP1和HP1BP3互作的影响 | 第107-108页 |
| 3.2.6 HP1表达对PGC7和HP1BP3互作的影响 | 第108-109页 |
| 3.2.7 Hp1bp3基因敲除F9细胞系建立 | 第109-110页 |
| 3.2.8 HP1BP3敲除对印记基因表达及甲基化的影响 | 第110-116页 |
| 3.2.9 PGC7和HP1BP3调控印记基因Gtl2表达及甲基化的机理研究 | 第116-121页 |
| 3.3 讨论 | 第121-123页 |
| 3.4 结论 | 第123-124页 |
| 第四章 DMAP1蛋白的功能研究 | 第124-147页 |
| 4.1 材料与方法 | 第124-130页 |
| 4.1.1 材料 | 第124页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第124-125页 |
| 4.1.3 主要仪器与耗材 | 第125页 |
| 4.1.4 主要溶液配制 | 第125页 |
| 4.1.5 细胞培养 | 第125页 |
| 4.1.6 蛋白质的固有无序和互作网络分析 | 第125-126页 |
| 4.1.7 真核表达载体构建 | 第126-127页 |
| 4.1.8 CRISPR-Cas9敲除Dmap1载体构建与验证 | 第127-129页 |
| 4.1.9 DNA甲基化免疫荧光染色 | 第129页 |
| 4.1.10 蛋白质免疫共沉淀与免疫印迹 | 第129-130页 |
| 4.1.11 实时荧光定量PCR | 第130页 |
| 4.1.12 亚硫酸盐处理与测序分析 | 第130页 |
| 4.2 实验结果 | 第130-143页 |
| 4.2.1 DMAP1蛋白的固有无序与互作网络分析 | 第130-132页 |
| 4.2.2 真核表达载体构建 | 第132-134页 |
| 4.2.3 CRISPR-Cas9敲除Dmap1载体构建与验证 | 第134页 |
| 4.2.4 DMAP1与PGC7的互作验证 | 第134-137页 |
| 4.2.5 PGC7对DMAP1-DNMT1互作的影响 | 第137-138页 |
| 4.2.6 DMAP1调控PGC7与DNMT1的互作 | 第138-141页 |
| 4.2.7 Dmap1基因敲除F9细胞克隆筛选 | 第141页 |
| 4.2.8 DMAP1敲降对F9细胞整体DNA甲基化的影响 | 第141-142页 |
| 4.2.9 DAMP1敲降对印记基因表达的影响 | 第142页 |
| 4.2.10 DAMP1敲降对印记基因甲基化的影响 | 第142-143页 |
| 4.3 讨论 | 第143-146页 |
| 4.4 结论 | 第146-147页 |
| 全文结论 | 第147-149页 |
| 创新之处和进一步的研究计划 | 第149-150页 |
| 参考文献 | 第150-164页 |
| 缩略词 | 第164-165页 |
| 致谢 | 第165-166页 |
| 作者简介 | 第166页 |