奶牛泌乳早期乳脂肪酸变化及乳腺组织转录调控分析
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 英文缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-17页 |
| 1 奶牛生产周期的划分 | 第11页 |
| 2 不同生产周期奶牛生理特点与营养特性 | 第11-12页 |
| 3 奶牛乳中脂肪酸的组成与代谢 | 第12-15页 |
| 3.1 乳中脂肪酸的组成 | 第12-14页 |
| 3.2 脂肪酸在乳腺内的代谢过程 | 第14-15页 |
| 4 乳腺组织的转录组测序 | 第15-16页 |
| 4.1 转录组技术 | 第15页 |
| 4.2 转录组研究在牛中的应用 | 第15-16页 |
| 5 本研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 第二章 中国荷斯坦奶牛泌乳期脂肪酸变化规律的研究 | 第17-26页 |
| 1 引言 | 第17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-20页 |
| 2.1 材料 | 第17-18页 |
| 2.2 实验方法 | 第18-19页 |
| 2.3 统计方法 | 第19-20页 |
| 3 结果与分析 | 第20-24页 |
| 4 讨论 | 第24-25页 |
| 4.1 原料乳中脂肪酸的种类 | 第24页 |
| 4.2 泌乳期对原料乳脂肪酸组成及比例的影响 | 第24-25页 |
| 本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 中国荷斯坦奶牛乳腺组织转录组分析 | 第26-63页 |
| 1 引言 | 第26页 |
| 2 试验材料 | 第26-27页 |
| 2.1 试验动物和样品采集 | 第26页 |
| 2.2 主要仪器 | 第26-27页 |
| 2.3 主要数据库 | 第27页 |
| 2.4 主要软件 | 第27页 |
| 3 试验步骤 | 第27-31页 |
| 3.1 总RNA的提取 | 第27-28页 |
| 3.2 RNA-Secq样品制备及测序 | 第28-30页 |
| 3.3 实验测序建库流程 | 第30-31页 |
| 4 数据统计方法 | 第31-33页 |
| 4.1 参考序列比对分析 | 第31页 |
| 4.2 基因表达量分析 | 第31-32页 |
| 4.3 差异表达基因筛选 | 第32页 |
| 4.4 基因功能注释分析 | 第32-33页 |
| 5 结果与分析 | 第33-57页 |
| 5.1 总RNA的质量检测 | 第33页 |
| 5.2 测序数据质量评估 | 第33-36页 |
| 5.3 Reads污染检测 | 第36-37页 |
| 5.4 参考序列比对分析 | 第37-39页 |
| 5.5 QC分析 | 第39-42页 |
| 5.6 新转录本预测及基因结构优化 | 第42-44页 |
| 5.7 可变剪切分析 | 第44-45页 |
| 5.8 差异表达基因分析 | 第45-47页 |
| 5.9 基因功能注释分析 | 第47-57页 |
| 6 讨论 | 第57-63页 |
| 6.1 外源脂肪酸摄入相关基因 | 第57页 |
| 6.2 外源胆固醇运输相关基因 | 第57-58页 |
| 6.3 脂肪酸活化相关基因 | 第58页 |
| 6.4 脂肪酸运输相关基因 | 第58-59页 |
| 6.5 脂肪酸从头合成相关基因 | 第59页 |
| 6.6 脂肪酸去饱和相关基因 | 第59-60页 |
| 6.7 甘油三酯合成相关基因 | 第60页 |
| 6.8 脂滴形成相关基因 | 第60-61页 |
| 6.9 乳腺细胞中的调控因子 | 第61-63页 |
| 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 攻读学位期间发表和参与发表的学术论文 | 第70-71页 |
| 附件 | 第71-72页 |
