| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略词表（ABBREVIATION） | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1 土壤酸化现状及对植物的影响 | 第13-15页 |
| 1.1 土壤酸化现状 | 第13页 |
| 1.2 铝对植物的影响 | 第13-15页 |
| 1.2.1 对根系生长的影响 | 第14页 |
| 1.2.2 诱导产生活性氧簇 | 第14页 |
| 1.2.3 对养分吸收的影响 | 第14-15页 |
| 2 植物耐铝机制 | 第15-20页 |
| 2.1 生理机制 | 第15-17页 |
| 2.1.1 有机酸的分泌 | 第15-16页 |
| 2.1.2 根冠粘液和其他代谢物的产生 | 第16页 |
| 2.1.3 细胞壁结合（固定）铝 | 第16页 |
| 2.1.4 胞内耐铝调控 | 第16-17页 |
| 2.2 分子机制 | 第17-20页 |
| 2.2.1 铝耐受基因 | 第17-18页 |
| 2.2.2 耐铝相关的转录因子 | 第18-20页 |
| 3 高通量测序在植物研究上的应用 | 第20-21页 |
| 3.1 挖掘重金属胁迫相关基因 | 第20页 |
| 3.2 明确次生代谢产物合成代谢通路 | 第20-21页 |
| 4 问题的提出及研究思路 | 第21-23页 |
| 4.1 问题的提出 | 第21页 |
| 4.2 研究思路 | 第21-22页 |
| 4.3 试验路线 | 第22-23页 |
| 第二章 不同茶树基因型根系响应铝诱导及嫩梢铝富集遗传变异 | 第23-33页 |
| 1 引言 | 第23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-25页 |
| 2.1 主要试剂 | 第23-24页 |
| 2.2 主要仪器 | 第24页 |
| 2.3 试验材料 | 第24页 |
| 2.4 试验方法 | 第24-25页 |
| 2.4.1 植物材料制备 | 第24-25页 |
| 2.4.2 根系生物量及嫩梢铝含量测定 | 第25页 |
| 2.4.3 数据处理 | 第25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-32页 |
| 3.1 铝对茶树根系生长的影响 | 第25-30页 |
| 3.2 茶树嫩梢铝富集含量的基因型差异 | 第30-32页 |
| 4 讨论 | 第32页 |
| 5 结论 | 第32-33页 |
| 第三章 茶树实生根幼苗响应不同铝浓度的转录组分析 | 第33-54页 |
| 1 引言 | 第33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第33页 |
| 2.2 试验方法 | 第33-37页 |
| 2.2.1 营养液培养试验 | 第33-34页 |
| 2.2.2 茶苗耐铝临界浓度筛选 | 第34页 |
| 2.2.3 样品处理及RNA提取 | 第34页 |
| 2.2.4 高通量测序及Unigene的组装拼接 | 第34页 |
| 2.2.5 转录本基因功能注释 | 第34-35页 |
| 2.2.6 qPCR验证RNA-seq数据 | 第35-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-51页 |
| 3.1 嘉茗1号响应不同铝浓度的生长势 | 第37-39页 |
| 3.2 转录组测序原始数据 | 第39-40页 |
| 3.3 茶树转录组数据的组装和基因功能注释 | 第40-41页 |
| 3.4 GO注释 | 第41-42页 |
| 3.5 KOG注释 | 第42-43页 |
| 3.6 KEGG注释 | 第43-44页 |
| 3.7 qPCR验证RNA-Seq数据 | 第44页 |
| 3.8 差异基因的聚类分析 | 第44-47页 |
| 3.9 不同铝浓度条件下差异表达基因 | 第47-50页 |
| 3.9.1 转运蛋白基因 | 第47页 |
| 3.9.2 转录因子 | 第47-48页 |
| 3.9.3 氧化和过氧化相关基因 | 第48页 |
| 3.9.4 细胞色素P450基因 | 第48-49页 |
| 3.9.5 泛素标记基因 | 第49页 |
| 3.9.6 有机酸调控基因 | 第49页 |
| 3.9.7 热激蛋白基因 | 第49-50页 |
| 3.10 STOP1/ART1调控的同源基因 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 5 结论 | 第53-54页 |
| 第四章 茶树CsSTOP1基因分析 | 第54-71页 |
| 1 引言 | 第54页 |
| 2 材料与方法 | 第54-60页 |
| 2.1 试验材料 | 第54-57页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第54-55页 |
| 2.1.2 菌株和载体 | 第55-56页 |
| 2.1.3 试剂和试剂盒 | 第56页 |
| 2.1.4 试验引物及PCR扩增 | 第56-57页 |
| 2.2 试验方法 | 第57-60页 |
| 2.2.1 茶树DNA提取（CTAB法） | 第57页 |
| 2.2.2 CsSTOP1生物信息学分析 | 第57页 |
| 2.2.3 载体构建 | 第57-58页 |
| 2.2.4 拟南芥突变体纯合子筛选 | 第58页 |
| 2.2.5 农杆菌电击转化 | 第58-59页 |
| 2.2.6 拟南芥转基因方法 | 第59页 |
| 2.2.7 转基因拟南芥阳性种子的筛选 | 第59页 |
| 2.2.8 拟南芥临界铝浓度筛选 | 第59-60页 |
| 3 结果与分析 | 第60-69页 |
| 3.1 试验过程中凝胶电泳检测结果 | 第60-61页 |
| 3.2 CsSTOP1序列分析 | 第61-67页 |
| 3.3 拟南芥突变体纯合子筛选结果 | 第67-68页 |
| 3.4 转基因拟南芥阳性种子筛选 | 第68页 |
| 3.5 铝对野生型拟南芥的影响 | 第68-69页 |
| 4 讨论 | 第69-70页 |
| 5 结论 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-82页 |
| 附录A | 第82-104页 |
| 附录B | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105页 |