| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-36页 |
| 1 蛋白质感染因子的研究 | 第12-33页 |
| ·蛋白质感染因子(Prions)的定义 | 第13-14页 |
| ·蛋白质感染因子(Prions)的研究背景 | 第14-30页 |
| ·蛋白质感染因子(Prions)的结构研究 | 第15-19页 |
| ·正常蛋白质感染因子蛋白(PrP~C)的功能研究 | 第19-21页 |
| ·蛋白感染因子的致病机理 | 第21-28页 |
| ·蛋白质感染因子性疾病的预防、诊断与治疗 | 第28-30页 |
| ·蛋白质感染因子样的研究 | 第30-31页 |
| ·Prion-like protein, Shadoo prion | 第30页 |
| ·Doppel | 第30-31页 |
| ·鱼类蛋白感染因子的研究进展 | 第31-33页 |
| 2 孔雀鱼的综述 | 第33-35页 |
| ·孔雀鱼的历史 | 第33-34页 |
| ·孔雀鱼的生活习性 | 第34页 |
| ·孔雀鱼的科研价值 | 第34页 |
| ·孔雀鱼基因组的构建 | 第34-35页 |
| 3 鳙鱼、草鱼的综述 | 第35-36页 |
| 第二章 孔雀鱼PRP 基因的克隆与序列分析 | 第36-59页 |
| 1 实验材料 | 第37-38页 |
| ·样本来源 | 第37页 |
| ·主要试剂 | 第37页 |
| ·主要软件 | 第37-38页 |
| 2 实验方法 | 第38-51页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 基因全序列的克隆 | 第38-47页 |
| ·总RNA 的提取及检测 | 第38-39页 |
| ·cDNA 的合成及cDNA PCR 文库的构建 | 第39-42页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 编码基因片段的扩增、回收 | 第42-46页 |
| ·PrP cDNA 的3’RACE 与5’RACE | 第46页 |
| ·序列的拼接 | 第46-47页 |
| ·数据分析 | 第47页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 基因对应的基因组序列的克隆 | 第47-51页 |
| ·DNA 提取 | 第47-48页 |
| ·基因组位移（Genome Walking）文库的构建 | 第48-49页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 基因对应的基因组序列的扩增 | 第49-51页 |
| 3 结果 | 第51-57页 |
| ·总RNA/DNA 提取结果 | 第51-52页 |
| ·孔雀鱼PrP 基因的全序列 | 第52-56页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 的结构分析 | 第56-57页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 的Ⅰ级结构分析 | 第56页 |
| ·孔雀鱼PrP~C 的Ⅱ级结构分析 | 第56-57页 |
| 4 讨论 | 第57-59页 |
| 第三章 鳙鱼、草鱼的PRP 基因的克隆与序列分析 | 第59-76页 |
| 1 实验材料 | 第59-60页 |
| ·样本来源 | 第59页 |
| ·主要试剂 | 第59-60页 |
| ·主要软件 | 第60页 |
| 2 实验方法 | 第60-69页 |
| ·总RNA 的提取及检测 | 第60-61页 |
| ·总RNA 的检测 | 第61页 |
| ·cDNA 的合成及cDNA PCR 文库的构建 | 第61-64页 |
| ·cDNA 第一条链的合成 | 第61-62页 |
| ·cDNA 第二条链的合成及双链cDNA 末端平滑化 | 第62页 |
| ·双链cDNA 的纯化 | 第62-63页 |
| ·连接接头（Cassette adaptor）的连接 | 第63页 |
| ·cDNA PCR 扩增文库构建 | 第63-64页 |
| ·鳙鱼、草鱼PrP~C 编码基因片段的扩增、回收 | 第64-68页 |
| ·引物设计 | 第64页 |
| ·鳙鱼、草鱼PrP~C 编码基因中间片段扩增 | 第64-65页 |
| ·纯化PCR 扩增产物回收 | 第65-66页 |
| ·PCR 产物的连接转化 | 第66-67页 |
| ·重组子的检测与测序 | 第67-68页 |
| ·PrP cDNA 的3’端序列和5’端序列的扩增 | 第68-69页 |
| ·序列的拼接 | 第69页 |
| ·数据分析 | 第69页 |
| 3 实验结果 | 第69-74页 |
| ·RNA 提取结果 | 第69-70页 |
| ·鳙鱼PrP 基因的全序列及其推定蛋白的结构分析 | 第70-72页 |
| ·草鱼PrP 基因的全序列及其推定蛋白的结构分析 | 第72-74页 |
| 4 讨论 | 第74-76页 |
| 第四章 PrP~C基因的表达分析 | 第76-85页 |
| 1 材料与方法 | 第77-81页 |
| ·材料 | 第77页 |
| ·样品处理 | 第77页 |
| ·总RNA 的提取 | 第77-78页 |
| ·逆转录反应 | 第78-79页 |
| ·引物设计 | 第79页 |
| ·PrP~C 基因的表达情况分析 | 第79-80页 |
| ·图像处理 | 第80-81页 |
| 2 结果 | 第81-83页 |
| ·总RNA 的提取 | 第81页 |
| ·组织表达特异性 | 第81-82页 |
| ·不同浓度盐水中，PrP~C 基因的表达特异性 | 第82-83页 |
| 3 讨论 | 第83-85页 |
| 第五章 鱼类PRP 的系统学分析 | 第85-100页 |
| 1 鱼类 PRP，PRION-LIKE PROTEIN 等的研究 | 第85-87页 |
| ·鱼类PrP-1 的分子特征 | 第86页 |
| ·鱼类PrP-2 的分子特征 | 第86页 |
| ·鱼类PrP-like，shadoo 蛋白的分子特征 | 第86-87页 |
| 2 PRP 基因的结构变化与功能 | 第87-91页 |
| ·鱼类、两栖类、爬行类、鸟类及哺乳类PrP 蛋白的结构比较 | 第87-89页 |
| ·鱼类、两栖类、爬行类、鸟类及哺乳类PrP 蛋白重复序列的比较 | 第89-91页 |
| 3 鱼类 PrP~C 的系统学分析 | 第91-94页 |
| 4 哺乳类、鸟类及鱼类的PrP~C 同源性分析 | 第94-97页 |
| 5 讨论 | 第97-100页 |
| 结论 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-112页 |
| 致谢 | 第112-113页 |
| 个人简历与在读期间发表的文章 | 第113页 |
