印度谷螟转录组分析及Bt毒素相关基因的鉴定
摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 文献综述 | 第11-18页 |
1.1 转基因作物发展现状 | 第11-13页 |
1.1.1 转基因水稻研究现状 | 第11-12页 |
1.1.2 转基因抗虫水稻 | 第12页 |
1.1.3 其他转基因作物 | 第12-13页 |
1.2 印度谷螟研究进展 | 第13-14页 |
1.2.1 温度、湿度对印度谷螟生长发育的影响 | 第13页 |
1.2.2 Bt蛋白对印度谷螟影响 | 第13-14页 |
1.3 Bt蛋白的抗虫性研究进展 | 第14-16页 |
1.3.1 Bt蛋白受体研究 | 第14-16页 |
1.3.2 展望 | 第16页 |
1.4 高通量测序技术 | 第16-18页 |
1.4.1 高通量测序平台 | 第16页 |
1.4.2 测序结果组装 | 第16-17页 |
1.4.3 高通量测序的应用 | 第17-18页 |
第二章 印度谷螟转录组分析 | 第18-31页 |
2.1 材料与方法 | 第18-21页 |
2.1.1 供试昆虫 | 第18页 |
2.1.2 试剂与仪器 | 第18-19页 |
2.1.3 印度谷螟RNA提取 | 第19-20页 |
2.1.4 转录组测序 | 第20-21页 |
2.2 序列分析流程 | 第21-23页 |
2.2.1 原始数据 | 第21-22页 |
2.2.2 数据过滤 | 第22-23页 |
2.3 结果与分析 | 第23-29页 |
2.3.1 印度谷螟不同发育阶段RNA提取质量 | 第23页 |
2.3.2 测序及组装结果 | 第23-25页 |
2.3.3 Unigene功能注释与COG分类 | 第25-27页 |
2.3.4 KEGG注释与Pathway分析 | 第27-29页 |
2.4 讨论 | 第29页 |
2.5 结论 | 第29-31页 |
第三章 印度谷螟不同发育阶段基因表达谱分析 | 第31-40页 |
3.1 材料与方法 | 第31-32页 |
3.1.1 供试昆虫 | 第31页 |
3.1.2 试剂与仪器 | 第31页 |
3.1.3 印度谷螟不同发育阶段RNA提取 | 第31页 |
3.1.4 基因表达谱测序 | 第31-32页 |
3.2 结果与分析 | 第32-38页 |
3.2.1 测序质量统计 | 第32-33页 |
3.2.2 不同发育阶段印度谷螟基因表达分析 | 第33-36页 |
3.2.3 解毒代谢基因在不同发育阶段的分布 | 第36-38页 |
3.3 讨论 | 第38-39页 |
3.4 结论 | 第39-40页 |
第四章 Bt毒蛋白受体基因鉴定 | 第40-49页 |
4.1 材料与方法 | 第40-42页 |
4.1.1 目的基因的筛选 | 第40页 |
4.1.2 基因序列分析 | 第40页 |
4.1.3 受体基因表达分析 | 第40-42页 |
4.2 结果与分析 | 第42-47页 |
4.2.1 氨肽酶N | 第42-45页 |
4.2.2 钙粘蛋白与碱性磷酸酶 | 第45-46页 |
4.2.3 受体基因表达水平 | 第46-47页 |
4.3 讨论 | 第47-48页 |
4.4 结论 | 第48-49页 |
第五章 印度谷螟内参基因稳定性评价 | 第49-58页 |
5.1 材料与方法 | 第49-51页 |
5.1.1 供试昆虫 | 第49页 |
5.1.2 试验方法 | 第49-51页 |
5.2 结果与分析 | 第51-56页 |
5.2.1 引物扩增效率与候选内参表达水平 | 第51-52页 |
5.2.2 基因稳定化分析 | 第52-55页 |
5.2.4 内参基因稳定性验证 | 第55-56页 |
5.3 讨论 | 第56页 |
5.4 结论 | 第56-58页 |
第六章 印度谷螟微卫星位点分析 | 第58-66页 |
6.1 材料与方法 | 第58-59页 |
6.1.1 微卫星序列筛选 | 第58页 |
6.1.2 印度谷螟DNA提取 | 第58-59页 |
6.1.3 SSR引物设计、及PCR扩增 | 第59页 |
6.2 结果与分析 | 第59-64页 |
6.2.1 微卫星数量及分布特征 | 第59-61页 |
6.2.2 微卫星长度分布特征 | 第61页 |
6.2.3 微卫星在转录组编码区分布特征 | 第61-62页 |
6.2.4 微卫星引物设计与PCR扩增 | 第62-64页 |
6.3 讨论 | 第64-65页 |
6.4 结论 | 第65-66页 |
第七章 主要研究结论与展望 | 第66-69页 |
7.1 主要结论 | 第66-68页 |
7.1.1 印度谷螟转录组分析 | 第66页 |
7.1.2 印度谷螟不同发育阶段数字表达谱分析 | 第66-67页 |
7.1.3 Bt毒蛋白受体基因的鉴定 | 第67页 |
7.1.4 印度谷螟内参基因稳定性评价 | 第67页 |
7.1.5 印度谷螟微卫星位点分析 | 第67-68页 |
7.2 展望 | 第68-69页 |
参考文献 | 第69-74页 |
致谢 | 第74-75页 |
攻读硕士期间发表论文情况 | 第75页 |