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耐热对硝基苯酚磷酸酶的晶体结构及其热稳定机制的研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
1 前言第11-14页
2 实验材料与试剂第14-22页
    2.1 实验材料第14页
    2.2 主要试剂、酶类第14-16页
    2.3 菌株和质粒第16页
    2.4 主要试剂配制第16-19页
    2.5 主要仪器设备第19-20页
    2.6 计算机软件及数据库第20-22页
3 实验方法第22-32页
    3.1    Bs-TpNPPase的序列分析第22页
        3.1.1 Bs-TpNPPase 的序列分析第22页
        3.1.2 制备大肠杆菌感受态细胞第22页
    3.2 Bs-TpNPPase融合蛋白的表达与纯化第22-24页
        3.2.1 Bs-TpNPPase融合蛋白的表达第22页
        3.2.2 Bs-TpNPPase融合蛋白的纯化第22-23页
        3.2.3 SDS聚丙烯酰胺凝胶配制方法第23页
        3.2.4 超滤操作方法第23页
        3.2.5 纯化蛋白溶液浓度的测定第23-24页
    3.3 Bs-TpNPPase的磷酸酶活性测定第24-25页
        3.3.1    Bs-TpNPPase最适反应温度和测定第24页
        3.3.2    Bs-TpNPPase的热稳定性测定第24页
        3.3.3 Bs-TpNPPasepH稳定性测定第24-25页
    3.4 结晶Bs-TpNPPase的表达纯化第25页
    3.5 Bs-TpNPPase蛋白结晶条件的筛选和优化第25页
        3.5.1 Bs-TpNPPase蛋白结晶条件的筛选第25页
        3.5.2 Bs-TpNPPase蛋白结晶条件的优化第25页
    3.6 衍射数据收集和结构解析第25-26页
        3.6.1 防冻剂筛选第25-26页
        3.6.2 X-射线衍射数据的收集第26页
        3.6.3 Bs-TpNPPase的结构解析第26页
    3.7 Bs-TpNPPase的随机突变和定向进化第26-32页
        3.7.1 随机突变易错PCR第26-27页
        3.7.2 随机突变文库的构建和热稳定升高突变体的筛选第27-30页
        3.7.3 突变体的表达纯化第30页
        3.7.4 突变体的酶活力测定第30页
        3.7.5 突变体的酶学性质第30-31页
        3.7.6 结晶用突变体Bs-TpNPPase的表达纯化第31页
        3.7.7 突变体Bs-TpNPPase蛋白的结晶条件的筛选和优化第31页
        3.7.8 突变体Bs-TpNPPase蛋白衍射数据收集和结构解析第31-32页
4 结果和讨论第32-102页
    4.1 Bs-TpNPPase的表达纯化与活性检测第32-37页
        4.1.1 Bs-TpNPPase的序列分析第32-33页
        4.1.2 Bs-TpNPPase的表达纯化第33-34页
        4.1.3 Bs-TpNPPase的活性测定第34-37页
    4.2 Bs-TpNPPase的结构解析第37-46页
        4.2.1 Bs-TpNPPase的晶体制备第37-40页
        4.2.2 衍射数据收集第40-41页
        4.2.3 野生型Bs-TpNPPase的晶体结构解析第41-42页
        4.2.4 Bs-TpNPPase模型质量分析第42-46页
    4.3 Bs-TpNPPase的结构分析第46-73页
        4.3.1 Bs-TpNPPase的晶体结构分析第46-53页
        4.3.2 Bs-TpNPPase催化机制的分析第53-59页
        4.3.3 Bs-TpNPPase耐热机制分析第59-73页
    4.4 Bs-TpNPPase热稳定性的定向进化第73-91页
        4.4.1 筛选热稳定性增强的Bs-TpNPPase突变体第73-74页
        4.4.2 突变体的活性检测第74-91页
    4.5 A150V、A150V/F157L突变体Bs-TpNPPase的结构解析第91-102页
        4.5.1 A150V、A150V/F157L突变体Bs-TpNPPase的晶体制备第91-95页
        4.5.2 衍射数据收集第95页
        4.5.3 A150V、A150V/F157L突变体Bs-TpNPPase晶体结构解析第95-96页
        4.5.4 A150V、A150V/F157L突变体晶体结构质量分析第96-99页
        4.5.5 A150V、A150V/F157L突变体与野生型Bs-TpNPPase的蛋白分子内相互作用及空间结构对比第99-102页
总结第102-103页
展望第103-104页
综述第104-111页
参考文献第111-120页
致谢第120-121页

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