| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第12-19页 |
| 1.1 鱼类mtDNA的研究 | 第12-14页 |
| 1.2 金枪鱼类的简介及研究概况 | 第14-17页 |
| 1.2.1 金枪鱼类的简介 | 第14-17页 |
| 1.2.2 金枪鱼类的研究概况 | 第17页 |
| 1.3 鲣的资源状况及研究概况 | 第17-18页 |
| 1.3.1 鲣的资源状况 | 第17页 |
| 1.3.2 鲣的研究概况 | 第17-18页 |
| 1.4 研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 鲣的遗传多样性研究：线粒体Cytb基因分析 | 第19-42页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-24页 |
| 2.1.1 实验试剂和仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.2 实验样本的采集与保存 | 第20-22页 |
| 2.1.3 总DNA提取 | 第22页 |
| 2.1.4 线粒体Cytb基因扩增及测序 | 第22-23页 |
| 2.1.5 序列的校正、拼接及提交 | 第23页 |
| 2.1.6 序列分析 | 第23-24页 |
| 2.2 实验结果 | 第24-40页 |
| 2.2.1 总DNA的提取 | 第24页 |
| 2.2.2 PCR扩增 | 第24-25页 |
| 2.2.3 序列登录号 | 第25页 |
| 2.2.4 Cytb基因序列的特征分析 | 第25-34页 |
| 2.2.5 遗传距离及系统进化分析 | 第34-36页 |
| 2.2.6 种群遗传多样性、中性检验及h-S曲线的拟合 | 第36-38页 |
| 2.2.7 鲣种群历史 | 第38-40页 |
| 2.3 讨论 | 第40-42页 |
| 2.3.1 遗传多样性 | 第40页 |
| 2.3.2 种群结构及分化 | 第40-41页 |
| 2.3.3 碱基关联 | 第41-42页 |
| 第三章 鲣的遗传多样性研究：线粒体D-loop区序列分析 | 第42-60页 |
| 3.1 材料与方法 | 第42-43页 |
| 3.1.1 实验试剂和仪器 | 第42页 |
| 3.1.2 样品采集及保存 | 第42页 |
| 3.1.3 总DNA提取 | 第42页 |
| 3.1.4 线粒体控制区序列扩增和测序 | 第42页 |
| 3.1.5 校正、拼接、提交序列 | 第42-43页 |
| 3.1.6 序列分析 | 第43页 |
| 3.2 实验结果 | 第43-58页 |
| 3.2.1 总DNA的提取 | 第43页 |
| 3.2.2 PCR扩增 | 第43页 |
| 3.2.3 序列提交 | 第43-44页 |
| 3.2.4 序列特征分析 | 第44-52页 |
| 3.2.5 基于鲣线粒体控制区序列的遗传距离及系统进化分析 | 第52-54页 |
| 3.2.6 种群遗传多样性和h-S曲线的拟合 | 第54-56页 |
| 3.2.7 鲣种群历史 | 第56-58页 |
| 3.3 讨论 | 第58-60页 |
| 3.3.1 遗传多样性 | 第58-59页 |
| 3.3.2 控制区和Cytb基因序列 | 第59-60页 |
| 第四章 长鳍金枪鱼线粒体全基因组序列的测定和结构分析 | 第60-73页 |
| 4.1 材料和方法 | 第60-63页 |
| 4.1.1 实验试剂和仪器 | 第60页 |
| 4.1.2 样品采集及保存 | 第60页 |
| 4.1.3 总DNA提取 | 第60-61页 |
| 4.1.4 引物的设计 | 第61页 |
| 4.1.5 PCR扩增及测序 | 第61-63页 |
| 4.1.6 序列拼接 | 第63页 |
| 4.1.7 mtDNA全序列的结构分析及序列提交 | 第63页 |
| 4.2 结果与分析 | 第63-71页 |
| 4.2.1 PCR结果 | 第63-64页 |
| 4.2.2 基因组结构 | 第64-66页 |
| 4.2.3 碱基组成特点 | 第66-70页 |
| 4.2.4 蛋白质或亚基编码基因 | 第70页 |
| 4.2.5 序列差异分析 | 第70-71页 |
| 4.3 讨论 | 第71-73页 |
| 第五章 基于线粒体全基因组序列对金枪鱼类系统进化的研究 | 第73-83页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第73-78页 |
| 5.1.1 样本的采集及保存 | 第73-74页 |
| 5.1.2 实验试剂和仪器 | 第74页 |
| 5.1.3 总DNA提取 | 第74页 |
| 5.1.4 设计引物 | 第74-76页 |
| 5.1.5 PCR扩增和测序 | 第76-77页 |
| 5.1.6 实验数据的处理 | 第77-78页 |
| 5.2 结果与分析 | 第78-82页 |
| 5.2.1 总DNA提取 | 第78页 |
| 5.2.2 碱基组成 | 第78-79页 |
| 5.2.3 金枪鱼族鱼类系统进化分析 | 第79-82页 |
| 5.3 讨论 | 第82-83页 |
| 5.3.1 高G+C含量可能与栖息生活状态有关 | 第82页 |
| 5.3.2 金枪鱼类系统分类关系 | 第82-83页 |
| 小结 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-93页 |
| 附录 | 第93-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
