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奶牛泌乳早期乳脂肪酸变化及乳腺组织转录调控分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
英文缩略词表第10-11页
第一章 文献综述第11-17页
    1 奶牛生产周期的划分第11页
    2 不同生产周期奶牛生理特点与营养特性第11-12页
    3 奶牛乳中脂肪酸的组成与代谢第12-15页
        3.1 乳中脂肪酸的组成第12-14页
        3.2 脂肪酸在乳腺内的代谢过程第14-15页
    4 乳腺组织的转录组测序第15-16页
        4.1 转录组技术第15页
        4.2 转录组研究在牛中的应用第15-16页
    5 本研究目的及意义第16-17页
第二章 中国荷斯坦奶牛泌乳期脂肪酸变化规律的研究第17-26页
    1 引言第17页
    2 材料与方法第17-20页
        2.1 材料第17-18页
        2.2 实验方法第18-19页
        2.3 统计方法第19-20页
    3 结果与分析第20-24页
    4 讨论第24-25页
        4.1 原料乳中脂肪酸的种类第24页
        4.2 泌乳期对原料乳脂肪酸组成及比例的影响第24-25页
    本章小结第25-26页
第三章 中国荷斯坦奶牛乳腺组织转录组分析第26-63页
    1 引言第26页
    2 试验材料第26-27页
        2.1 试验动物和样品采集第26页
        2.2 主要仪器第26-27页
        2.3 主要数据库第27页
        2.4 主要软件第27页
    3 试验步骤第27-31页
        3.1 总RNA的提取第27-28页
        3.2 RNA-Secq样品制备及测序第28-30页
        3.3 实验测序建库流程第30-31页
    4 数据统计方法第31-33页
        4.1 参考序列比对分析第31页
        4.2 基因表达量分析第31-32页
        4.3 差异表达基因筛选第32页
        4.4 基因功能注释分析第32-33页
    5 结果与分析第33-57页
        5.1 总RNA的质量检测第33页
        5.2 测序数据质量评估第33-36页
        5.3 Reads污染检测第36-37页
        5.4 参考序列比对分析第37-39页
        5.5 QC分析第39-42页
        5.6 新转录本预测及基因结构优化第42-44页
        5.7 可变剪切分析第44-45页
        5.8 差异表达基因分析第45-47页
        5.9 基因功能注释分析第47-57页
    6 讨论第57-63页
        6.1 外源脂肪酸摄入相关基因第57页
        6.2 外源胆固醇运输相关基因第57-58页
        6.3 脂肪酸活化相关基因第58页
        6.4 脂肪酸运输相关基因第58-59页
        6.5 脂肪酸从头合成相关基因第59页
        6.6 脂肪酸去饱和相关基因第59-60页
        6.7 甘油三酯合成相关基因第60页
        6.8 脂滴形成相关基因第60-61页
        6.9 乳腺细胞中的调控因子第61-63页
结论第63-64页
参考文献第64-69页
致谢第69-70页
攻读学位期间发表和参与发表的学术论文第70-71页
附件第71-72页

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